Leta i den här bloggen

onsdag 19 november 2014

"Sheddaasi", endogeeni entsyymi ADAM-17, eli TACE irrottaa EBOV glykoproteiinin GP2 osan ankkurin ja päästää

 (Etanoli estää ADAM-17 entsyymiä muuten- kertoo yksi lähde)


EMBO J. 2004 May 19;23(10):2175-84. Epub 2004 Apr 22. Ectodomain shedding of the glycoprotein GP of Ebola virus.

Abstract

 

Lähdeartikkelissa kerrotaan tutkimuksesta , joasa selvitettiin  ebolaviruksen liukoisen  glykoproteiinimuodon sGP runsasta irtoamista , lehteilyä, hilseilyä,  ebolaviruksen extravirionaalisesta pinnasta.
  Tutkijat  selvittivät että taustamekanismina on GP-ektodomaanin ( extrvirionaaliseen pintaan  asettuvan GP-osan  poislehteilyä tekevän etnsyymin työ:, Sheddaasi nyppäisee  muitla enstyymeiltä vielä paikoilleen jääneen   GP1,2 -molekyylin  ulomman osan GP1,2Delta- nimeltään ja siitä tulee liukoista sGP1,2 , siis ankkuritonta deltamuotoa. Kalvoon jää vielä  ankkuri, joka on osaa GP2 molekyylin  C-terminaalisesta päädystä laskien ja siinän tietty lukumäärä peptidiketjua,osa on transmembraanissa ja kalvon alla  on pieni häntä vielä sisäpuolelakin .
Tällaisena  nyppäävänä sheddaasi-entsyyminä  pystyy toimimaan ainakin solun endogeeninen  desintegraasi-metalloproteinaasi ADAM17 (TACE on sen toinen nimi, sillä se  tekee muillekin proteiineille tällaisia katkaisuja kuten pro-peptidi TNFalfalle, joten se konvertoi TNF-alfaa myös aktiiviin muotoon.Molempi siis pahempi: Paljon sGP ja paljon TNFalfaa - kaksi kärpästä samalla iskulla Ebovin menestykseksi.

In this study, release of abundant amounts of the Ebola virus (EBOV) surface glycoprotein GP in a soluble form from virus-infected cells was investigated. We demonstrate that the mechanism responsible for the release of GP is ectodomain shedding mediated by cellular sheddases. ( Kuten ADAM-17)


 

 Tutkijat ovat  nähneet, että kohta, missä ADAM17 katkaisee  delta-GP1,2 irti  GP1,2  extravirionaalisesta kalvosta on aminohappo D637, aspartaatti, joka on aika lähellä C-terminaalia ( koko pituus on 676).

 Proteolytic cleavage taking place at amino-acid position D637 removes the transmembrane anchor and liberates complexes consisting of GP1 and truncated GP2 (GP(2delta)) subunits from the cell surface.
GP alkupeptidistä on merkattu tässä alla  tuo  aspartaatti (d) tummalla. 

GP ORIGIN      
        1 mgvtgilqlp rdrfkrtsff lwviilfqrt fsiplgvihn stlqvndvdk lvcrdklsst
       61 nqlrsvglnl egngvatdvp satkrwgfrs gvppkvvnye agewaencyn leikkpdgse
      121 clpaapdgir gfprcryvhk vsgtgpcagd fafhkegaff lydrlastvi yrgttfaegv
      181 vaflilpqak kdffsshplr epvnatedps sgyysttiry qatgfgtnet eylfevdnlt
      241 yvqlesrftp qfllqlneti ytsgkrsntt gkliwkvnpe idttigewaf wetkknltrk
      301 irseelsftv vsngaknisg qspartssdp gtntttedhk imasenssam vqvhsqgrea
      361 avshlttlat istspqsltt kpgpdnsthn tpvykldise atqveqhhrr tdndstasdt
      421 psattaagpp kaentntsks tdfldpattt spqnhsetag nnnthhqdtg eesassgklg
      481 litntiagva glitggrrtr reaivnaqpk cnpnlhywtt qdegaaigla wipyfgpaae
      541 giyteglmhn qnglicglrq lanettqalq lflrattelr tfsilnrkai dfllqrwggt
      601 chilgpdcci ephdwtknit dkidqiihdf vdktlpdqgd ndnwwtgwrq wipagigvtg
      661 viiavialfc ickfvf 
 
( Transmembraani ankkuri jää siis virionin varsinaiseen membraaniin extravirionaalisen  membraanin poislehdteilyn jälkeen  Siten endosomaalinen vaihe  pääseekin  sulamaan sytossolivaiheeseen koska tuo loppuosa  samaistuu  ympäröivään kalvoon ja  niin aukeaa koko viruksen sisällölle tie ihmissolun sytoplasmaan. Siinä  massassa menee hyvin paljon VP40 matrixproteiinia jota  siten levittäytyy koko soluun ja erään tutkijaryhmän mukaan myös kautta tuman. Muita tässä vaiheessa  sytoplasmaan pääseviä ovat  RNP-partikkelit ( NP,L,VP35, V30, V24)- ne pyrkivät inklusoitumaan perinukleaarisesti, missä sitten tapahtuu replikaatiot ja transkriptiot  vaihteineen ja  erityissti Gp proteiinilla on monimutkainen editoitumisesna, eräänlainen  säätelijäsysteemi, joka määrää mitä laatua tehdään hyvin  paljon ja mitä vain  siinä tarkoituksessa että saadaan  tiukasti kootut RNP-partikkelit  kokoon.  GP prosesointi näyttää välttävän sitä tienoota missä RNP-partikkeli valmistuu.

     (d637)qgd ndnwwtgwrq wipagigvtg
      661 viiavialfc ickfvf 






We show that tumor necrosis factor alpha-converting enzyme (TACE), a member of the ADAM family of zinc-dependent metalloproteases, is involved in EBOV GP shedding. This finding shows for the first time that virus-encoded surface glycoproteins are substrates for ADAMs. Furthermore, we provide evidence that shed GP is present in significant amounts in the blood of virus-infected animals and that it may play an important role in the pathogenesis of infection by efficiently blocking the activity of virus-neutralizing antibodies.

 

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar