ERAD järjestelmässä on chaperone molekyylejä kalretikuliini (CRT) , joka on luminaalinen, ja kalnexiini (CNX) sijaitsee integraalisesti ER kalvossa.
https://www.springer.com/gp/book/9783662062050
Myös SARS2 virus kohdistaa epätasapainottavan vaikutuksensa tähän CRT/CNX sykliin, joka näiden kaitsijaproteiinien kesken vallitsee ja vaikuttaa että virusproteiinit eivät joudu hajoitustiehen ERADissa.
Niiden vastuulla on muodostuvien glykoproteiinien korrekti laskostuminen. Ne ovat kvaliteetin kontrollitekijöitä uusille syntetisoiduille glykoproteiineille. Niiden vaikutusalue ulottuu sekä endoplasmisen verkoston sisään että ulkopuolelle. Kalretikuliinista sanotaan että se on multiprosessimolekyyli. Se säätelee kalsiumjonin homeostaasia ja puskurointia endoplasmisessa verkostossa. Nämä ovat hydrofobisia lektiinejä ja laskostusta auttavat proteiinit BIP ja PDI tunnistavat niitä.
KDEL on motiivi, joka estää proteiineja sekretoitumistiestä .
KDEL-reseptorien kanssa ligandi-interaktiot on havaittu ER luminaalisella puolella proteiinit kuljetetaan takaisin ER.än päin COP I rakkuloiden muodostuksella. Näiden rakkuloiden silmukointi ja kuljetus on riippuva GTPaasi ADP- ribosylaatiofaktorista 1, ARF1.
BIP molekyylissä on kauttaaltaan runsaasti K, D, E L aminohappoja ja samoin C-terminaali on KDEL.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_005338.1
P4HB eli PDI omaa myös KDEL päädyn ja runsaasti K, D, E ja L aminohappoja.
SARS2 CoV nsp15 tekee interaktion toisen ARF - ryhmän entsyymin kanssa: ARF6.
ARF6 taas on ADP-ribosylaatio faktori 6, joka lokalisoituu er plasmamembraaniin ja säätelee vesikulaarista liikennöintiä, membraanilipidien muokkausta ja signalointiteitä, jotka johtavat aktiinin uudelleen muokkaukseen.
ORF9 rakenteessa on myös runsaasti K, E, D ja L aminohappoja, mutta pääty ei ole tuo KDEL.
Se voi toimia jonkinlaisena hämäysmolekyylinä,oy chaperonen kaltaisena joutumatta kuitenkaan KDEL-tielle.
Mutta Sars S sitoutuu kalnexiiniin ja laskostuu hyvin.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3486308/
Monitoring of S Protein Maturation in the
Endoplasmic Reticulum by Calnexin Is Important for the Infectivity of
Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus
a,b,c,d
We have shown here that the binding of
SARS-CoV S protein to the cellular molecular chaperone calnexin plays a
critical role in SARS-CoV infection. Calnexin strictly managed the
folding of glycosylated S protein in viral production, with the result
that daughter viruses acquired the infectious ability.
The
interaction between S protein and calnexin was analyzed here, because
calnexin provided the strongest signal in our pulldown assays using
S2-N. These pulldown assays, however, showed that S2-N also bound to
other cellular proteins containing actin. Recently, palmitoylated
calnexin, which forms a supercomplex with the ribosome-translocon
complex, was reported to interact with actin (25),
suggesting that S protein may indirectly interact with actin through
calnexin. Calnexin bound to all truncated S proteins except for S2-C,
consistent with a previous report that 23 putative N-linked
glycosylation sites are scattered throughout S protein (34, 40, 48).
Calnexin associates with monoglycosylated N-glycan chains on
polypeptides/proteins. The presence of many glycosylation sites in S
protein is also consistent with our Western blot results with cell
lysates, showing that S protein is present as two major bands with
smearing. This result is consistent with a previous report using a full
glycan analysis (39).
ORF8 tekee interaktion EDEM3 kanssa. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/80267
ORF8 tekee interaktion EDEM3 kanssa. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/80267
- Official Symbol EDEM3
- Official Full Name ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 3
- Also known asC1orf22
- SummaryQuality control in the endoplasmic reticulum (ER) ensures that only properly folded proteins are retained in the cell through recognition and degradation of misfolded or unassembled proteins. EDEM3 belongs to a group of proteins that accelerate degradation of misfolded glycoproteins in the ER (Hirao et al., 2006 [PubMed 16431915]).[supplied by OMIM, Mar 2008]
- Expression Ubiquitous expression in stomach (RPKM 15.9), colon (RPKM 13.5) and 25 other tissues See more
Inga kommentarer:
Skicka en kommentar