Leta i den här bloggen

söndag 1 mars 2020

SARS2-SWISS model

https://swissmodel.expasy.org/repository/species/2697049
Löysin hyvän mallin SARS viruksen työkaluproteiineista eli nonstrukturelleista proteiineista ja rakenneproteiineista . Proteiinien aminohappokoot ja malli kuvana oli nähtävissä selkä selitys tunnetuista funktioista.
Tällainen luettelo on hyödyksi jos seuraa rokotekehittelyuutisia ja muuta tätä virusta käsittelevää erityistietoa.  Voi vain sanoa että   SARS2 on kuin " menossa Marsiin" , niin hyvät työkalut sillä on mukanaan. Virusemo ajattelee tulevia sukupolvia  huolella.Viruksen perspektiivistä ihmiskunta on  erinomainen resurssi.

 Tässä on tietoa   ORF3 sekvenssistä.

 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/YP_009724391.1

ORF3a , 275 aminohappoa

 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/1796318599

  ORF8,   121 aminohappoa

  https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/1800242647

ORF10 ,  38 aminohappoa 

( ei sisällä lysiiniä (k), ei sis. histidiiniä (h) ei sisällä  glutamiinihappoa (e) , ei sisällä tryptofaania (w).
 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/YP_009725255.1

ORF7b , 43 aminohappoa

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/YP_009725296.1
 
Asetan nämä kaikki aminohapporakenteet erikseen näkyviin
järjestys orfeilla ja rakenneproteiineilla sekä lisäproteiineilla
ORF1a/ORF1ab,S,ORF3a,E,M,ORF6,ORF7a,ORF7b, ORF8,N,ORF10.
ORF1a/1ab antavat 15 tai 16 nsps nonstruktuuriproteiinia. En tiedä jos 
 SARS CoV:n  proteiini 11 on myös COVID-19 viruksella.  

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar