Vuonna 2009 Coloradossa tutkittiin lasten respiratoristen infektioiden näytteitä yhden vuoden aikana ja niistä oli negatiivisia kaikille ensin tutkituille 7 respiratoriselle virukselle kokonaista 1683 näytettä. Sitten niistä seulottiin CoV RNA ja havaittiin 5%:ssa koronaviruksista merkkejä. Nämä olivat 84 näytettä.
- LÄHDEARTIKKELI_ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19626607
- Niistä 84 näytteestä oli 37 näytettä HCoV-NL63 ( ryhmän 1 CoV, jota esiintyy kautta maailmaan ja joka voi aiheuttaa kruppia ja sekä ylempien että alempien hengitysteiden infektioita (URTI, LRTI).
Tämä on alfakoronavirus ryhmää 1 SETRACOVIRUKSIA
- 34 näytettä oli HCoV-OC43, ryhmän 2a HCoV, joka on tunnettu jo 1960 luvulta
Tämä virus löytyy taxonomisesta taulukosta betakoronaviruksista ja ryhmästä Betacoronavirus1, johon kuuluu paljon viruksia. Se on alaryhmää ryhmää 2a, ihmisen betakoronavirus HCoV-OC43, EMBECOVIRUS . Näitä tunettioin jo 1960 luvulla ja ne kuuluivat yleisiin kylmettymisviruksiin seursavan alfakoronaviruksen kanssa.
- 11 näytettä oli HCoV-229E, joka on ryhmän 1 HCoV ja se on myös tunnettu jo 1960-luvulta. Näitä kahta on esiintynyt tavallisten vilustumisvirusten joukossa n.15-30 % virusetiologioista ( sekä URTI että LRTI) . Tämä on alfakoronavirus, ryhmää 1, DUVINAVIRUKSIA-
- 2 näytettä oli myös uudempaa (SARS:n jälkeen ilmentynyttä) koronavirusta, HCoV-HKU1, se on ryhmän 2a HCoV ja sitä esiintyy myös kautta koko maailman. Se voi aiheuttaa kuumekramppeja lapsille. Tämä on ihmisen betakoronavirus 2a ryhmää, EMBECOVIRUS.
Tutkimuksen artikkelista sitaatti:
J Med Virol. 2009 Sep;81(9):1597-604. doi: 10.1002/jmv.21541. Detection of four human coronaviruses in respiratory infections in children: a one-year study in Colorado.
Lower
respiratory tract infections are the leading cause of death in children
worldwide. Studies on the epidemiology and clinical associations of the
four human non-SARS human coronaviruses (HCoVs) using sensitive
polymerase chain reaction (PCR) assays are needed to evaluate the
clinical significance of HCoV infections worldwide. Pediatric
respiratory specimens (1,683) submitted to a diagnostic virology
laboratory over a 1-year period (December 2004-November 2005) that were
negative for seven respiratory viruses by conventional methods were
tested for RNA of four HCoVs using sensitive RT-PCR assays. Coronavirus
RNAs were detected in 84 (5.0%) specimens: HCoV-NL63 in 37 specimens,
HCoV-OC43 in 34, HCoV-229E in 11, and HCoV-HKU1 in 2. The majority of
HCoV infections occurred during winter months, and over 62% were in
previously healthy children. Twenty-six (41%) coronavirus positive
patients had evidence of a lower respiratory tract infection (LRTI), 17
(26%) presented with vomiting and/or diarrhea, and 5 (8%) presented with
meningoencephalitis or seizures. Respiratory specimens from one
immunocompromised patient were persistently positive for HCoV-229E RNA
for 3 months. HCoV-NL63-positive patients were nearly twice as likely to
be hospitalized (P = 0.02) and to have a LRTI (P = 0.04) than
HCoV-OC43-positive patients. HCoVs are associated with a small, but
significant number (at least 2.4% of total samples submitted), of both
upper and lower respiratory tract illnesses in children in Colorado. Our
data raise the possibility that HCoV may play a role in
gastrointestinal and CNS disease. Additional studies are needed to
investigate the potential roles of HCoVs in these diseases.
...
...
As part of an ongoing investigation of viral respiratoryinfections at The Children’s Hospital in Denver, wearchived at 708C all (1,662 archived of 2,621 sub-mitted) nasopharyngeal washes (NPWs) submittedfrom December 2004 to November 2005, that tested negative for respiratory syncytial virus (RSV), influenzaviruses A (FLUAV) and B (FLUBV), parainfluenzaviruses 1–3 (HPIV-1, -2, -3), and adenovirus (HAdV)by direct immunofluorescence (DFA). In addition,during influenza season NPWs (225 archived of 891submitted) that were negative by a rapid immunoassay(IA) for FLUAV and FLUBV were also archived at 708C. Use of the banked specimens and clinical datawas approved by the Colorado Multiple InstitutionalReview Board. All samples were de-identified and codedat the TCH Virology Laboratory and then transferred tothe Holmes lab for blinded analysis of HCoV RNA.RNA was extracted using Qiagen EZ1 Virus Mini Kits(Valencia, CA) on a BioRobot EZ1 Extractor followingthe manufacturer’s instructions. All of the specimenswere initially screened using a modified quantitativereal-time RT-PCR (qRT-PCR) assay that detects allfour non-SARS HCoVs [Kuypers et al., 2007], in which..
Inga kommentarer:
Skicka en kommentar