Leta i den här bloggen

Visar inlägg med etikett VP30. Visa alla inlägg
Visar inlägg med etikett VP30. Visa alla inlägg

måndag 17 november 2014

Yksityiskohta VP30 toiminnasta transkriptiotekijänä (Kuva)

thumbnail Figure 7. Model for EBOV RNA editing. The EBOV RNA-dependent RNA polymerase (L) transcribes vRNA into mRNA. A stem-loop structure in the mRNA directly upstream of the primary editing site causes the polymerase to pause, and enables insertion of non-templated adenosine residues due to stuttering. VP30 then resolves the stem loop, and allows continued faithful transcription. doi:10.1371/journal.ppat.1003677.g007
 http://www.plospathogens.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.ppat.1003677

VP30 on vahvasti asidofiilinen proteiini ja tulee tehkkaammaksi kun pH laskee. Zn++ lisää sen aktiivisuutta. Jota  VP30 voisi tehosta RNA-transkriptiota  mRNA-rungon lenkki tarvitaan nukleotidin 54-80 leader-alueessa.
VP30:n sitoutumisaktiviteetti  yksittäiseen runkolenkkiin tai dsRNA-muotoon on matala, mutta hyvä jos lenkki sijaitsee  alavirta- tai ylävirtasegmentissä.

Mikä alue VP30 proteiinissa tekee interaktion mRNA:n kanssa?

 Avainaminohapot, jotka tukevat RNA-sitomisaktiivisuutta ovat VP30 proteiinin  aminohappotähteissä 26-40, arginiinipitoisessa alueessa. . Vuonna 2009 osoitettiin  VP30-RNA interaktio  VP30 proteiinin N-terminaalista (Groseth A et al.)