Leta i den här bloggen

måndag 24 november 2014

Furiinin ja ADAM17(TACE) entsyymien osuus EBOV GP-prosessoinnissa

lähde: EBOV GP (PubMed, protein) REFERENCE 8

 (residues 1 to 676)

  AUTHORS   Volchkov,V.E., Feldmann,H., Volchkova,V.A. and Klenk,H.D.
  TITLE     Processing of the Ebola virus glycoprotein by the proprotein
            convertase furin
  JOURNAL   Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95 (10), 5762-5767 (1998)
   PUBMED   9576958
  REMARK    PROTEOLYTIC PROCESSING OF ENVELOPE GLYCOPROTEIN.
 
 
 
 [PTM] Specific enzymatic cleavages in vivo yield mature proteins.

 The precursor is processed into GP1 and GP2 by host cell furin in the trans Golgi, and maybe by other host proteases, to yield the mature GP1 and GP2 proteins.
The cleavage site corresponds to the furin optimal cleavage sequence [KR]-X-[KR]-R. This cleavage does not seem to be required for function.
 Figure 7

 
 
  • GP2 eroaa GP1:sta  501K ja 502E aminohappojen välistä FURIININ avulla.

Site 501..502 (-re-) ( kohta jossa on Arg/ Glu 

/gene="GP" /site_type="cleavage" /experiment="experimental evidence, no additional details recorded" /note="Cleavage; by host furin."

Region 502..676 (-eaivnaqpk cnpnlhywtt qdegaaigla wipyfgpaaegiyieglmhn qdglicglrq lanettqalq lflrattelr tfsilnrkai dfllqrwggt chilgpdcci ephdwtknit dkidqiihdf vdktlpdqgd ndnwwtgwrq wipagigvtg viiavialfc ickfvf)

/gene="GP" /region_name="Mature chain" /experiment="experimental evidence, no additional details recorded" /note="GP2. /FTId=PRO_0000037487." 

  • Tämä FURIINILLA  irti pilkottu  osa  502-676 prosesoituu edelleen. 
 Alkuosa  runsaasta, glykocalix  materiasta( musiinin kaltaisesta  lisukkeesta)  jota  GP1 kantaa,  sievistyy  pois entsyymeillä; eihän GP1 ankkuroidu kalvopintaan itse ollenkaan.  Se tekee  vain  pientä liitosta GP2 osaan ja  vain GP2 osassa on transmembraaninen ja lyhytsytosolinen osa C-terminaali. Myös GP1,2  pilkkoutuu vielä irti ankkurista  liukoiseksi osaksi  (ADAM17)- siinä ei ole geeni materiaa

  ADAM17 endoproteaasi  pilkkoo sen   ankkuriosasta irti  Delta -GP1,2 muotoon,   liukoiseksi  sGP1,2:ksi.  jokasuuntautuu   ulospäin. GP prosessoituminen  solusaa tapahtuu erillään  replikaatio ja transkriptiotoiminnasta.- mikä selittää myös miksi  EBOV viruksella on paljon niitä tyhjiä putkia, joissa ei ole täytteenä  viruksen geenirakennelmaa.  .

 
Site 637..638 (-dq-) ADAM17 desintegrase-metalloproteaasi, TACE,Myös:  TNFalfa- convertase
                     /gene="GP"
                     /site_type="cleavage"
                     /experiment="experimental evidence, no additional details
                     recorded"
                     /note="Cleavage; by host ADAM17."
 
Jäljelle jää GP:n transmebraanista muotoa ja sytosoliosaa, ja ne   avaavat tien
 sytosoliin, ja virionin eväät (  valmisproteiinit  VP24, VP30, L, vRNA, NP,VP35 ja runsas   VP40, ja RNP(NP,
 L, VP35, pääsevät  solun sisään endosomikalvosta läpi) 
Region 651..671 (-wipagigvtgviiavialfc- )
/gene="GP" /region_name="Transmembrane region" /experiment="experimental evidence, no additional details recorded" /note="Helical. {ECO:0000255}."

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar