SARS-viruksen N proteiini johtaa keuhkoepiteelivaurioon , joka sittemmin voi johtaa keuhkofibroosiin

Suurin osa, 80% toipunee SARS-kaltaisesta  nykyinfektiosta- kertoo uutiset Kiinasta-   kohtalaisen lievin oirein. Kuitenkin vakavia  mainitaan olevan  ainakin 20% erään tiedon mukaan. Kuolleisuuttatkin on, mutta sen osuutta ei vielä voi  tarkentaa,  ei kuitenkaan  kovin  katastrofaalinen ja yleensä  vain niillä, joilla on muitakin tauteja . Päivittäinen kuolleisuus ilmoitetaan  kymmenissä henkilöissä.
Vaikutaa siltä, että  SARS infektio aiemmin , vaikka olisi ollut lievä, saattoi  jättää jälkeensä  keuhkoepiteelin korjaantumisen huononemaa  monista molekulaarisesti selitettävistä  syistä-  ja minun mielestäni  jälkihoito ja keuhkofunktion tarkistus  joitain aikoja toipumisen akuutin  jälkeenkin  olisi aiheellinen. Ehkä  jokin kortisonipitoinen  astmalääkkeen tapainen jatkohoito saattaisi   antaa epiteelille aikaa korjausmekanismeihin ja rauhoittaisi  kiihtyneitä proteolyyttisiä järjestelmiä ja  kollageenien muodostusta, ettei hengittävä pinta muutu  dysfunktionaaliseksi.

 https://books.google.se/books?id=ZEu4hd6YH2sC&pg=PA249&lpg=PA249&dq=MMPs+,+SARS-CoV&source=bl&ots=wDFcD592XO&sig=ACfU3U2ZNEkI6L3VMZQLgegpwRtVFIAYCQ&hl=sv&sa=X&ved=2ahUKEwj82uS-3aznAhVT4KYKHfrSAq4Q6AEwBnoECAcQAQ#v=onepage&q=MMPs%20%2C%20SARS-CoV&f=false


 Hakusana (MMPS, SARS CoV) . Viite kirjasta, josta linkki on   kovin pitkä litania kirjaimia

Molecular Biology of the SARS-Coronavirus

redigerad av Sunil K. Lal

NIDOVIRALES Coronaviruksista vuonna 2013. MERS- CoV mainitaan

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=MERS-CoV+reservoir+host

 Vaikeaa  (S, severe) akuuttia (A, acute)   hengitystieoireyhtymää (R, respiratory , S, syndrome  aiheuttavaa koronavirusta (SARS CoV)  on jäljitetty tarkasti.  SARS-taapusten jälkeen  on viime aikoina ollut huomionkohteena toinen koronaviruskin:  Keski-Idässä (M, Middle, E, East)  on ilmennyt myös erästä  tällainen vaikeamuotoinen  hengitystieoireyhtymää  aiheuttavaa koronavirustulehdusta  ja sillä on nimi: MERS- COV: 

LÄHDE:

J Thorac Dis. 2013 Aug;5(Suppl 2):S118-21. doi: 10.3978/j.issn.2072-1439.2013.06.19. Tracing the SARS-coronavirus. Chan PK, Chan MC. SourceDepartment of Microbiology, The Chinese University of Hong Kong, Prince of Wales Hospital, Shatin, New Territories, Hong Kong Special Administrative Region, People's Republic of China.

TIIVISTELMÄ (Abstract)

•  Ihmisisä esiintyy neljä endeemistä coronavirusta  ja ne ovat liittyneet lieviin  hengitystieinfektioihin. (Eihän ennen SARS- virusta  osattu edes odotaa coronaviruksista mitään vaaraa!) 

 Endeemiset coronavirukset ovat 
HCoV-229E
HCoV-OC43
HCoV-NL63
HCoV-HKU1
Vakavaa hengitystieoireyhtymää aiheuttavat coronavirukset ovat:
SARS-CoV
MERS-CoV

Four coronaviruses (HCoV-229E, HCoV-OC43, HCoV-NL63, HCoV-HKU1) are endemic in humans and mainly associated with mild respiratory illnesses; whereas the other two coronaviruses [Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus (SARS-CoV) and Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus (MERS-CoV)] present as emerging infections causing severe respiratory syndrome.

•  CORONAVIRUKSET  tekevät evoluutiota  keräämällä pistemutaatioita ja rekombinoimalla genomista materiaansa  eri kantojen tai eri lajien kesken.

 Coronaviruses evolve by accumulation of point mutations and recombination of genomes among different strains or species.

• Nisäkkäiten coronavirukset mukaan lukien ihmisen coronavirukset ovat  aikojen kuluessa evoloituneet lepakoiten coronaviruksista käsin.

Mammalian coronaviruses including those infect humans are evolved from bat coronaviruses. 

•  Mitä tulee näihin  ihmiskunnalle uusiin viruksiin  SARS-CoV ja MERS-CoV,  ne ovat geneettisesti lähisukulaisia  lepakon coronavirusten kanssa, mutta  lepakkovirusten käyttämät  väli-isännät , osallistuvat todennäköisesti  virusinfektion  vahventamiseen ja  laajentamiseen  ja taudinvälittymiseen yli lajirajan.

While SARS-CoV and MERS-CoV are genetically closely related to bat coronaviruses, intermediate host(s) is (are) likely to be involved in the emergence and cross-species transmission of these novel human viruses. 

•  Naamapalmusivettiilajista  ja  supikoirasta ruokatoreilta kerätyt näytteet ovat osoittaneet o niissä  suurta SARS-in kaltaisten virusten esiintymää   samoihin aikoihin kun ihmisillä  puhkeaa  SARS- tautia.  Mutta nämä eläimet  ovat pikemminkin  vaäliaikaisia satunnaisia isäntiä  kuin pinttyneitä reservoaareja.  . On tarvetta lisätutkimuksiin  coronavirusekologian  selvittämiseksi . Olisi tärkeää pitää valppaasti silmällä coronaviruksista ilmaantuvia  uusia viruksia, jotta  ne  tulisivat heti tunnistetuiksi. 

High prevalence of SARS-like coronaviruses have been found from masked palm civet cats and raccoon dogs collected from markets around the time of outbreaks in humans, but these animals are likely to be a transient accidental host rather than a persisting reservoir. More research is needed to elucidate the ecology of coronaviruses. Vigilance and surveillance should be maintained to promptly identify newly emerged coronaviruses.

Avainsanat, KEYWORDS:

Severe acute respiratory syndrome (SARS), animal reservoir, coronaviruses (CoV), evolution

NIDOVIRALES: Yllättävä pandeminen virus Coronaviruksista oli SARS-CoV 2003-2004

http://en.wikipedia.org/wiki/SARS_coronavirus

Wang L-E, Eaton BT. Bats, Civets and the Emergence  of SARS.
In: Wildlife and Emerging Zoonotic Disease: The Biology, Circumstances and Consequences of Cross-Species Transmission. 2007. Springer ISBN 978-3-540-70961-9

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17848070

Alkuperäinen reservoaari ( Hr) löytyi lepakoista. BAT = lepakko; fladdermus.

Väliisäntänä, jossa infektio vahvistui, toimi  muutama eläin kuten  eräs sivettilaji jasupikoira.

Masked  Palm Civet,  Paguma larvata  Tämä on  sivettilaji. naamiopalmusivetti  ja sitä kasvatetaan farmeilla ja farmeilta viedään markkinoille lihaeläimenä. kauko-idässä, varsinkin E- Kiianssa.
http://en.wikipedia.org/wiki/Paguma_larvata
Ruotsalainen nimi on maskpalmmård.  Entinen suomalainen nimi oli naamaripalmunäätä.

Raccoon dog, Nyctereutes procyonoides  Tämä on suomeksi supikoira ja ruotsiksi mårdhund.
 http://en.wikipedia.org/wiki/Raccoon_dog

Näitä eläimia tuotiin markkinoille ja  henkilöt jotka olivat ammateissa, missä käsiteltiin  myytävää eläintä  tai näitten eäinten ruhoja,  saivat kontaktitartuntoja.   Tartunnalle  alttiiita eläimiä havaittiin tositakymmentä kuten rhesus apinat, makit,  afrikan vihreät apinat, kissat , ferretit, hiiret, jopa possu, hamsterit, marsut.

Alkuperäksi kuitenkin osoittautui lepakkolajit,  "hevosenkenkänokkainen" lepakko, hästskonäsan,  Horseshoe bat.
Esim. Kiinan  horseshoe bat, genus Rhinolopus sinicus , perhe Rhinolophidae, kantoi 39%:ssa  yksilöitä   geneettistä materiaalia, joka oli SARS-CoV kaltaista.  useita lepakkolajeja on tutkittu.  lepakoiten genomissa on  S- geenissä eräs 29nt- sekvenssi, joka deletoituu  viruksen adaptoituessa väli-isännissä  ja muuttuessa sitten myöhemmin helpommin ihmisestä toiseen siirtyväksi.

Lepakoita on hyvin paljon ja ne ovat monen viruksen reservoaari.Sitäpaitsi niitäkytetään kaukoidässä myös ravintona, jolloin pelkkä lepakon pyynti altista  lepakkoviruksille.  osa lepakoista on hedelmänsyöiä, joten virsuta voi tulla niiten puremista hedelmistäkin. 
 https://www.google.se/#q=roasted+bat

Ensimmäinen SARS purkauma oli  2002- 2003. Virus oli silloin hyvin patogeeninen
Toinen isompi purkautuma taopahtui 2003- 2004.

Vuonna  2003 identifioitiin SARS CoV reseptori ihmisessä. Se on metallopeptidaasi, angiotensiiniä konvertoiva entsyymi ACE2. Viruksen S- proteiini kiinnittyy  hanakasti ACE2 entsyymiin ihmislellä ja sivettieläimellä.

Ihmisestä ihmiseen tapahtunut tartunta 2003- 2004 oli tavattoman nopeaa. eräs  SARS CoV:lla infektoitunut lääkäri matkusti Kiinasta Hong Kongiin konferenssiin. Näin . yhdestä henkilöstä virus sitten levisi koko maailmaan   SSE tapauksina, superspeeding events, super nopeina leviämisinä-  hotellit, sairaalat ja lentomatkat  olivat osa tekijöitä nopeuttamassa  niin että  alle viidessä kuukaudessa oli ihmisestä toisen siirtyvää tautia jo 30 eri maassa  kaikissa viidessa manneralueessa. Raportoituja tapauksia tuli 8098 ja menehtyneitä oli 774 heinäkuun  2003 loppuun mennessä.  Toimenpitet olivat radikaalit  tartunnan leviämisen tyrehdyttämiseksi. kauta maailman.
WHO antaa tästä enemmän tietoa:

 http://www.who.int/topics/sars/en/

SMI.se antaa yleistietoa taavllisista coronaviruksista ja mainitsee artikkelissa myös SARS-CoV ja MERS- CoV.
http://www.smi.se/sjukdomar/coronavirus/