Leta i den här bloggen

onsdag 13 april 2022

Valtavirukseksi Deltan ja omikron BA.1 muunnoksen jälkeen Suomessa omikronin BA.2 muunnos

 

 Sitaatti tHL:n uutisesta Pääsiäisviikon (v.15)  keskiviikkona 13.4. 2022

Omikron BA.2 on nyt yleisin Suomen jätevesistä havaittu koronavirusmuunnos
12.4.2022
Omikronin alamuunnos BA.2 on yleisin Suomen jätevesistä havaittu koronavirusmuunnos,
 selviää Terveyden ja hyvinvoinnin laitoksen (THL) jätevesiseurannan tuloksista.
 THL:n jätevesiseurannassa kerättyjä näytteitä sekvensoimalla pystytään tunnistamaan'
koronavirusmuunnoksien osuudet jätevesien sisältämästä koronavirus-RNA:sta eli 
viruksen perimäaineksesta.
Jätevesiseurannan perusteella deltamuunnos oli Suomessa yleisin muunnos 
joulukuun 2021 puoleenväliin asti. 
Tammikuun 2022 alussa omikronin BA.1 muunnoksen havaittiin nousseen jätevesissä
 deltamuunnosta yleisemmäksi. 
Maaliskuun puolivälissä yleisimmäksi nousi puolestaan omikronin alamuunnos BA.2.
Koronavirusmuunnosten tunnistaminen jätevedestä on mahdollista kehittyneillä 'sekvensointitekniikoilla, vaikka virus-RNA on jätevedessä laimentuneena ja se voi olla vaurioitunut ympäristötekijöiden vaikutuksesta. 
THL aloitti menetelmän kehittämisen koronavirusmuunnosten tunnistamiseksi 
jätevesinäytteistä viime vuoden loppupuolella. 
Menetelmää on kehitetty omikronin alamuunnosten BA.1 ja BA.2 tunnistamiseksi 
sekä eri muunnosten suhteellisten osuuksien määrittämiseksi.

https://thl.fi/documents/10531/4362653/FI_jatevesi_RNA_variantit_042022_final.png/c6bdb2a3-e513-e392-20aa-11397b373300?t=1649742427763

SARS-CoV-2-virusmuunnosten suhteelliset osuudet Suomen jätevesinäytteissä seurannassa 

olevien puhdistamojen alueilta yhteensä ajanjaksolla 1.11.2021 – 14.3.2022 sekvensoiduissa 

jätevesinäytteissä.

Ensimmäiset viitteet omikron BA.1 -alamuunnoksesta Suomen jätevesissä saatiin näytteestä, joka oli kerätty 6.–7.12.2021. Aiemmilla viikoilla ja muilla seurantapaikkakunnilla kyseistä alalinjaa ei viel tuolloin havaittu Tähän mennessä onnistuneesti sekvensoitujen näytteiden mukaan omikron BA.2 -muunnoksesta saatiin ensimmäiset viitteet 2-3.1.2022 kerätystä näytteestä. Tammi-helmikuussa 2022 omikronin alamuunnoksien BA.1 sekä BA.2 esiintyminen yleistyi  ympäri Suomea, ja 20.–21.2.2022 molempia muunnoksia havaittiin samanaikaisesti  peräti kolmentoista eri paikkakunnan jätevesinäytteissä. Tähän mennessä valmistuneiden sekvensointitulosten mukaan viimeiset viitteet deltamuunnoksesta Suomen jätevesissä olivat havaittavissa 16.–17.1.2022 kerätyissä näytteissä.Kaikkia kerättyjä jätevesinäytteitä ei ole vielä analysoitu koronavirusmuunnosten varalta. Tällä hetkellä varianttien tunnistusmenetelmällä saadaan jätevesistä vasta alustavia tuloksia, ja jopa kuukauden mittainen sekvensointiviite hidastaa tulosten valmistumista.

Lue lisää: Koronavirusmuunnokset jätevedessä

Virusmuunnoksia seurataan myös valtakunnallisesti laboratoriovarmistetuista COVID-19-näytteistä sekvensoimalla viikoittainen otanta eri puolilta maata henkilötestauksessa todetuista koronaviruksista. Vastaavasti kuin jätevesitulosten perusteella myös koko maan kattavassa otosseurannassa BA.1 syrjäytti deltamuunnoksen joulukuun loppupuolella (viikko 51) ja BA.2 puolestaan kasvoi valtavirukseksi syrjäyttäen BA.1 maaliskuun alkupuolella (viikko 10). Helsingin ja Uudenmaan sairaanhoitopiirin (HUS) alueella BA.2 on ollut valtavirus vuoden alusta alkaen.

Jätevesiseuranta jatkuu viikoittain

Koronaviruksen jätevesiseurannassa jatketaan näytteiden keräämistä viikoittain. Viimeisimpien eli 3–4.4.2022 kerättyjen jätevesinäytteiden perusteella koronaviruksen RNA:n kokonaismäärä jätevesissä on edelleen korkealla tasolla.

Viime viikolla (3.–4.4.2022) ...ssa mitattiin mittaushistorian suurimmat RNA-lukumäärät 1000:ta ihmistä kohden vuorokaudessa. ...llä RNA-lukumäärän viiden viimeisen mittauskerran trendi on jatkanut nousuaan tällä viikolla....ssa viiden viimeisen mittauskerran trendi on kääntynyt laskuun. Muilla seurantapaikkakunnilla RNA:n määrät ovat korkealla tasolla, mutta trendi on pysynyt tasaisena kahden viimeisen viikon aikana.

Lue lisää: Koronaviruksen jätevesiseurannan viikkoraportti

Jätevesiseurannan tuoma tilannekuva koronaviruksen lukumääristä on testausaktiivisuudesta riippumaton ja tukee muita epidemian mittareita.

Koronaviruksen RNA-lukumäärä tutkitaan viikoittain 13 paikkakunnan jätevesinäytteistä. Näytteet on kerätty ...n   jätevedenpuhdistamoilta. Lisäksi ..ltä kerätään näyte kahden viikon välein sekä ...sta ja ...lta kerran kuussa.

Näytteissä havaitut koronaviruksen RNA-lukumäärät päivittyvät THL:n verkkosivuille jätevesiseurannan viikkoraporttiin kerran viikossa perjantaisin klo 12. Pääsiäisviikolla 10.–11.4.2022 kerättävien näytteiden tulokset päivitetään verkkosivuille poikkeuksellisesti jo torstaina 14.4.2022. Ne jätevesinäytteet, joissa havaitaan koronaviruksen RNA:ta, lähetetään sekvensoitavaksi koronavirusmuunnosten tunnistamiseksi.

Lisätietoja


johtava asiantuntija
THL

erikoistutkija
THL

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar