Leta i den här bloggen

Visar inlägg med etikett Erään variantin spikeproteiinin intravirionaalisessa osassa havaittu aaminohappoinsertio.. Visa alla inlägg
Visar inlägg med etikett Erään variantin spikeproteiinin intravirionaalisessa osassa havaittu aaminohappoinsertio.. Visa alla inlägg

torsdag 22 september 2022

Eräs BA.5.1 variantti omaa insertion spikeproteiinin intraviraalisti sijainneessa (spike-häntä)osassa.

 Spikeproteiinin se osa, joka on virionin sisäpuolella on hyvin cysteiinipitoista ja tietysti  kerää sinkkiä, joka stabiloi struktuureja. Tähän cysteiinien joukkoon on lisäytynyt  yksi kysteiini (koodi: Cys, C) aminohappo kohtaan  1264; Kysteiiniaminohappolisän  aiheuttaa   kolmen nukleotidin (TGC) insertio 

https://github.com/cov-lineages/pango-designation/issues/991

"Proposal for a sublineage of BA.5.1
Earliest sequence: 2022-07-11 (France)
Countries detected: France, Belgium, Israel, Denmark

Defining mutation:
G16975A = ORF1b:V1170I
ins25300:TGC = S:1246:C

Subvariant is defined by an insertion in the cytoplasmic tail of spike (ins25300:TGC = S:1246:C) as well as ORF1b:V1170I