Leta i den här bloggen

söndag 8 mars 2020

COVID-19, nsp2

COVID 19,nsp2  (181..818)
 181 aytryvdnnf cgpdgyplec ikdllaragk asctlseqld fidtkrgvyc creheheiaw
      241 yterseksye lqtpfeikla kkfdtfngec pnfvfplnsi iktiqprvek kkldgfmgri
      301 rsvypvaspn ecnqmclstl mkcdhcgets wqtgdfvkat cefcgtenlt kegattcgyl
      361 pqnavvkiyc pachnsevgp ehslaeyhne sglktilrkg grtiafggcv fsyvgchnkc
      421 aywvprasan igcnhtgvvg egseglndnl leilqkekvn inivgdfkln eeiaiilasf
      481 sastsafvet vkgldykafk qivescgnfk vtkgkakkga wnigeqksil splyafasea
      541 arvvrsifsr tletaqnsvr vlqkaaitil dgisqyslrl idammftsdl atnnlvvmay
      601 itggvvqlts qwltnifgtv yeklkpvldw leekfkegve flrdgweivk fistcaceiv
      661 ggqivtcake ikesvqtffk lvnkflalca dsiiiggakl kalnlgetfv thskglyrkc
      721 vksreetgll mplkapkeii flegetlpte vlteevvlkt gdlqpleqpt seaveaplvg
      781 tpvcinglml leikdtekyc alapnmmvtn ntftlkgg
 
Suomalainen  sekvenssi: 
 
 181 aytryvdnnf cgpdgyplec ikdllaragk asctlseqld fidtkrgvyc creheheiaw
      241 yterseksye lqtpfeikla kkfdtfngec pnfvfplnsi iktiqprvek kkldgfmgri
      301 rsvypvaspn ecnqmclstl mkcdhcgets wqtgdfvkat cefcgtenlt kegattcgyl
      361 pqnavvkiyc pachnsevgp ehslaeyhne sglktilrkg grtiafggcv fsyvgchnkc
      421 aywvprasan igcnhtgvvg egseglndnl leilqkekvn inivgdfkln eeiaiilasf
      481 sastsafvet vkgldykafk qivescgnfk vtkgkakkga wnigeqksil splyafasea
      541 arvvrsifsr tletaqnsvr vlqkaaitil dgisqyslrl idammftsdl atnnlvvmay
      601 itggvvqlts qwltnifgtv yeklkpvldw leekfkegve flrdgweivk fistcaceiv
      661 ggqivtcake ikesvqtffk lvnkflalca dsiiiggakl kalnlgetfv thskglyrkc
      721 vksreetgll mplkapkeii flegetlpte vlteevvlkt gdlqpleqpt seaveaplvg
      781 tpvcinglml leikdtekyc alapnmmvtn ntftlkgg

Näillä  Hesan ja Kiinan  sekvensseillä on samat aminohapot 181- 818.
Vaikuttaa olevan suspektia  sinkki finger rakennetta alkuosassa. Sen takia painotan mustalla c ja h. Näkyy myös loppupäässä  tumareseptorimotiivi LLxxL

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar