Leta i den här bloggen

torsdag 22 september 2022

Eräs BA.5.1 variantti omaa insertion spikeproteiinin intraviraalisti sijainneessa (spike-häntä)osassa.

 Spikeproteiinin se osa, joka on virionin sisäpuolella on hyvin cysteiinipitoista ja tietysti  kerää sinkkiä, joka stabiloi struktuureja. Tähän cysteiinien joukkoon on lisäytynyt  yksi kysteiini (koodi: Cys, C) aminohappo kohtaan  1264; Kysteiiniaminohappolisän  aiheuttaa   kolmen nukleotidin (TGC) insertio 

https://github.com/cov-lineages/pango-designation/issues/991

"Proposal for a sublineage of BA.5.1
Earliest sequence: 2022-07-11 (France)
Countries detected: France, Belgium, Israel, Denmark

Defining mutation:
G16975A = ORF1b:V1170I
ins25300:TGC = S:1246:C

Subvariant is defined by an insertion in the cytoplasmic tail of spike (ins25300:TGC = S:1246:C) as well as ORF1b:V1170I

 

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar