Leta i den här bloggen

måndag 17 november 2014

Yksityiskohta VP30 toiminnasta transkriptiotekijänä (Kuva)

thumbnail Figure 7. Model for EBOV RNA editing. The EBOV RNA-dependent RNA polymerase (L) transcribes vRNA into mRNA. A stem-loop structure in the mRNA directly upstream of the primary editing site causes the polymerase to pause, and enables insertion of non-templated adenosine residues due to stuttering. VP30 then resolves the stem loop, and allows continued faithful transcription. doi:10.1371/journal.ppat.1003677.g007
 http://www.plospathogens.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.ppat.1003677

VP30 on vahvasti asidofiilinen proteiini ja tulee tehkkaammaksi kun pH laskee. Zn++ lisää sen aktiivisuutta. Jota  VP30 voisi tehosta RNA-transkriptiota  mRNA-rungon lenkki tarvitaan nukleotidin 54-80 leader-alueessa.
VP30:n sitoutumisaktiviteetti  yksittäiseen runkolenkkiin tai dsRNA-muotoon on matala, mutta hyvä jos lenkki sijaitsee  alavirta- tai ylävirtasegmentissä.

Mikä alue VP30 proteiinissa tekee interaktion mRNA:n kanssa?

 Avainaminohapot, jotka tukevat RNA-sitomisaktiivisuutta ovat VP30 proteiinin  aminohappotähteissä 26-40, arginiinipitoisessa alueessa. . Vuonna 2009 osoitettiin  VP30-RNA interaktio  VP30 proteiinin N-terminaalista (Groseth A et al.)

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar