FAO kertoo yli 12 AIV lintuvirusversiosta

http://afludiary.blogspot.com/search?q=Egypt

Although we generally talk about the H5N1 bird flu as if it were a single entity – in reality there have been more than a dozen clades of the virus identified - with numerous variants within each clade.

Tässä käytetään näistä eri lintuviruskokoomuksista CLADE sanaa,saman viruksen eri pukeutumismuotoa.

Ja jokaisessa kuosissa on lisäksi lukuisia variantteja, erilaisia versioita.Tämä tietysti on tiedemiehille suuri haaste, koska jokaista tulee arvioida pandemian mahdollisuuden näkökulmasta.

Mutta yleisvaara on edelleen sama kuin vuodesta 2003 alkaen , pandemian varoitusaste valveusaste: 3. Siitä tuskin menee virus takaisinpäin olemattomuuteen.

Joka tapauksissa linnuille nuo ovat vaaroja.

WHO noteeraa lintuviruksesta seuraavaa

Evolution of H5N1 avian influenza virus does not increase risk to public health

http://www.who.int/influenza/human_animal_interface/avian_influenza/h5n1-2011_08_30/en/index.html

30 August 2011 -- WHO closely monitors the evolution of influenza viruses and is aware of recent reports of an H5N1 virus (described as H5N1 clade 2.3.2.1) circulating in poultry in parts of Asia. Based on available information, this evolution of the H5N1 virus poses no increased risk to public health. It is not considered unusual because influenza viruses are constantly evolving, especially in areas where they circulate regularly in poultry.

The WHO Global Influenza Surveillance and Response System, the group of experts that studies animal and human influenza viruses that may impact human health, recognized this new clade in February 2011.

WHO also routinely assesses the public health risk from all animal influenza viruses. Based on available information, the identification of this newly-reported H5N1 virus clade does not change the current public health implications of the H5N1 avian influenza viruses for humans. Human cases of H5N1 infection remain rare and sporadic events, occurring mostly in areas where H5N1 viruses circulate regularly in poultry. Human cases could occur wherever the viruses are present in poultry and when humans might be exposed to infected birds or contaminated environments.

Taas siitä lintuviruksesta

Varmuuden vuoksi alan ottaa PubMed Serveristä uusimmat artikkelit mitä lintuviruksesta annetaan internetiin.
Results: 1 to 20 of 4193
1.

Avian influenza A(H5N1) in humans: new insights from a line list of World Health Organization confirmed cases, September 2006 to August 2010.

Fiebig L, Soyka J, Buda S, Buchholz U, Dehnert M, Haas W.

Euro Surveill. 2011 Aug 11;16(32). pii: 19941. No abstract available.

PMID:
21871222
[PubMed - in process]

2.

Host Regulatory Network Response to Infection with Highly Pathogenic H5N1 Avian Influenza Virus.

Li C, Bankhead A 3rd, Eisfeld AJ, Hatta Y, Jeng S, Chang JH, Aicher LD, Proll S, Ellis AL, Law GL, Waters K, Neumann G, Katze MG, McWeeney S, Kawaoka Y.

J Virol. 2011 Aug 24. [Epub ahead of print]

PMID:
21865398
[PubMed - as supplied by publisher]

Related citations
3.

H5N1 virus-like particle vaccine elicits cross-reactive neutralizing antibodies in humans that preferentially bind to oligomeric form of influenza hemagglutinin.

Khurana S, Wu J, Verma N, Verma S, Raghunandan R, Manischewitz J, King LR, Kpamegan E, Pincus S, Smith G, Glenn G, Golding H.

J Virol. 2011 Aug 24. [Epub ahead of print]

PMID:
21865396
[PubMed - as supplied by publisher]

Related citations
4.

Naturally occurring antibodies in a human can neutralize a broad spectrum of influenza strains including H3, H1, H2 and H5.

Ohshima N, Iba Y, Kubota-Koketsu R, Asano Y, Okuno Y, Kurosawa Y.

J Virol. 2011 Aug 24. [Epub ahead of print]

PMID:
21865387
[PubMed - as supplied by publisher]

Related citations
5.

A Duck Enteritis Virus-vectored Bivalent Live Vaccine Provides Fast and Complete Protection against H5N1 Avian Influenza Virus in Ducks.

Liu J, Chen P, Jiang Y, Wu L, Zeng X, Tian G, Ge J, Kawaoka Y, Bu Z, Chen H.

J Virol. 2011 Aug 24. [Epub ahead of print]

PMID:
21865383
[PubMed - as supplied by publisher]

Related citations
6.

Evaluation of a virosomal H5N1 vaccine formulated with Matrix M™ adjuvant in a phase I clinical trial.

Cox RJ, Pedersen G, Madhun AS, Svindland S, Sævik M, Breakwell L, Hoschler K, Willemsen M, Campitelli L, Nøstbakken JK, Weverling GJ, Klap J, McCullough KC, Zambon M, Kompier R, Sjursen H.

Vaccine. 2011 Aug 19. [Epub ahead of print]

PMID:
21864624
[PubMed - as supplied by publisher]

Related citations

Uusi pandeminen influenssa kytee WHO:n 3 asteessa

Eteläistä lintuinfluenssaa seurataan mahdollisena uuden pandemian aiheuttajaviruksena (A H5N1) mutta on muitakin joita seurataan. Tämä A H5N1 on pandemisessa valvonta-asteikossa tasolla 3 edelleen.
Nythän sikainfluenssavirus AH1N1 on kulkenut läpi koko asteikon ja alkanut liittyä kausi-influenssoihin ja niiden rokotteisiin normaaliantigeenina.
Jos haluaa seurata lintuinfluenssan tilannetta, WHO ja FAO lähteissä on niille kolumninsa. Avian flu

Suoraan sanoen.

Lintuvirus A H5N1 alkaa huolestuttaa.

OIE lähdettä pitää seurata nyt ainakin kerran kuukaudessa.

Siitä tuleva pandemia tulee olemaan siten tosiaankin pandemia. Tämä A H1N1 sikainfluenssa on vain lievä uusi virus.

Ja miksi villit linnut nyt alkavat olla immuunivasteeltaan niin heikkoja että tippuvat siellä täällä ilman että tunnettua virusta on osoitettavissa. Onko niissä tuntematon virus, jota ei voida saada havaittua?

HLH:n kaltainen reaktiotapa lintuinfluenssassa. Tekstiä 4 vuoden takaa.

Tanskalainen teksti vuodelta 2006:

Offentliggjort 2. marts 2006 13:23 - opdateret 15:43 Kemoterapi mod fugleinfluenza hos mennesker Af ULLA NØRBY

Den samme kemoterapi, som bruges mod en sjælden immun-sygdom, kan formentlig sættes ind mod mennesker, som rammes af fugleinfluenza.JP extraRelaterede artikler

Fugleinfluenza tæt på Lolland

Forbudt at tage vilde fugle i pleje

Tag telefonen og spørg om fugleinfluenza

Forbrugerminister afviser hønsekontrol

Kat i Tyskland smittet med H5N1

S: Hobbyhøns skal kontrolleres

Fødevarestyrelsen: Det kunne have været her

Sverige bekræfter første tilfælde af H5N1

Fugleinfluenza er kommet for at blive

Fugleinfluenzaen har spredt sig til Bayern

[Se alle]Svenske forskere på Karolinska Hospitalets afdeling for børnekræft har ifølge tidsskriftet The Lancet måske fundet det våben, der kan vise sig effektiv mod den fugleinfluenza, som læger frygter kan mutere, så den smitter fra menneske til menneske. Det er ikke sket endnu, men mere end halvdelen af de ramte 173 mennesker menes døde efter kontakt med inficerede fugle og fjerkræ, skriver Bloomberg. I samarbejde med kolleger i Hong Kong har svenskerne undersøgt menneskelige ofre for fugleinfluenzaen og hos dem fundet symptomer og sygdomsbilleder, der matcher mennesker med den såkaldte HLH.

HLH er en sjælden og ofte dødelig sygdom især hos børn, og den ødelægger blodceller og kan medføre organsvigt.

Lederen af de svenske undersøgelser, professor Jan-Inge Henter, erkender, at kemoterapi mod influenza kræver et stort tankespring i synet på behandling. Derfor kan det alligevel være det rigtige, siger han.

Sytokiinimyrsky. kertausta A/H5N1 tavoista

Mikrobiyol Bul. 2008 Apr;42(2):365-80. [Cytokine storm in avian influenza]

Us D.

Hacettepe Universitesi Tip Fakültesi, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dali, Ankara. durdalus@hacettepe.edu.tr

Abstract

The most dramatic example of defining the pathogenicity of influenza virus A/H5N1 strains is the higher fatality rate of avian influenza epidemic (>50%) occured in Southeast Asia in 1997 comparing to the pandemic caused by influenza virus A/H1N1 in 1918 (5-10%) which was recorded as the most destructive pandemic in the world. When considering the fatal/total case numbers (208/340) reported by World Health Organization in respect of December 14th, 2007, the mortality rate has now reached to 61 percent. Recent studies have shown that the high fatality rate of avian influenza virus infections is a consequence of an overactive inflammatory response and the severity of infection is closely related with virus-induced cytokine dysregulation. The most important feature of A/H5N1 immunopathogenesis is the appearence of hypercytokinemia ("cytokine storm") which is characterized by the extreme (exaggerated) production and secretion of large numbers and excessive levels of pro-inflammatory cytokines. This phenomenon is blamed on the emergence of lethal clinical symptoms such as extensive pulmonary oedema, acute bronchopneumoniae, alveolar haemorrhage, reactive haemophagocytosis, and acute respiratory distress syndrome, associated with necrosis and tissue destruction. Numerous in vitro, in vivo and clinical studies have pointed out that A/H5N1 viruses are very strong inducers of various cytokines and chemokines [Tumor Necrosis Factor (TNF)-alpha, Interferon (IFN)-gamma, IFN-alpha/beta, Interleukin (IL)-6, IL-1, MIP-1 (Macrophage Inflammatory Protein), MIG (Monokine Induced by IFN-gamma), IP-10 (Interferon-gamma-Inducible Protein), MCP-1 (Monocyte Chemoattractant Protein), RANTES (Regulated on Activation Normal T-cell Expressed and Secreted), IL-8], in both humans and animals. The privileged cells of cytokine storm are macrophages and CD8+ T-lymphocytes, while the primary contributor cytokines are TNF-alpha, IL-6 and IFN-gamma. It has been detected that, mutations of some viral genes (NS1, PB2, HA and NA) are responsible for the cytokine storm, by increasing the viral replication rate, expending the tissue tropism, facilitating the systemic invasion and emerging of resistance against the host antiviral response. It has been shown that Glu92 and Ala149 mutations, and carboxyl-terminal ESEV/EPEV motif of NS1 protein have been implicated as determinants of virulence for A/H5N1 strains. In addition, Lys627 mutation in PB2 protein, polybasic aminoacid mutations in the cleavage region of hemagglutinin (HA) polyprotein, and glycosylation and sialylation mutations in HA and neuraminidase (NA) proteins were found to enhance the immune-mediated patology of highly virulent A/H5N1 strains. In this review article, the immunopathogenesis of influenza infection and the mechanisms of cytokine storm caused by influenza A/H5N1 viruses have been discussed under the light of recent literature.

PMID: 18697437 [PubMed - indexed for MEDLINE]

Ps. Alan kerrata A/H5N1 sytokiinimyrskyn tapoja, koska viimeisen, elokuisen, WHO päivityksen mukaan kumuloituu edelleen A/H5N1 ihmistapauksia ja kuolleisuus näistä on yli 50 %. Noin 500 tapausta ja 300 näistä menehtyi. Lintuinfluenssaa ilmeisesti alkaa endeemisesti olla pinttyneenä muutamissa maissa, jossa ei ole saatu lintusaneerausta vietyä läpi. Sairastumisest vaikutavat edelleen johtuvan suuresta virusmäärästä ja lähikontaktista sairaaseen lintuun tai suurten virusmäärien syömisestä.

A H5N1 ja muut EPI aktuellit uutiset 3.6. 2010

Lintuinfluenssan tilanne AH5N1
Lintuinfluenssan tarkkailu on jatkunut kautta vuosien aivan rutiinisti ja nyt kun tuo sikainfluenssaperäinen pandeminen virus A H1N1 näyttää pitävän paussia, alkaa tulla esiin AH5N1 tietojen relevanssikin kuin syksyn ruska kesän vehreyden klorofyllin vähetessä.
A H5N1 on edelleen tavallinen lintumaailmassa, eikä ole osoittanut pystyvänsä leviämään ihmiskuntaan sen kummemmin kuin ennenkään.

A H5N1 viruksen vaarallisuus siinä ihmisessä, joka siihen sairastuu on vakava-asteinen.
Viime vuonna 2009 infektoitui maailmassa 73 henkilöä ja heistä 32 kuoli. mortaliteetti on siis prosentuaalisesti heissä 43.8 %, siis miltei puolet. Hoidon ehtivyyttä ja kombinoimista ja kokonaisratkaisua ei ole löydetty siinä muodossa, että voitaisiin pelastaa henkiin näitä infektoituneita. Joten asia on HYVIN AKTUELLI tieteen pöydällä, sillä virus LUONNOLLISESTI etsii tietä ihmiskuntaa, . vaikka sen etsintä veisi kymmenen vuotta. Lintuperäiset virukset omaavat RNA-materiaalissaan jonkin evolutionaalisesti pakottavan tarpeen vahvistaa genomiaan ihmisperäisellä materiaalilla, muuten virus voi kuolla, terminoitua syklissään ja siinä tapauksessa se häviää ennen aikojaan maapallolta repertoituessaan ilman ihmiskuntaa. Tässä on tärkeä edelleen hävittää sairastunutta lintukantaa, joka toimii viruksen kehtona ja riehumispaikkana, sekä tehdä terveitten villilintujen kontrolleja, koska niissä siirtyy A H5N1 ilman, että ne ovat sairaita tai antaisivat mitään oiretta. Asiaa ei saa unohtaa.

MITÄ SANOO EPI akutellt?

Under 2009 infekterades 73 personer varav 32 avled. I år (2010) har 30 personer infekterats varav 12 har avlidit. Eftersom de flesta fallen brukar inträffa under vårvintern indikerar detta inte någon säker ökning av antalet fall jämfört med 2009. Merparten av alla fall under de senaste åren har inträffat i Egypten, följt av Indonesien. Det finns en tendens mot lägre dödlighet i Egypten jämfört med Sydostasien (tabell 1). Varför dödligheten är lägre i Egypten är oklart, men det kan bero på såväl virus och värd som hur patienterna behandlats. Bland annat är tidigt insatt antiviral terapi är viktigt för att förhindra dödsfall i fågelinfluensa A/H5N1

EPI-aktuellt, vol 9, nr 22 (3 juni 2010)

Nuläget för fågelinfluensa A/H5N1

H5N1 fortsätter att cirkulera i världen trots mindre massmedial uppmärksamhet. Det finns mycket få rapporter om smittkedjor mellan människor och inga virologiska fynd som talar för att risken för att H5N1-viruset anpassas till människor ökat, men infektionen är fortfarande utbredd bland tam- och vildfågel i Sydostasien.

• Nuläget för fågelinfluensa A/H5N1
• Minskad antibiotikaanvändning men förvärrat resistensläge 2009
• Färre klamydiafall rapporterade 2009
• Med både hängslen och livrem
• Senaste publikationerna från ECDC
• Länkar till andra smittskyddsnyheter

Uusia antivirusstrategioita tulevaisuudessa

LÄHDE:

Gong J, Fang H, Li M, Liu Y, Yang K, Liu Y, Xu W. Potential targets and their relevant inhibitors in anti-influenza fields. Curr Med Chem. 2009;16(28):3716-39. Department of Medicinal Chemistry, School of Pharmaceutical Sciences, Shandong University, Jinan, Shandong, China.

INFLUENSSA on tauti, joka iskee vahvasti miljooniin ihmisiin vuosittain Äskettäin on jälleen pohdittu patogeenisen A H5N1 lintuinfluenssaviruksen merkitystä ja sen mahdollista pandemista potentiaalia ihmiskunnassakin.

Sitä myöten kun viruksia koskeva biologia kehittyy, löytyy yhä useampia antivirusstrategioita näitä viruksia kohtaan.

Otsikon artikkelissa tehdään katsausta, jossa pohditaan useita jo aiemmin kokeiltuja sekä mahdollisia anti-influenssalääkekohteita, joihin kuuluu

• virustekijöitä kuten HA, hemagglutiniini, M2 jonikanavaproteiini, RNA:sta riippuva RNA-polymeraasi RdRp, nukleoproteiini NP, nonstrukturelli proteiini NS ja neuraminidaasi NA

• isäntäkehoon kuuluvia tekijöitä ( kuten v-ATPaasi, inosiinimonofosfaattidehydrogenaasi, IMPDH ja intrasellulaariset signaalikaskadit )

• näiden relevantteja estäjiä eli inhibiittoreita.

Edelleen PA alayksikön merkityksestä A H5N1 viruksessa

Jotta voi arvioida geeni 3:n roolin käytännössä, pitää katsoa aiempia tutkimuksia PA proteiinin merkityksestä.

LÄHDE: Kashiwagi T, Leung BW, Deng T, Chen H, Brownlee GG.The N-terminal region of the PA subunit of the RNA polymerase of influenza A/HongKong/156/97 (H5N1) influences promoter binding.PLoS One. 2009;4(5):e5473. Epub 2009 May 7. Oxford, Oxford, UK.

N-terminaalinen alue PA alayksikössä eräitten yllämainittujen A-influenssavirusten RNA-polymeraasissa vaikutti promoottoriin sitoutumiseen.

TAUSTA: Influenssaviruksen RNA-polymeraasi on heterotrimeerinen kompleksi, jossa on alayksiköt PB1, PB2 ja PA. Ne tekevät yhteistyötä, saadakseen ensin transkriboitua viruksen RNA-mallisen koodin ja sitten replikoitua virusgenomia. Ne vastaavat geneettisestä puolesta viruksen lisääntymistoiminnassa.

Aiemmin on pystytty osoittamaan, että influenssan PA- alayksikön N-terminaalinen alue eräässä viruksessa A/WSN/33 (H1N1) oli mukana promoottoriin sitoutumiasiassa.Tutkijat halusivat laajentaa tätä näkemystä ja ottivat seuraavia viruskantoja tutkimuksiinsa:

A/HongKong/156/97 (H5N1) ( Ihmisestä eristetty H5N1 vuonna 1997)

A/Vietnam/1194/04 (H5N1) ( Ihmisestä eristetty H5N1 vuonna 2004).

He havaitsivat että molemmissa H5N1 viruskannoissa oli vahvemmin aktiivi polymeraasi, kun verrattiin kahteen klassiseen ihmisen influenssaviruskantaan A/WSN/33 (H1N1) ja A/NT/60/68 (H3N2) koeputkiolosuhteissa.

Tämä lisääntynyt polymeraasiaktiivisuus liittyi promoottoriin sitoutumisasiaan.

Pääasiallinen merkitsijä tässä asiassa oli PA alayksikön N-terminaalinen alue, mistä johtuen promoottiriaktiivisuus lisääntyi.

JOHTOPÄÄTÖS, ASIAN MERKITSEVYYS: Tutkijat ovat sitä mieltä että nykyisten A H5N1 kantojen PA-alayksikön N- terminaali vaikuttaa promoottoriin sitoutumiseen ja he pohtivat mikä tämän merkitys on kantojen virulenssissa .
Overall we suggest that the N-terminal region of the PA subunit of two recent H5N1 strains can influence promoter binding and we speculate this may be a factor in their virulence.

Kommenttini: Ehkä olisi syytä katsoa lintuviruksen N-terminaalinen jakso PA alayksiköstä ja verrata jaksoa norjalaiseen virukseen, joka on tämä pandeminen A H1N1, sillä sen PA alayksikkö on niitä, jotka johtuvat suoraan lintukannasta sikakantaan ilman humaani-influenssavälimuotoa historiassaan. Jos pikaisesti vertailen PubMed lähteen sekvenssejä A H5N1 puhtaan lintuviruksen segmenteihin, poikkeavuus on melkoinen harppaus. En pysty arvioimaan tällaista koska nyt vasta olen alkanut niitä hieman katsella. Koetan etsiä valmiita PubMed artikkeleita , meta-analyysejä, analyysejä.

PB2, PB1-F2 ja M2 geenit: Lajirajan ylitys

Pohdinta pandemisesta potentiaalista koskien HN virusgeenejä ja proteiineja PB2, PB1-F2, M2

1. UUTTA TIETOA VUODELTA 2008
MITEN H5N1 PB2-geeni on evoluutiossaan nykyisin?

LÄHDE: Miotto O et al. Identification of human-to-human transmissibility factors in PB2 proteins of influenza A by large-scale mutual information analysis. BMC Bioinformatics. 2008;9 Suppl 1:S18.

Kun taistellaan jotain patogeenia vastaan, on olennaisen tärkeää pystyä identifioimaan niitä mutaatioita, jotka antavat patogeenille ainutlaatuisia ominaisuuksia, kuten kykyä tunkeutua tiettyihin isäntälajeihin.Tässä työssä tutkijat vertailevaa analyysiä käyttämällä kuvaavat erästä uutta metodia, jolla voi identifioida aminohappokohtia, jotka ovat ominaisia spesifisille proteiinisekvensseille. He kehittivät AVANA-software pehmotavaraa. (AVANA software utilizes sequence annotations to select sets for comparison, according to user-specified criteria.) He sovelsivat tätä metodia analysoiden influenza A viruksen PB2- proteiinin sekvenssejä. He identifioivat komponentteja, joissa oli tapahtunut adaptaatio (sopeutuminen) ihmisestä toiseen välittyvään tartuntatapaan ja sitten he rekonstruoivat tapahtuman mutaatiohistorian.

TULOKSET. Tutkijat vertailivat yli 3000 kpl influenssaviruksen PB2 sekvenssiä ihmistartunnoista ja lintuisolaateista. Tässä analyysissä identifioitui 17 karakteristista kohtaa, joista viisi on esiintynyt niissä ihmisiin tarttuneissa kannoissa, joita on ollut olemassa jo vuoden 1918 Espanjan taudista asti. 16 näistä mainituista kohdista sijaitsee funktionaalisissa domaaneissa, mikä viittaa siihen, että niillä voi olla osuutta isäntälajispesifisyydessä. Karakterististen kohtien luetteloa käytettiin seulottaessa esiin sekvenssejä historiallisista isolaateista . Näitä tyyppijälkiä sitten järjestettiin kronologisesti ja havaittiin, miten evoluutionaalisessa aikajanassa PB2 proteiini adaptoituu ihmiseen.

Tämä tutkimus osoittaa, että keskeinen, monipuolinen informaatio on vahva työväline sekvenssisettien vertailevassa analyysissä, kun tällöin on saatavilla täydellisintä selkotietoa niistä funktionaalisista komponenteista, jotka osallistuvat PB2-proteiinin adaptaatioon ihmiskuntaan päin. Tutkijat pystyivät vahvistamaan aiemmin raportoituja löytöjä ja lisäksi monia uusia karakteristisia kohtia H5N1 viruksen PB2:ssa tuli raportoitua. Karakterististen kohtien luetteloa käyttämällä generoituneet sekvenssijäljet luonnehtivat suppeasti yksittäisten virusisolaattien adaptoitumisen tyyppiominaisuuksia. Näistä varhaisista ihmis-influenssavirusten ”jäljistä”selvitetty evolutionaalinen aikajana viittaa siihen, että ominaispiirteiden variantit kehittyvät nopeasti ja pysyvät sitten huomattavan stabiileina kautta myöhempien pandemioitten.

Tämän lisäksi tutkijat sanovat, että ihmisiä infektoivien H5N1 virusisolaattien antamat ”jäljet” viittaavat siihen, että tämä lintuviruksen alatyyppi omaa nykyisellään vain matala-asteisen pandemisen potentiaalin, vaikkakin sillä on enemmän ihmiseen adaptoituneita komponentteja kuin useimmilla muilla lintuvirusalatyypeillä.

In addition, the signatures of human-infecting H5N1 isolates suggest that this avian subtype has low pandemic potential at present, although it presents more human adaptation components than most avian subtypes.

2. TIETOA VUODELTA 2006
Geenien M2 ja PB1-F2 osallistuminen adaptaatioon.

LÄHDE: Smith GJ. Evolution and adaptation of H5N1 influenza virus in avian and human hosts in Indonesia and Vietnam. Virology. 2006 Jul 5;350(2):258-68. Epub 2006 May 19.

Nyt (vuonna 2006) on korkeastipatogeeninen HPAIV H5N1 jo endeemisenä Etelä ja Kaakkois-Aasiassa siipikarjassa ja taudinpurkauksia esiintyy leviävänä Keski-Aasiassa, Euroopassa ja Afrikassa. Lajirajan ylittämisiä tapahtuu jatkuvasti ihmiseen päin- (tosin melkoisen vähäisessä määrin verrattuna populaation totaali määriin) Vietnamissa , Thaimaassa, Kambodjassa, Indonesiassa ja Kiinassa, mikä herättää ajatuksia pandemisesta kehityksestä.

Tutkijaryhmä alkoikin geneettisesti luonnehtia 82 kpl H5N1 virusta, joita oli kerätty siipikarjasta kautta Indonesian ja Vietnamin ja 11 kpl oli eristetty ihmisistä E- Vietnamissa. Yleisiä tietueita hyödynnettiin, jotta saatiin käsitystä näiden virusten tarttumisista, endeemisyydestä ja evoluutiosta. Fylogeneettisesti kaikki indonesialaiset virukset olivat H5N1 Z-genotyyppiä, mikä viittaisi yksittäiseen alkutartuntaan, joka sitten oli levinnyt maassa kauttaaltaan parissa vuodessa.

Jatkuvat virusaktiviteetit Indonesiassa johtuvat lähinnä siipikarjalintujen siirtelemisestä maan rajojen sisällä ennemminkin kuin muuttolintujen liikehdinnästä. Indonesiassa ja Vietnamissa H5N1 virukset ovat tehneet evoluutionsa geograafisesti erotettaviin ryhmiin kummassakin maassa .

Kun analysoitiin H5N1- viruksen genotyypin Z-genomia, osoittautui, että vain M2 ja PB1-F2 geenit olivat positiivisesti valiutuvia, mikä viittaa siihen, että nämä geenit osallistuisivat tämän viruksen adaptaatioihin uusiin isäntiin lajirajan ylittävissä transmissioissa. Aminohappotasossa 12 aminohappoa oli positiivisesti valiutuvia näissä genotyyppi Z- viruksissa HA ja PB1-F2 proteiineissa. Muutamia näistä aminohapoista oli useammin tavattavissa ihmisistä eristetyissä viruksissa kuin linnuista eristetyissä ja ne korreloivat viruksen antigeenisyyteen ja reseptoriin sitoutumiseen. Tutkimuksessa saatiin oivallusta H5N1-viruksen käynnissä olevasta evoluutiosta sen välittyessä eri lintulajeihin ja myös lajirajan ylittämisiin linnuista ihmis-isäntiin päin.

3. TIETOA VUODELTA 2004
H5N1 genotyyppi Z

H5N1 genotyppi Z oli se korkeasti patogeeni (HPAIV) H5N1, joka riehui Kiinassa ja seitsemässä muussa maassa vuosina 2003-4. Nämä maat olivat Japani, E-Korea, Vietnam, Laos, Kambodja ja Indonesia. Tämä virus tappoi siipikarjaa miljoonittain, mutta myös välittyi ihmisiin ollen 54 % letaali infektoituneissa. Näistä ajoista genotyyppi Z alkoi olla dominantti Aasiassa. Tämä havaittiin ensiksi marraskuussa 2002 Hongkongissa ja se oli antigeenisesti erilainen kuin se virus, jonka havaittiin olleen letaali vesilinnuille 1997-2002.
Ihmisiä ja siipikarjaa vuonna 2004 Aasiassa infektoinut virus oli ”Z- genotyypin variantti”. Muuttolinnut olivat ilmeisesti siirtäneet virusta lopulta kautta Aasian.

LÄHDE:
Webster RG, The spread of the H5N1 bird flu epidemic in Asia in 2004. Arch Virol Suppl. 2005;(19):117-29.

Li KS. Genesis of a highly pathogenic and potentially pandemic H5N1 influenza virus in eastern Asia. Nature. 2004 Jul 8;430(6996):209-13.

4. MIGRATIONMAP

http://www.newsdesk.umd.edu/images/flumigrationmap.gif

5. KUVA VIRUKSEN 8 GEENISTÄ

http://www.nature.com/nrmicro/journal/v2/n10/images/nrmicro979-f

6. KUVA viruksen GEENITUOTTEISTA, PROTEIINEISTA

http://www.aasv.org/shap/issues/v13n3/v13n3p157t1.gif

http://content.answers.com/main/content/wp/en-commons/0/02/Flu_und_legende_color_c.jpg

20/03/2008 16:17 Pandemisuuspotentiaalin pohdintaa L Bright