EBOV VP35 sitoo dsRNA:ta, viruksen replikaatiovälituotetta joka on solun virusinfektion signaali immuunijärjestelmälle

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22289166

LÄHDE ja suomennosta abstraktista: : 

Antiviral Res. 2012 Mar;93(3):354-63. doi: 10.1016/j.antiviral.2012.01.005. Epub 2012 Jan 25. dsRNA binding characterization of full length recombinant wild type and mutants Zaire ebolavirus VP35.

Zinzula L¹, Esposito F, Pala D, Tramontano E.

 Ebolavirustenb VP35 proteiini on multifunktionaalinen huomattava virulenssitekijä, joka osallsituu Ebolavirksen  replikaatioon ja  ihmisen immuunisysteemin evaasioon ( välttöön).
Viruksen RNA-polymeraasissa VP35 on välttämätön osatekijää, se osallistuu  nukleokapsidin (NC)koostumukseen ja estää luonnollisen  immuniteetin vasteen dsRNA.ta sitovalla funktiollaan ja samalla vastavaikuttaen solun sensoriin RIG-1 ja  vaimentaen  I-tyypin nterferoni n tuotannon.

Artikkeli on vuodelta 2012, john aikaan  oli havaittu, että VP35 pystyy tunnistamaan dsRNA:ta . Tämä keksittiinVP35 proteiinin   C-terminaalin rakennetta  ja funktiota   analysoitaessa.
.Tutkijat raportoivat artikkelissaan  Zairen ebolaviruksen  täyspitkän VP35 rekombinantin (rVP35)- dsRNA- sitoutumisfunktion.  

(Menetelmä:  We established a novel in vitro magnetic dsRNA binding pull down assay, determined the rVP35 optimal dsRNA binding parameters, measured the rVP35 equilibrium dissociation constant for heterologous in vitro transcribed dsRNA of different length and short synthetic dsRNA of 8bp, and validated the assay for compound screening by assessing the inhibitory ability of auryntricarboxylic acid (IC(50) value of 50μg/mL). Furthermore, we compared the dsRNA binding properties of full length wt rVP35 with those of R305A, K309A and R312A rVP35 mutants, which were previously reported to be defective in dsRNA binding-mediated IFN inhibition, showing that the latter have measurably increased K(d) values for dsRNA binding and modified migration patterns in mobility shift assays with respect to wt rVP35.)

 Yhteenvetona nämä tulokset osoittivat ensi kertaa luonnehditun  täyspitkän VP35- ja  mutantti VP35- proteiinin dsRNA.ta sitova funktio

Overall, these results provide the first characterization of the full-length wt and mutants VP35-dsRNA binding functions.

Kertausta luonnollisen immuniteetin moduleista RLR proteiiniperhe.

Mol Biol Evol. 2014 Jan;31(1):140-53. doi: 10.1093/molbev/mst184. Epub 2013 Oct 8. Ancient origins of vertebrate-specific innate antiviral immunity.

Mukherjee K¹, Korithoski B, Kolaczkowski B.

Animals deploy various molecular sensors to detect pathogen infections.

• RIG-tyyppinen reseptori RLR  . RLR reseptoriproteiinit  tunnistavat viruksen RNA muotoa ja panevat alkuun  luonnollisen immuniteetin vasteita. Ihmisellä on kolme RLR-muotoa, jotka tunnistavat  eri typpisiä RNA molekyylejä ja suojelevat  erilaisia viruspatogeeneja vastaan.   Arvellaan että RLR- proteiiniperhe on alkuperäisin  hieman ennen selkärankaisten  laajempaa esiintymistä  ja erilaistui nopeasti  monimutkaisilla domaaninsiirtoprosesseilla.   Näitten löytöjen vastaisesti tutkijat kuitenkin osoittavat, että kokopitkät RLR:t ja niiden alavirtaan signaloivat molekyylit olivat olemassa varhaisimmissa  eläimissä,   mikä viitaisi siihen, että RLR-perusteinen immuunijärjestelmä  sai alkunsa monisoluisuuden ( multicellularity)  yhteydessä. RLR:ien funktionaalinen erilaistuminen tapahtui varhain animaalisessa evoluutiossa yksinkertaisilla geeniduplikaatioilla, joita seurasi RNA:ta sitovan taskun modifikaatiot, joista moni  toimii  adaptoitumalla. Ihmisen RLR:istä   ja esi- RLR:istä  selviää, että    esi-RLR sitoi  RNA.ta  RIG-1- kaltaisesti. RIG-1 kaltainen  RNA.ta sitovuus.

 RIG-like receptor (RLR) proteins identify viral RNAs and initiate innate immune responses.
 The three human RLRs recognize different types of RNA molecules and protect against different viral pathogens. The RLR protein family is widely thought to have originated shortly before the emergence of vertebrates and rapidly diversified through a complex process of domain grafting. Contrary to these findings, here we show that full-length RLRs and their downstream signaling molecules were present in the earliest animals, suggesting that the RLR-based immune system arose with the emergence of multicellularity. Functional differentiation of RLRs occurred early in animal evolution via simple gene duplication followed by modifications of the RNA-binding pocket, many of which may have been adaptively driven. Functional analysis of human and ancestral RLRs revealed that the ancestral RLR displayed RIG-1-like RNA-binding.  

• MDA5- kaltainen sitoutuminen  alkoi tapahtua kun  RNA:ta sitovassa taskussa tapahtui muutoksia,  esi -RLR duplikoitui, mikä lienee tapahtunut  varhaisetn Bilateraalisten aikaan tai myöhemmin , kun deuterostomat erosivat protostomista.

MDA5-like binding arose through changes in the RNA-binding pocket following the duplication of the ancestral RLR, which may have occurred either early in Bilateria or later, after deuterostomes split from protostomes.

• RLR:n sensitiivisyys ja spesifisyys  erilaisten RNA-struktuurien sitomisessa  on toistumiseen adaptoitunut imettäväisten evoluutiossa, mikä viitaa hyvin pitkäaikaiseen evolutionaaliseen kehittymiseen, joka kilpailee virus RNA:n tai muitten molekylien kanssa. 

The sensitivity and specificity with which RLRs bind different RNA structures has repeatedly adapted throughout mammalian evolution, suggesting a long-term evolutionary arms race with viral RNA or other molecules.

KEYWORDS:

RIG-like receptor; RNA-binding protein; antiviral immunity; protein family evolution

Free PMC Article