Leta i den här bloggen

Visar inlägg med etikett tetraspaniini. Visa alla inlägg
Visar inlägg med etikett tetraspaniini. Visa alla inlägg

måndag 23 februari 2015

HIV-1 ja tetraspaniini (Springer kirjasta)

Paul Spearman, Eric O.Freed ( Editors)
 Hiv Interactions with Host Cell proteins . 
Springer. Current Topics in Microbiology and Immunology. 2009, siis ei aivan tuoreinta tietoa. ISBN 978- 3- 642- 02174-9
Paul Spearman ja Eric O.Freed kirjassaan HIV Interactions with Host Cell proteins (2009) ovat katsoneet aiheelliseksi ottaa  kirjan yhdeksään  artikkeliin yhden, joka käsittelee tetraspaniinien osuutta . Sivulla 85 - 102 ( Näistä viisi sivua on tiheästi lueteltuja viitteitä asiasta. Muu sisältö on hahmoteltu seuraavsta:)

 (5) Mikä osuus on tetraspaniineilla  HIV-1 replikaatiossa?

(5) Thali Markus. The roles of tetraspanins in HIV-1 replication (Ss. 85- 102)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=Thali%20Markus.%20The%20roles%20of%20tetraspanins%20in%20HIV-1%20replication
TIIVISTELMÄ. Tetraspaniinit ovat pieniä integraalisia kalvoproteiineja, joiden tunnetaan kontrolloivan useita  erilaisia kalvoprosesseja kuten signalointia, migroitumista ja solu-solu-fuusioita.  On havaittu niiden myös säätelevän  HIV-1 replikaatiosyklissä   erilaisia vaiheita, mutta  tarkemmin ei ole tiedetty, miten nämä proteiinit pystyvät tehostamaan tai vaimentamaan viruksen leviämistä.
Tetraspanins are small integral membrane proteins that are known to control a variety of cellular processes, including signaling, migration and cell-cell fusion. Research over the past few years established that they are also regulators of various steps in the HIV-1 replication cycle, but the mechanisms through which these proteins either enhance or repress virus spread remain largely unknown.
Suomennos 23.2. 2015  
Kts: 
http://en.wikipedia.org/wiki/Tetraspanin

 Springerin kirjan tetraspaniinia käsittelevän artikkelin  SISÄLTÖ
Abstrakti (ullä)
1.Johdanto
2. Tetraspaniinit: Solukalvoon perustuvien prosessien organisaattori
(Rakenne, sijoittuminen solun sisällä; solufunktiot)
3. Tetraspaniinit säätelevät HIV-1 viruksen replikaatiota
Tetraspaniineja esiintyy viruksen ulosmenokohdilla
Tetraspaniinit HIV-1 viruksen virionissa estää Env- indusoiman kalvofuusion
Tetraspaniinit säätelevät HIV-1 viruksen sisäänmenoa ja virusgenomin transkriptiota vastainfektoituneissa soluissa.
Tetraspaniinit säätelevät solusta soluun tapahtuvaa HIV-1 viruksen välittymistä.
Miten tetraspaniinit säätelevät HIV-1 viruksen sisäänmenoa, viruksen proteiinien expressoitumista ja Env/reseptorivälitteisen fuusioprosessin?
Repression liipaisee esiin virukseen liittynyt Env tai tuottajasoluun liittynyt Env
4. Yhteenveto ja asian perspektiivit.

...Tästä asiasta katson yhteenvedosta jonkin lauseen:

"Pitäisi olla ilmiselvää em artikkeleitten johdosta, että olemme vasta tiedon varhaisissa alkujuurissa koettaessamme ymmärtää sitä mekanismia, millä tetraspaniinit vaikuttavat HIV-1 viruksen replikaation eri vaiheissa. On hyvä saada edelleen geneettisiä, biokemiallisia ja solubiologisia analyysejä tästä asiasta. Saadaan samalla jopa lisätietoa solufuusioprosessin fysiikasta analysoitaessa, miten tetraspaniinit säätelevät HIV-1 Env-liipaisemaa kalvofuusioprosessia virologisessa synapsissa. Nimittäin kaksi sileää toisiaan vastassa olevaa kalvoa eivät niin vain spontaanisti ala fusoitua (sulaa yhteen). Kuitenkin kaareva kalvopinta (kuten rakkuloissa tai mikrovillusten kärjissä) saattaa asettua lähempään kontaktiin vastapäisen sileän kalvon suhteen, koska repulsiovoimatkin ovat vähemmät näitten välillä ja voitettava energiaeste on matalampi. Tetraspaniinit toimivat kuin organisaattorit fuusioalustoilla joko sallien tai ollen sallimatta solun ja viruksen fusogeenien pääsyn kalvon näille mikrosegmenteille. Tetraspaniinit myös rekrytoivat sellaisia soluproteiineja ja lipidejä, jotka edistävät lipidikerrosten kaarevuutta.
Ei tule olemaan helppoa eritellä tarkalleen, miten tetraspaniini säätelee HIV-1 viruksen välittymistä, sillä tetraspaniineja on virologisen synapsin molemmilla puolilla sekä myös virionin sisällä.
http://www.metapathogen.com/IMG/HIV-infectious-synapse.jpg

Lisäksi on muistettava viruksen välittymistavan tapahtuvan imusolmukkeissa primääristi staattisen solukirjon kesken (solusta soluun), mutta tiedemiehet tietävät hyvin vähän viruksen leviämistavoista solusta soluun muissa kudoksissa esim suolistoon liittyvässä imukudoksessa. Kuitenkin voi pitää hyvin todennäköisenä liikkuvien (motile) HIV-1 infektoituneitten solujen toimivan viruksen välittäjälähteenä joissain tuollaisissa muissa paikoissa. Lopulta näyttäisi tulevan aivan ehdottoman välttämättömäksi tutkia tetraspaniinin funktioita sellaisissa olosuhteissa, mitkä heijastavat mainittuja fysiologisia seikkoja-ja vielä enemmänkin välttämätöntä, kun ottaa huomioon tetraspaniinien CD63 tai CD9 ja CD81 myös säätelevän solun motiliteettia, mikä puolestaan ehkä vaikuttaa HIV-1 viruksen leviämistä kohdesoluun ja samalla viruksen yleistymistä ( virus dissemination in situ).
---
Tetraspaniinin solufunktioista muutama lause:
Fuusion promoottoreina pidetään CD9 ja CD81 tetraspaniineja, mutta ne voivat kuten yleensä tukiproteiinit joko säädellä negatiivisesti tai positiivisesti fuusioilmiötä. Esim lihassolun myotubien muodostuksessa nämä kiihdyttävät lihassolujen fuusiota. Samoin ne kiihdyttävät itusolujen fuusiota (oosyytin ja sperman fuusiota ). Negatiivista säätöä on osoitettu mikrobeja sisäänsäottaneitten multinukleaaristen fagosyyttien muodostumisesta.

HIV-1 virioneihin on pakkautunut mukaan myös tetraspaniinia CD63. HIV-1 esiintyy solukalvon niissä segmenteissä, missä on runsaasti tetraspaniineja. On havaittu että tetraspaniinin C63 asettuminen virioniin ei ole umpimähkäinen, vaan non-random prosessi. kuten on havaittu HLA-DR antigeenista niin tetraspaniini CD63 inkorporoituu spesifisesti T-imusoluista vapautuneisiin virioneihin.Tämä havaittiin jo 1997. Tetraspaniinin identifioitiin uudestaan ( 2004) mahdollisena osatekijöinä HIV-1 replikaatiossa, kun tutkittiin virionin purkaantumista solusta ulos ja miten virus rekrytoi solun ESCRT-koneiston, joka välittää solusta vapautumista.
(ESCRT= endosomal sorting complex required for transport).

 HIV-1, erityisesti viruksen kalvon (envelope) glykoproteiini Env, ainakin joissan fysiologisissa tiloissa ja tietyissä solutyypeissä voi kulkea solun endosyyttisen järjestelmän niiden alayksikköjen kautta, joissa tetraspaniinin CD63 tiedettiin primääristi sijaitsevan. Virus hankkii itselleen CD63 kulkiessaan tätä purkautumistietä. Jos se purkautuu makrofagista, se on hankkinut lisäksi CD81 ja CD82.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19143627

Kriittinen seikka HIV-1 viruksen vapautumiselle on ESCRT1- kompleksin erään alayksikön (TSG101, tumor susceptibility gene 101 ) komponentti, koska sitä vaaditaan myöhäisen endosomin ja multivesikulaarisen (MVB) kappaleen lumenin sisäisten rakkuloitten muodostamiseen.

Myöhäisen endosomin (Late Endosome, LE) klassiset merkit ovat CD63, CD81 ja CD82, Lamp-1 ja MHC II. Polyproteiinin Gag asettuu näihin solunsisäisiin aitioihin. Kyse on sorteerauskohdasta, josta menee tiet lysosmiin, hajoitukseen tai pois solusta. Mutta gag välttää hajoituksen. Solun ulkopuolella olevat virionitkin kantavat LE/MVB merkkiaineita., joten LE-/MVB on produktiivinen ulospäin nuppuilu kohta. Gag rekrytoi ESCRT osatekijöitä MVB kappaleilta AP-3 taas tunnetaan Gag polyproteiinin kuljettajana LE-MVB alueelle. Adaptoriproteiini AP-3 kuljettaa aineita joissa on merkki CD 63 ja LAMP-1. AP-3 kompleksi on solun normaaleja avainproteiineja, jotka sorteeraavat sekretorisen ja endosyyttisen tien protiineja - kuin postinkantajat, katsomalla vain "osoitelapun" eikä sisältöä. Ne voidaan hämätä käyttämällä normaaleja osoitelappuja, sopivia CD-tunnuksia. niiden osuudesta pitäisi tehdä tässä  sivuhyppy. Adaptoriproteiinit.

Tetraspaniinit taas ovat niitä CD tekijöitä, osoitelappuja, joiden sopivan koostumuksen hankkiminen on kriittisesti tärkeää HIV-1 virukselle, että se pääse kamouflage periaatteella läpi sytosolin eikä joudu hajoitettavaksi.
http://www.cytochemistry.net/cell-biology/recend8.gif
http://www.nature.com/nm/journal/v9/n10/images/nm1003-1262-F1.gif

 Päivitys  23.2. 2015

onsdag 14 december 2011

Kirja HIV-viruksesta

Paul Spearman, Eric O.Freed ( Editors)
 Hiv Interactions with Host Cell proteins . 
Springer. Current Topics in Microbiology and Immunology. 2009, siis ei aivan tuoreinta tietoa. ISBN 978- 3- 642- 02174-9 Sivut 2004
Kirjan sisällöstä
Toimittajien alkulause 2009.
Kts. suomennoksia 23.2. 2015. 

(1) Vif  ja APOBEC3 

(2) Miten  HIV-viruksen lisäproteiini Vpu suhtautuu isäntäsolujen tekijöihin? Vpu ja Tetheriini
 Guatelli John C. Interactions of viral protein U (Vpu) and cellular factors ( Ss. 27-45)

(3) TRIMalfa proteiinit ovat  solun antiretrovirusjärjestelmää
(3)  Byeongwoon Song.  TRIM5alpha (Ss. 47- 66)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=Byeongwoon%20Song.%20TRIM5alpha

 (4) HIV-1  Gag ja  isäntäsolun kalvorakkuloita kuljetattavat tiet 
(4) Chu Hin, Wang Jaang-Jiun, Spearman Paul. Human Immunodeficiency Virus type-1 Gag and host vesicular trafficking pathways (Ss. 67- 84)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=Chu%20Hin%2C%20Wang%20Jaang-Jiun%2C%20Spearman%20Paul.%20Human%20Immunodeficiency%20Virus%20type-1%20Gag%20and%20host%20vesicular%20trafficking%20pathways

 (5) Mikä osuus on tetraspaniineilla  HIV-1 replikaatiossa?
(5) Thali Markus. The roles of tetraspanins in HIV-1 replication (Ss. 85- 102)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=Thali%20Markus.%20The%20roles%20of%20tetraspanins%20in%20HIV-1%20replication


(6) Danielson Cindy M , Hope Thomas J. Imaging of HIV/Host protein Interaction (Ss. 103- 124)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=Danielson%20Cindy%20M%20%2C%20Hope%20Thomas%20J.%20Imaging%20of%20HIV%2FHost%20protein%20Interaction

Abstract

HIV-1 relies on a myriad of interactions with host cell proteins to carry out its life cycle. Traditional biochemical approaches to probe protein-protein interactions are limited in their ability to study the spatial and dynamic interactions that take place in the context of an intact cell. However, issues such as localization and dynamics of interactions between viral and host proteins can be well addressed utilizing fluorescent imaging methods. The past decade has brought about the development of many novel fluorescent imaging techniques which have proved useful to describe the interaction of HIV-1 proteins with the host cell.


(7) Llano Manual, Morrison James, Poeschla Eric. M. Virological and Cellular Roles of the transcriptional coactivator LEDGF/p75 ( Ss. 125- 146)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=Llano%20Manual%2C%20Morrison%20James%2C%20Poeschla%20Eric.%20M.%20Virological%20and%20Cellular%20

Abstract

The chromatin-associated cellular proteins LEDGF/p75 and LEDGF/p52 have been implicated in transcriptional regulation, cell survival and autoimmunity. LEDGF/p75 also appears to act as a chromatin-docking factor or receptor for HIV-1 and other lentiviruses and to play a role in leukemogenesis. For both the viral and cellular roles of this protein, a key feature is its ability to act as a molecular adaptor and tether proteins to the chromatin fiber. This chapter reviews the emerging roles of LEDGF/p75 and LEDGF/p52 in diverse cellular processes and disease states.


(8) Arhel Nathalie J, Kirchhoff. Implication of Nef: Host Cell interaction in viral persistence and progression to AIDS. (Ss. 147- 176)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=Arhel%20Nathalie%20J%2C%20Kirchhoff.%20Implication%20of%20Nef%3A%20Host%20Cell%20interaction%20in%20viral%20persistence%20and%
20progression%20to%20AIDS.

Abstract

The HIV and SIV Nef accessory proteins are potent enhancers of viral persistence and accelerate progression to AIDS in HIV-1-infected patients and non-human primate models. Although relatively small (27-35 kD), Nef can interact with a multitude of cellular factors and induce complex changes in trafficking, signal transduction, and gene expression that together converge to promote viral replication and immune evasion. In particular, Nef recruits several immunologically relevant cellular receptors to the endocytic machinery to reduce the recognition and elimination of virally infected cells by the host immune system, while simultaneously interacting with various kinases to promote T cell activation and viral replication. This review provides an overview on selected Nef interactions with host cell proteins, and discusses their possible relevance for viral spread and pathogenicity.


(9) Planelles Vicente, Benichou Serge. Vpr and its interactions with cellular proteins (Ss. 177- 200)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=Planelles%20Vicente%2C%20Benichou%20Serge.%20Vpr%20and%20its%20interactions%20with%20cellular%
20proteins

Abstract

Like most viral regulatory proteins, HIV-1 Vpr and homologous proteins from primate lentiviruses are small and multifunctional. They are associated with a plethora of effects and functions, including induction of cell cycle arrest in the G(2) phase, induction of apoptosis, transactivation, enhancement of the fidelity of reverse transcription, and nuclear import of viral DNA in macrophages and other nondividing cells. This review focuses on the cellular proteins that have been reported to interact with Vpr and their significance with respect to the known functions and effects of Vpr on cells and on viral replication.