Leta i den här bloggen

fredag 3 juni 2022

Omikronlinja BA.5.1 omaa harvinaisen ORF10 mutaation ( Orf10: L38F)

 Aiemmin on tutkittu ORF10:n  proteiinin merkitystä. Sillä on 38 aminohappoa. Maailmasta ei ole löytynyt kovin montaa  Sars-2 sekvenssiä, joissa ilmenisi  ORF10 mutaatio. 

 Niistä harvoista löydöistä on tehty tieteellinen artikkeli.

  https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141813021025563#t0010

Tämä BA.5.1 linjassa esiintyvå ORF10 mutaatio on L37F. Sekin muaatio kuuluu artikkelissa esitettyyn listaan ORF10 omaa  N-terminaalisessa osassa metioniini-glysiini-tyrosiini-motiivin (MGY) ja sen avulla  se rekrytoituu  CLR2 kompleksiin On mahdollista, että ORF10 omaa merkitystä taudin   paranemisen hitaudessa ja tarttuttavuusajan pidentymisessä.  CLR2-kompleksi kuuluu kehon ubikitiini-proteosomitien jäseniin ja  sars-2 saattaa olla kaapannut  tämän järjestelmän tavalla tai toisella. 

Sitaatteja artikkelista :

Continent-wise unique variations of ORF10 proteins and their mutations with predicted effects are presented in the following subsections.

 ORF10 variants and transmembrane topology of SARS-CoV-2 ORF10

Continent-wise distribution of the total 140 unique ORF10 variants is presented in Table 1. The highest frequency of unique ORF10 variants was found in North America among the total of 140 SARS-CoV-2 ORF10 variants.

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar