CIRCOVIRIDAE, Genus Circovirus. uusi Cyclovirus 2010

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3810929/

Eräs Anellovirus, SEN- virus

 SEN- VIRUS.  "VERENSIIRTOVÄLITTEISEN VIRUKSEN"  EPIDEMIOLOGIAA JA LUONNEHDINTAA. Otan tämän erikseen, jota saa jonkinlaista käsitystä tällaisestakin  viraalista geneettisestä materiaalista.

• LÄHDE:  http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15987351

Transfusion. 2005 Jul;45(7):1084-8. SEN virus: epidemiology and characteristics of a transfusion-transmitted virus.Akiba J, Umemura T, Alter HJ, Kojiro M, Tabor E. Author information

• SEN- virus tarttuu verestä. . Se on vaipaton ja sillä on   yksisäikeinen DNA. Vaikka sen prevalenssi vaihtelee alueittain, niin sitä on havaittu  jopa 30%.lla leikkauksen jälkeisen  verensiirron  saaneista potilaista verrattaessa niihin potilaihin (3%)  jotka eivät  tarvinneet postoperatiivista verensiirtoa.
  

SEN virus (SEN-V) is a blood-borne, single-stranded, nonenveloped DNA virus. Although its prevalence varies by geographic region, it has been detected in as many as 30 percent of postoperative transfusion recipients, compared to 3 percent of postoperative patients who did not receive transfusions.

•  Merkitsevää assosiaatiota on myös havaittu verensiirtovolyymin ja SEN-virusinfektion kesken. Tarttuminen verensiirron välityksellä on vahvistunut myös siitä havainnosta, että  verenluovuttajan ja veren siirron saajan  seerumien  SEN-virusten  keskeinen homologian aste  on 99%.

A significant association has been observed between transfusion volume and the occurrence of SEN-V infection. Transmission by transfusion also has been confirmed by the detection of greater than 99 percent homology between SEN-V in donor and recipient sera.

•  On dokumentoitu myös kilpailevia infektioita    kuten SEN- viruksen, hepatiitti B-viruksen, hepatiitti C- viruksen ja  HIV- 1-virusten aiheuttamia infektioita.  Tällaiset havainnot viittaavat  näitten virusten kuten SEN- viruksenkin välittyvän  verensiirron kautta. 

 Concurrent infections with SEN-V and hepatitis B virus, hepatitis C virus, or human immunodeficiency virus type 1 have been documented, and these observations probably reflect the blood-borne transmission of these viruses as well as SEN-V. 

• Vaikka SEN-virus alunperin löydettiinkin etsittäessä  syitä verensiirron jälkeiseen  hepatiittiin , ei ole kuitenkaan mitään näyttöä siitä, että SEN-virus aiheuttaisi hepatiittia tai pahentaisi samanaikaisen maksasairauden kulkua. Siitä huolimatta SEN- virus näyttää välittyvän verensiirrossa ja  sen tulevaisesta roolista tarvitaan  tutkimuksilla saatavaa lisävalaistusta.

Although SEN-V was discovered as part of a search for causes of posttransfusion hepatitis, there is no firm evidence so far that SEN-V infection either causes hepatitis or worsens the course of coexistent liver disease. Nevertheless, SEN-V appears to be transmitted by transfusion, and further studies may reveal more about its role in the future.

KOMMENTTI: Katsokaapa Anellovirusten tarkkaa systeemiä, jonne tämä SEN- virus sijoittuu. :http://eol.org/pages/11605601/names

NCBI Taxonomy view in classification

Species

Viruses + Ssdna viruses + Anelloviridae + Unclassified Anelloviridae + Small anellovirus Sen virus 4 more... show full tree...

CIRCOVIRIDAE, Vuoden 2013 tietoa systematiikasta . Huomaa TTV ja TTMV sijoitus Anellovirus-sukuun.

http://de.wikipedia.org/wiki/Circoviridae
Wikipedian saksalainen versio  esittää taxonomista nykysysteemiä  laajemmin.

• Genus Circovirus
  • Spezies Beak and feather disease virus (BFDV)
  • Spezies Kanarienvogel-Circovirus (CaCV)
  • Spezies Gänse-Circovirus (GoCV)
  • Spezies Tauben-Circovirus (PiCV), Erreger des Young Pigeon Disease Syndrome („Jungtaubenkrankheit“)
  • Spezies Porcines Circovirus-1 (PCV-1)
  • Spezies Porcines Circovirus-2 (PCV-2)

vorläufige Spezies innerhalb der Gattung:

• Spezies Enten-Circovirus (DuCV)
• Spezies Fink-Circovirus (FiCV)
• Spezies Möwen-Circovirus (GuCV)

• Genus Gyrovirus

• Spezies Hühneranämievirus (CAV)

nicht-klassifiziert innerhalb der Familie:

• Genus Anellovirus

• Spezies Torqueno-Teno-Virus (TTV) (5 Gruppen/Genotypen)

vorläufige Spezies innerhalb der Gattung:

• Spezies Torqueno-Teno-Mini-Virus (TTMV) (13 TTMV-Spezies)
• Spezies Katzen-Torqueno-Teno-Virus (TTV4-Fc)
• Spezies Hunde-Torqueno-Teno-Virus (TTV10-Cf)
• Spezies Nachtaffen-Torqueno-Teno-Virus (TTV3-At)
• Spezies Schweine-Torqueno-Teno-Virus (TTV31-Sd)
• Spezies Tamarin-Torqueno-Teno-Virus (TTV2-So)
• Spezies Tupaia-Torqueno-Teno-Virus (TTV14-Tbc)

Literatur

• C.M. Fauquet, M.A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, London, San Diego, 2004
• David M. Knipe, Peter M. Howley et al. (eds.): Fields´ Virology, 4. Auflage, Philadelphia 2001

Weblinks

• Circoviridae: Genera und Spezies (NCBI)
• Genus Anellovirus: Spezies (NCBI)

CIRCOVIRIDAE, Anellovirus, TT-virus (Vuoden 2007 tietoa)

Rev Med Virol. 2007 Jan-Feb;17(1):45-57. Torque teno virus (TTV): current status.

Hino S, Miyata H.

Author information

TIIVISTELMÄ (Abstract)

•  Nykyisin tämä alunperin potilaan T.T. nimestä  nimensä saanut, sittemmin Torque teno-virus on nimetty Anellovirukseksi ja Circoviridae ryhmään, sellaisiin joiten ss  DNA on rengas ( anello latinaksi)  Ensiksi sitä luultiin  non-A-E- hepatiittivirukseksi.

Torque teno virus (TTV), currently classified into the family Circoviridae, genus Anellovirus, was first found in a patient with non-A-E hepatitis. 

• TTV omaa  yksinkertaisen DNA-säikeisen sirkulaarisen genomin, kooltaan on  noin 3.2 kb . Se on  erittäin diversi ja siinä on viisi ryhmää, kuten SANBAN virukset  ja SEN-virukset.

 TTV has a single stranded circular DNA of approximately 3.8 kb. TTVs are extraordinarily diverse, spanning five groups including SANBAN and SEN viruses. 

•  Torque teno miniviruksella (TTMV) on 2.9 kb genomi ja silläkin on  laajalti variantteja.  Tähän virusyhteisöön on liitetty äskettäin vielä kaksi uutta jäsentä, niiden koko on 2.2 kb ja 2.6 kb. . Näitten varianttien keskeiset rekombinaatiot ovat yleisiä.

Torque teno mini virus (TTMV) with approximately 2.9 kb genome also has wide variants. Recently, two related 2.2- and 2.6-kb species joined this community.  Recombinations between variants are frequent.

•  TT- virusten laaja-alainen diversiteetti  on edelleen selvittämättä. on epäselvää, miten TT-virukset  voivat olla elinkykyisiä ja miksi ne vaativat niin laajaa variabiliteettia. 

 This extensive TTV diversity remains unexplained; it is unclear how TTVs could be viable, and why they require such genetic variation.

•  Yksiselitteisiä viljelyjärjestelmiä ei ole vielä saatavilla. TT- virukset ovat yleisiä yli 90%.ssa  aikuisista  ihmisistä   maailmanlaajuisesti, mutta  ei ole voitu täysin osoittaa mitään ihmispatogenisyyttä

 An unequivocal culture system is still not available. TTVs are ubiquitous in > 90% of adults worldwide but no human pathogenicity of TTV has been fully established. 

•  Epidemiologisin kartoituksin  tarvitsee spesifioida  tutkitut variantit ja kliiniset kohteet ja käytetyn menetelmän sensibiliteetti pitää kalibroida.

Epidemiological surveys need to specify the variants being studied and clinical targets, and must calibrate the sensitivity of the assay used.

•  Mahdollisiin kiinnostaviin havaintoihin kuuluu suurempi viruskuorma sellaisilla potilailla, jotka sairastavat  vaikeaa idiopaattista tulehduksellista myopatiaa, syöpää tai punahukkaa.

 Potentially interesting observations include a higher viral load in patients with severe idiopathic inflammatory myopathies, cancer and lupus.

•  Aktiivia  viruksen replikoitumista  on havaittu myös vauvoissa, joilla on  akuutteja hengitystietauteja.

Active replication was also found in infants with acute respiratory diseases.

• Eläimillä on TTV ja TTMV virusten kaltaisia viruksia havaittu simpansseilla, apinoilla, Afrikan  marakateilla ja tupaijoilla ( puupäästäisillä), sekä myös  kanapojilla, porsailla, lehmillä, lampailla ja koirilla.  http://fi.wikipedia.org/wiki/Tupaijat

TTV/TTMV-related viruses were found in chimpanzees, apes, African monkeys and tupaias, and also in chickens, pigs, cows, sheep and dogs.

•  Kokeellisesti saatiin Rhesus-apina infektoitumaan TTV:llä, mutta simpanssia ei saatu infektoitua (paitsi  yksi  1/53)

Experimentally, rhesus monkeys were persistently infected by TTV, but only 1/53 chimpanzees.

• TT- virus  transkriboi  kolmea mRNA-lajia 3.0 kb, 1.2 kb ja 1.0 kb suhteessa 60: 5: 35.

 TTV transcribes three species of mRNAs, 3.0-, 1.2- and 1.0-kb in the ratio of 60:5:35.

•  Äskettäin on osoitettu kananpojan anemiaviruksessa ainakin  kolmea mRNA.ta. Genominen alue -154 /- 76 sisältää kriittisen promootorin. TT-viruksella  näyttää olevan ainakin kolme proteiinia, joitten funktioitten määrittäminen on  jatkotutkimusten vaassa.

Recently, at least three mRNAs were shown in chicken anaemia virus. The genomic region -154/-76 contains a critical promoter. TTV seems to have at least three proteins; however, the definite functions of these proteins await further research work.
Copyright 2006 John Wiley & Sons, Ltd.