Leta i den här bloggen

Visar inlägg med etikett H5N1. Visa alla inlägg
Visar inlägg med etikett H5N1. Visa alla inlägg

lördag 5 juli 2025

Lintuinfluenssa HPAI H5N1 viruksen HA-peptidin pilkkoutumiskohdan motiivi

 https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5057330/

. 2015 Oct 15;25(6):406–430. doi: 10.1002/rmv.1846

Molecular pathogenesis of H5 highly pathogenic avian influenza: the role of the haemagglutinin cleavage site motif

PMCID: PMC5057330  PMID: 26467906
  • HA rakenteen Sveitsin malli  https://swissmodel.expasy.org/repository/uniprot/D9I6N5
  •  https://swissmodel.expasy.org/repository/uniprot/D9I6N5

    Hemagglutinin Q5EP31 (Identical to D9I6N5) UniProtKBInterPro

    Toggle Identical (ACE)

    Q5EP31
    6cfg.(ACE)
    Q5EP31
    6cfg.(ACE)
    Q5EP31
    6cfg.(ACE)
    Q5EP31
    6cfg.(ACE)
    Q5EP31
    6cfg.(ACE)
    Q5EP31
    6cfg.(ACE)
    Q5EP31
    6cfg.(ACE)
    Q5EP31
    6cfg.(ACE)
    Q5EP31
    6cfg.(ACE)
    DQICIGYHANNSTEQVDTIMEKNVTVTHAQDILEKKHNGK56
    DQICIGYHANNSTEQVDTIMEKNVTVTHAQDILEKKHNGK44
    LCDLDGVKPLILRDCSVAGWLLGNPMCDEFINVPEWSYIV96
    LCDLDGVKPLILRDCSVAGWLLGNPMCDEFINVPEWSYIV84
    EKANPVNDLCYPGDFNDYEELKHLLSRINHFEKIQIIPKS136
    EKANPVNDLCYPGDFNDYEELKHLLSRINHFEKIQIIPKS124
    SWSSHEASLGVSSACPYQGKSSFFRNVVWLIKKNSTYPTI176
    SWSSHEASLGVSSACPYQGKSSFFRNVVWLIKKNSTYPTI164
    KRSYNNTNQEDLLVLWGIHHPNDAAEQTKLYQNPTTYISV216
    KRSYNNTNQEDLLVLWGIHHPNDAAEQTKLYQNPTTYISV204
    GTSTLNQRLVPRIATRSKVNGQSGRMEFFWTILKPNDAIN256
    GTSTLNQRLVPRIATRSKVNGQSGRMEFFWTILKPNDAIN244
    FESNGNFIAPEYAYKIVKKGDSTIMKSELEYGNCNTKCQT296
    FESNGNFIAPEYAYKIVKKGDSTIMKSELEYGNCNTKCQT284
    PMGAINSSMPFHNIHPLTIGECPKYVKSNRLVLATGLRNS336
    PMGAINSSMPFHNIHPLTIGECPKYVKSNRLVLATGLRNS324
    P337
    P

     

    Hemagglutinin A8UDR1 UniProtKBInterPro

    Toggle Identical (BDF)

    A8UDR1
    6cfg.(BDF)
    A8UDR1
    6cfg.(BDF)
    A8UDR1
    6cfg.(BDF)
    A8UDR1
    6cfg.(BDF)
    A8UDR1
    6cfg.(BDF)
    GLFGAIAGFIEGGWQGMVDGWYGYHHSNEQGSGYAADKES382
    GLFGAIAGFIEGGWQGMVDGWYGYHHSNEQGSGYAADKES40
    TQKAIDGVTNKVNSIIDKMNTQFEAVGREFNNLERRIENL422
    TQKAIDGVTNKVNSIIDKMNTQFEAVGREFNNLERRIENL80
    NKKMEDGFLDVWTYNAELLVLMENERTLDFHDSNVKNLYD462
    NKKMEDGFLDVWTYNAELLVLMENERTLDFHDSNVKNLYD120
    KVRLQLRDNAKELGNGCFEFYHKCDNECMESVRNGTYDYP502
    KVRLQLRDNAKELGNGCFEFYHKCDNECMESVRNGTYDYP160
    QYSEEARLKREEIS516
    QYSEEARLKREEIS174

    måndag 26 juni 2023

    HS maailman lintuinfluenssatilanteen näkymistä eläinkunnan puolella

     

    Ulkomaiset asiantuntijat varoittavat nopeasti tarttuvasta ja alati muuntuvasta lintuinfluenssaviruksesta, kertoo uutistoimisto AFP. Lintuinfluenssavirusta on havaittu maailmalla enemmän kuin koskaan.

    Maailman terveysjärjestön WHO:n tutkija, yhdysvaltalainen Richard Webby kertoo AFP:lle, että virus on muuntunut entistä vaarallisemmaksi linnuille.

    Virusta esiintyy Webbyn mukaan nyt myös vuoden ympäri. Aiemmin lintuinfluenssavirus H5N1 on aiheuttanut enimmäkseen kausiluonteisia epidemioita.

    ”Nyt on yhdentyyppinen H5-virus epidemisenä Euroopassa ja siirtynyt Etelä-Amerikkaan”, Terveyden ja hyvinvoinnin laitoksen (THL) johtava asiantuntija Niina Ikonen vahvistaa STT:lle.

    Tämän hetken tautitilanteessa huolestuttavinta on AFP:n haastattelemien asiantuntijoiden mukaan se, että sairastuneiden nisäkkäiden määrä kasvaa koko ajan.

    Etelä-Amerikassa sijaitseva Chile on tiedottanut, että kevään aikana lähes 9 000 merieläintä, kuten merileijonaa, pingviiniä ja delfiiniä on kuollut lintuinfluenssaan.

    Maan viranomaisten mukaan eläimet ovat todennäköisesti saaneet viruksen syömällä sairasta lintua.

    WHO:n tutkija Webby tietää kuitenkin muutaman tapauksen, joissa saattaa olla viitteitä viruksen tarttumisesta nisäkkäiden välillä: viime syksynä espanjalaisella minkkifarmilla ja tämän vuoden alkupuolella merileijonien välillä Etelä-Amerikan Perussa.

    Ruokaviraston erityisasiantuntija Tiia Tuupanen ja erikoistutkija Niina Tammiranta Eläinten terveyden ja lääkitsemisen yksiköstä (ELL) lisäävät listalle vielä epäilyn kesällä 2022 hylkeistä Yhdysvalloissa.

    Selkeät todisteet nisäkkäiden välisistä epäillyistä tartunnoista kuitenkin vielä puuttuvat. Suomessa on sairastunut lintuinfluenssaan aikaisemmin yksi ilves ja saukko.

    Onko viruksesta sitten vaaraa ihmisille?

    Britannian eläin- ja kasvinterveysviraston professori Ian Brown kertoo AFP:lle, että vaikka virus näyttää tulleen voimakkaammaksi linnuissa, se on yhä sopeutumaton ihmisiin.

    Myös Euroopan tautikeskus on arvioinut, että tartuntariski ihmisväestölle on alhainen.

    Terveyden ja hyvinvoinnin laitoksen mukaan lintujen influenssavirukset tarttuvat yleensä huonosti ihmiseen.

    THL:n Ikosen mukaan on kuitenkin mahdollista, että yksittäisiä tartuntoja ihmisillä saatetaan todeta, jos altistuu tartunnan saaneelle linnulle.

    ”Tällä hetkellä Euroopassa luonnonvaraisissa linnuissa todetut influenssa A/H5 -virukset eivät ole muuntuneet ihmisiin herkemmin tarttuviksi. Euroopassa yksittäisiä tartuntoja on todettu ihmisillä, mutta heillä taudinkuva on ollut joko oireeton tai lieväoireinen”, Ikonen kertoo.

    WHO:n tutkija Webby etsii parhaillaan näyttöä viruksen muuntumisesta. Hänen mukaansa lintuvirukset sitoutuvat yleensä eri reseptoreihin isäntäsoluissa kuin ihmisen virukset.

    ”Tarvitaan vain kaksi tai kolme pientä muutosta yhdessä virusproteiinissa, jotta se sopeutuisi paremmin ihmisiin”, hän kertoo AFP:lle.

    Maailman lintuinfluenssatilannetta parantaisi WHO:n Webbyn mukaan siipikarjan rokottaminen. Hänen tietojensa mukaan Kiina, Egypti ja Vietnam ovat jo rokottamiseen ryhtyneet.

    Yhdysvallat on aloittanut linnuille sopivan rokotevaihtoehdon etsimisen tämän vuoden huhtikuussa. Ranska toivoo aloittavansa siipikarjan rokottamisen aikaisintaan tänä syksynä.

    Jotkut maat ovat myös vastustaneet rokotuskampanjoita. Britannian johtava eläinlääkintäasiantuntija Christine Middlemiss on esittänyt epäilyksensä siipikarjan rokottamisesta, koska virus muuntuu koko ajan.

    Suomessa siipikarjan ja muiden lintujen rokottaminen lintuinfluenssaa vastaan on kielletty, koska Suomessa ei esiinny lintuinfluenssaa siinä määrin, että rokottamisella katsottaisiin saavutettavan hyötyä, kertoo Ruokaviraston erityisasiantuntija Hanna Lounela.

    WHO:n eläintautijärjestön pääjohtaja Monique Eloit kannustaa maailman maita nostamaan lintuinfluenssa-asian pöydälle.

    ”Nykyään tiedämme, että lintuinfluenssapandemia ei ole kuvitelmaa, vaan voi pian olla totta”, Eloit sanoi AFP:n mukaan.

    Suomessa todettiin tämän vuoden ensimmäinen lintuinfluenssatapaus Heinolan lintuhoitolassa varpushaukalla.

    Lisäksi Salossa 13. kesäkuuta löydetyn parikymmenpäisen naurulokkiyhdyskunnan kuolema johtui Ruokaviraston mukaan lintuinfluenssasta. Kuolinsyyksi on varmistunut korkeapatogeeninen eli suuren taudin aiheuttamiskyvyn omaava H5N1-tyypin lintuinfluenssa.

    Kyseessä on tämän vuoden ensimmäinen Suomessa todettu, lintuinfluenssan aiheuttama luonnonvaraisten lokkien joukkokuolema.

    Ruokaviraston mukaan lähes kaikki Suomessa tavatut lintuinfluenssatapaukset on tavattu luonnonvaraisissa linnuissa. Viime vuonna Suomessa todetuista tapauksista 24 oli luonnonvaraisissa linnuissa.

    Vuonna 2022 Suomessa todettiin pääsääntöisesti H5N1-tyypin lintuinfluenssaa. Lisäksi todettiin yksi tapaus korkeapatogeenista H5N5-tyypin lintuinfluenssaa.

    tisdag 13 december 2016

    Lintuinfluenssoista yleistä.

    Vuodesta 2014 tammikuusta  merraskuulle 2016 on  77 maasa kierrellyt yhteensä 13 lintuinfluenssaviruskantaa.  Purkauksia hoidettaessa on tuhottu satoja miljoonia siipikarjalintuja.
    ihmisille vaarallisimpia näistä 13 viruksesta on tyypit  A H5N1 ja A H7N9 sekä A H9N2.
     Lisäksi mainittavia ovat  sikainfluenssavirukset A H1N1 ja A H3N2, mutta näihin on jo rokotus olemassa.

    WHO antaa tietoa  A H7N7  viruksesta,  eräästä  fatal case- tapauksesta sekä  AH7N9 influenssasta ihmisellä.

      Control of Communicable Diseases Manual 20th Edition.
    American Public Health Association (2015). APHA Press, Washington DC. ISBN: 978-0-87553-018-5
     Koska  A- lintuinfluenssaviruksilla on 18  H ja 11 N( neuraminaasi)  merkitsijää olemassa  niin kombinaatioita näistä pintaantigeeneistä  löytyy useita.

    H5N1, H5N2, H5N3, H5N6, H5N7, H5N8, H5N9.
     H7N3, H7N7, H7N8, H7N9
    H9N2
    Sikainfluensaviruksia:
    H1N1, H3N2.

    Tässä nyton koossa aika monta kantaa. .

    söndag 11 december 2016

    OIE uutisia (2016) eläinten puolelta (Alerts)

    tisdag 22 januari 2013

    H6 virukset

    H6 virusalatyyppejä on purkauksittain esiintynyt siipikarjassa monessa Euraasian maassa viime vuosina, kertoo Alexander vuonna 2007.

    Asiasta on tehty  katsauksia  Kiinassa 2000-2005, ja niistä käy ilmi, että H6N1 ja H6N2 viruksia esiintyy pienikokoisessa siipikarjassa ja kasvatetuissa hanhissa (Cheung et al.  2007). Näiden esiintyvien H6-virusten merkitys Etelä Kiinassa on se, että ne ovat  jälkipolvea A/teal/Hong Kong/W312/97  ( H6N1) virukselle,   jolla on  97% homologiaa  kuudessa sisägeenissään  ja NA-geenissä    H5N1- viruksen  ihmisessä todettuun  isolaattiin A/Hong Kong /156/97 (Hoffmann et al. 2000).

    Viimeksi kuluneen vuosikymmenen aikana  on havaittu  samanaikaisevoluutiota ja samaan aikaan kiertävyyttä  H5N1- viruksella, H9N2-viruksella  ja H6N1 viruksella  Etelä- Kiinassa ja tästä on kehkeytynyt uudelleen järjestäytynyttä  alatyyppiä, joihin kuuluu H6N2 viruksia, samoin kuin moninaisia  H6N1 ja H6N2 virusgenotyyppejä (Chin  et al. 2002, Cheung et al. 2007).

    LÄHDE: Hui-Ling Yen, Robert G. Webster.
    Other subtypes of  pandemic potential. IN the article:: Pandemic influenza as a current threat. (2009)
    In the book: Compans R W et al. Vaccines for pandemic influenza (2009)