Leta i den här bloggen

Visar inlägg med etikett Filoviruses. Visa alla inlägg
Visar inlägg med etikett Filoviruses. Visa alla inlägg

tisdag 17 december 2013

FILOVIRUSES. Ebola reston evoluutiossa ? Vuosi 2008

Ajattelin jo että Ebola Restonista voisi saada  tehtyä rokotteen Afrikan ebolaa vastaan, mutta Ebola Reston voi olla   evoluutiossa. Sitä on esiintynyt possuissa sekainfektiossa, joka on ollut  vakava.
 Oie kertoo uudesta löydöstä. Otan sitaatin ja myöhemmin suomennan.
LÄHDE:
 http://www.oie.int/en/for-the-media/press-releases/detail/article/first-detection-of-ebola-reston-virus-in-pigs-faooiewho-offer-assistance-to-the-philippines/ First detection of Ebola-Reston virus in pigs - FAO/OIE/WHO offer assistance to the Philippines
MANILA 23 December 2008 – Following the detection of the Ebola-Reston virus in pigs in the Philippines, the UN Food and Agriculture Organization (FAO), the World Organisation for Animal Health (OIE) and the World Health Organization (WHO) announced today that the government of the Philippines has requested the three agencies send an expert mission to work with human and animal health experts in the Philippines to further investigate the situation.
An increase in pig mortality on swine farms in the provinces of Nueva Ecija and Bulacan in 2007 and 2008 prompted the Government of the Philippines to initiate laboratory investigations. Samples taken from ill pigs in May, June and September 2008 were sent to international reference laboratories which confirmed in late October that the pigs were infected with a highly virulent strain of Porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRS) as well as the Ebola-Reston virus.
Although co-infection in pigs is not unusual, this is the first time globally that an Ebola-Reston virus has been isolated in swine. It is not, however, the first time that the Ebola-Reston virus has been found in the Philippines : it was found in monkeys from the Philippines in outbreak s that occurred in 1989-1990, 1992, and 1996.

The E bola virus belongs to the Filoviridae family (filovirus) 
 and is comprised of five distinct species: 
  1. Zaïre 
  2. Sudan
  3. Côte d'Ivoire
  4. Bundibugyo
  5.  Reston .

 Zaïre , Sudan and Bundibugyo species have been associated with large Ebola hemorrhagic fever (EHF) outbreak s in Africa with high case fatality ratio (25–90%)
 while Côte d'Ivoire and Reston have not.
 Reston species can infect humans but no serious illness or death in humans have been reported to date.
Since being informed of this event in late November, FAO, OIE and WHO have been making every effort to gain a better understanding of the situation and are working closely with the Philippines Government and local animal and human health experts.
The Department of Health of the Philippines has reported that initial laboratory tests on animal handlers and slaughterhouse workers who were thought to have come into contact with infected pigs were negative for Ebola Reston infection, and that additional testing is ongoing. The Bureau of Animal Industry (BAI) of the Philippines Department of Agriculture has notified the OIE that all infected animals were destroyed and buried or burned, the infected premises and establishments have been disinfected and the affected areas are under strict quarantine and movement control. Vaccination of swine against PRRS is ongoing in the Province of Bucalan. PRRS is not transmissible to humans.
The planned joint FAO/OIE/WHO team will work with country counterparts to address, through field and laboratory investigation, important questions as to the source of the virus, its transmission, its virulence and its natural habitat, in order to provide appropriate guidance for animal and human health protection.
Until these questions can be answered, the FAO and WHO stressed the importance of carrying out basic good hygiene practices and food handling measures.
Ebola viruses are normally transmitted via contact with the blood or other bodily fluids of an infected animal or person. In all situations, even in the absence of identified risks, meat handling and preparation should be done in a clean environment (table top, utensils, knives) and meat handlers should follow good personal hygiene practices (e.g. clean hands, clean protective clothing). In general, hands should be r egularly washed while handling raw meat.
Pork from healthy pigs is safe to eat as long as either the fresh meat is cooked properly (i.e. 70°C in all part of the food, so that there is no pink meat and the juices run clear), or, in the case of uncooked processed pork, national safety standards have been met during production, processing and distribution.
Meat from sick pigs or pigs found dead should not be eaten and should not enter the food chain or be given to other animals. Ill animals should be reported to the competent authorities and proper hygiene precautions and protection should be taken when destroying and disposing of sick or dead pigs. The Philippines Department of Agriculture has advised the Philippine public to buy its meat only from National Meat Inspection Services certified sources.
As a general rule, proper hygiene and precautionary measures ( wearing gloves, goggles and protective clothing) should also be exercised when slaughtering or butchering pigs. This applies both to industrial and home-slaughtering of pigs. Children and those not involved in the process of slaughtering should be kept away.
December 2008

Ebolaviruksen alkulähteen selvittelyä . FILOVIRUSES

Conzales JP, Pourrut X, Leroy E.  Ebolavirus  and  Other Filoviruses. In: Wildlife and Emerging Zoonotic Diseases: The Biology, Circumstances and Consequences of Cross-Species Transmission (2007)  Springer ISBN 978-3-540-70961-9.
http://link.springer.com/chapter/10.1007%2F978-3-540-70962-6_15#page-1 

FILOVIRUSES

MARBURG- virus 

Tässä FILOVIRUSTEN ryhmässä on mainittavat ensimmäisenä Marburg-virus. -virus. http://en.wikipedia.org/wiki/Marburg_virus
MARBURG-virus on hemorragista kuumetta aiheuttava virus ja se havaittiin ensi  kerran  1960-luvulla Saksassa Marburgissa ja Frankfurtissa sekä  jugoslavian Belgradissa. 
Työntekijät olivat joutuneet sattumoisin altistumaan Behringwerkenin tehtailla ( Hoechst, nyk. CSL, Behring) infektoituneelle vihermarakatille, vervetille (grivet, Chloropus aethiops). 31 henkilöä infektoitui ja heistä kuoli seitsemän 
Marburgvirus (MARV) aiheutti ihmisissä vaikean taudin, verenvuotokuumeen samoin myös kädellisillä eläimillä. Virusta on käsiteltävä   biosafetylevel-4 (BSL-4)  mukaan. kun  EBOLA-virus löytyi, arveltiin että Marburg-virus olisi EBOLAN alalaji. 

 EBOLAVIRUS 

 Keskia-Afrikasta  alkoi levitä EBOLA- kuume 1976 ja tartuntakehtu oli tarkantutkinnan kohteena, muta alkuperäsitä  reservoaaria ei  aluksi havaittu, vaikka lepakoita osattiin   epäillä.  Havaittiin erityinen 20 vuoden  jakso epidemia-aalloissa ja muitakin miljöötekijöitö joita alettiin kartoittaa.  eräänkin infektion aikana kuoleltia eläintenraatoja tutkittiin ja  niistä etsittiin  merkkejä viruksesta.  Koetettiin löytää alkureservoaarin lisäksi  väli-isäntiä,  satunnaisia isäntiä, amplifioivia isäntiä ,  vektori-siäntiä ja työ on todella ollut valtaisia tässä kartoituksessa.  Varsinkin lepakkojen taxonomiaa on jouduttu selvittämään .

 Virus osoitautui  myös tarvitsevan oman  paikkansa taxonomaissa.  Se  ja sen akltaiset virukset  merkattiin FILOVIRUS-ryhmäksi, ksoka niissä on filamentteja , jonkinlaista säikeistä  sisältöä. Genomiltaan  EBOLA ryhmittyy kuten  muutkin MONONEGALES- virukset: Sen genomi on  yksittäinen säie, negatiivisesti polarisoitunut RNA.  ( mono- nega) .(  Näitä  MONONEGALES- viruksia  oli  muitakin  kuten  Rhabdoviridae,  Paramyxoviridae )  ja  erityistä on että  niitä juuri esiintyy lepakoissa  kroonisesti pinttyneenä. Lepakko on  niiten reservoaari. 

POTENTIAALINEN RESERVOAARI LEPAKKOLAJI   ( H R, Host, reservoar)

lepakkolajeja  tutkittaessa huomattiin, että kolme  MEGACHIROPTERA- lepakkolajia  tuli kyseeseen  Ebolaviruksen rservoaarina. 

Nämä lajit ovat 

Hammer-headed fruit bat, Hypsignathus monstrous http://en.wikipedia.org/wiki/Hammer-headed_bat

Singing fruit bat, Epomops franqueti  http://www.zootierliste.de/en/?klasse=1&ordnung=106&familie=10608&art=21103264

Hedelmälepakko, Little collared fruit bat,  Myonycteris torquata.   http://fi.wikipedia.org/wiki/Hedelm%C3%A4lepakot 

Näiä kolmea lajia esiintyy toisiaan täysin kattavilla alueilla Keski_ Afrikassa ja  Keski-Afrikan länisrannikolla.  

TARTUNTAKETJU

  INCIDENTAL HOSTS

Hedelmälepakto  syövät hedlemiä ja ovat riippuvaisia  eri  puitten  hedelmien  kypsymisestä, mitä on eri aikoina eri paikoissa ja kuivat ja sadeajat vaikuttavat myös  tähän ravinnon saantiin.  Tästä johtuu,  että lepakkolaumat voivat lätheä siirtymään ravinnon perässä.  Tällaiset siirtymät ajoittuvat  infektioitten lisääntymisiin.  Varsinkin jos kuivaan aikaan sekä   maaeläimet  että lepakot lähtevät  vesilähteen perään,  niitä kertyy samaan paikaan runsaasti.  Lepakot jotka kantavat virusta kroonisesti kehossaan, erittävät sitä sylkeenaä ja  kun ne purevat  hedelmiä, virusmassaa putoaa maahan hedelmäjätteissä ja pudonneita, osin purtuja hedelmiä   joutuu  maassa kulkevien eläinten ravintoketjuun. Varsinkin  kädelliset ja puikkija-antiloopit ovat hyvin  alttiita tälle virukselle ja  niissä tapahtuu eläinkannan kuolemia runsaasti.  Eläinten runsaammat Ebola-kuolemantapaukset  tapaavat edeltää ihmisten Ebola-epidemioita. 

 Kun vuosina  2002- 2003 Ebola-epidemia  kohtasi eläimiä,  saatuja ruhoja tutkittiin 44 kpl  korkean BSl-4-  turvallisuusvaatimusten  mukaisesti Gabonin laboratoriossa..  Niistä 12 gorillaa, 3 simpassia ja 1 puikkiantilooppi  oli kuollut ebolaan.  Vuosina 2002 - 2003 kuoli  puolet R.O. Kongon   Lossi Sanctuary- reservaatin ( 320 neliökm)  gorilloista.  Simpanssikanta  väheni 88%. 

Ebola- virusepidemat pitävät jonkinlaista  ajallista ja geografista aaltomallia. ja ne etenevät  R-O. Kongon alkulähteiltä kaakkoon ja luoteeseen. 

 Insidentaalinen tai väli-isäntä  on jokin laji, jossa  virusta  voi tjatkuvasti muosostua niin että tulee runsas viremia tilanne . Reproduktion aikana  voi  kehonnesteitä tulla   kontaminoimaan  maaperää. Viidakkoruoka on  yksi tartuntalähde. 

EBOLAN TAXONOMINEN KAAVA 

Afrikan Ebolaviruksista osa on luokiteltu lepakkoviruksina   (chiroptera) ja osa ihmisten  infektioiviruksina. 

Alku-virus on tuntematon.

  • MARBURG VIRUS  katsotaan  kuuluvaan  omana  linjanaan tähän puuhun. SUDANIN EBOLA-virus

  •  RESTON-virus, jonka  alkupeä on Filippiinien manilassa. RESTON-  ebolavirus ei ole letaali ihmiselle, mutta muuten  ebolan kaltainen.

  • AFRIKAN EBOLAVIRUKSET

  • SUDANIN EBOLAVIRUS 

  • ZAIREN EBOLAVIRUS
 Mikä olisi tilanne vuonan  2013 ihmisten ebolainfektioitten suhteen? 
Tästä saa tiedon WHO-lähteestä, muta se tulee hakea samalta sivulta kuin kaikki hemorrhagiset kuumet, verenvuotokuumetaudit .Siinä on  erikseen Marburg virus ja Ebolavirusasiat. 

http://www.who.int/topics/haemorrhagic_fevers_viral/en/
Jos virusta on  aktuellisti, niin se ilmenee tässä GAR sivussa, muta siinä ei ole tänään Ebolaa.
 http://www.who.int/csr/alertresponse/en/

Tämän päivän  Global Incxidence kartallakaan ei ole Ebolaa. Taitaa olla ihmiskunnan puoellal nyt Ebolatauko taas menossa.  Ebolan endeemisellä alueella Afrikassa  riehuu nyt tappava kolera ja poliotakin.