ORF10 (29558..29674), COVID-19, jokin pieni lisäproteiini ORF10 proteiini

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/43740576

ORF10 ORF10 protein [ Wuhan seafood market pneumonia virus ]

Gene ID: 43740576, updated on 28-Jan-2020

Gene symbol

ORF10

Gene description

ORF10 protein

Locus tag

GU280_gp11

Gene type

protein coding

RefSeq status

PROVISIONAL

Organism

Wuhan seafood market pneumonia virus (isolate: Wuhan-Hu-1, nat-host: Homo sapiens)

Lineage

Viruses; Riboviria; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus; unclassified Betacoronavirus

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/YP_009725255.1 

FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..38
                     /organism="Severe acute respiratory syndrome coronavirus
                     2"
                     /isolate="Wuhan-Hu-1"
                     /host="Homo sapiens"
                     /db_xref="taxon:2697049"
                     /country="China"
                     /collection_date="Dec-2019"
     Protein         1..38
                     /product="ORF10 protein"
                     /calculated_mol_wt=4318
     CDS             1..38
                     /gene="ORF10"
                     /locus_tag="GU280_gp11"
                     /coded_by="NC_045512.2:29558..29674"
                     /db_xref="GeneID:43740576"
ORIGIN      
        1 mgyinvfafp ftiyslllcr mnsrnyiaqv dvvnfnlt
//

   gene            29558..29674
                     /gene="ORF10"
                     /locus_tag="GU280_gp11"
                     /db_xref="GeneID:43740576"
     CDS             29558..29674
                     /gene="ORF10"
                     /locus_tag="GU280_gp11"
                     /codon_start=1
                     /product="ORF10 protein"
                     /protein_id="YP_009725255.1"
                     /db_xref="GeneID:43740576"
                     /translation="MGYINVFAFPFTIYSLLLCRMNSRNYIAQVDVVNFNLT"
     3'UTR           29675..29903
ORIGIN       

SARS2-SWISS model

https://swissmodel.expasy.org/repository/species/2697049
Löysin hyvän mallin SARS viruksen työkaluproteiineista eli nonstrukturelleista proteiineista ja rakenneproteiineista . Proteiinien aminohappokoot ja malli kuvana oli nähtävissä selkä selitys tunnetuista funktioista.
Tällainen luettelo on hyödyksi jos seuraa rokotekehittelyuutisia ja muuta tätä virusta käsittelevää erityistietoa.  Voi vain sanoa että   SARS2 on kuin " menossa Marsiin" , niin hyvät työkalut sillä on mukanaan. Virusemo ajattelee tulevia sukupolvia  huolella.Viruksen perspektiivistä ihmiskunta on  erinomainen resurssi.

 Tässä on tietoa   ORF3 sekvenssistä.

 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/YP_009724391.1

ORF3a , 275 aminohappoa

 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/1796318599

  ORF8,   121 aminohappoa

  https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/1800242647

ORF10 ,  38 aminohappoa 

( ei sisällä lysiiniä (k), ei sis. histidiiniä (h) ei sisällä  glutamiinihappoa (e) , ei sisällä tryptofaania (w).

 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/YP_009725255.1

ORF7b , 43 aminohappoa

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/YP_009725296.1

Asetan nämä kaikki aminohapporakenteet erikseen näkyviin

järjestys orfeilla ja rakenneproteiineilla sekä lisäproteiineilla

ORF1a/ORF1ab,S,ORF3a,E,M,ORF6,ORF7a,ORF7b, ORF8,N,ORF10.

ORF1a/1ab antavat 15 tai 16 nsps nonstruktuuriproteiinia. En tiedä jos 

 SARS CoV:n  proteiini 11 on myös COVID-19 viruksella.