Muutoksia tapahtuu Omikron BA.1 linjassakin. Kaksi linjaa on muodostunut krooisesti infektoituneissa BA.1.23 ja BA.1.24.

 Olen katsonut BA.1 ja BA.1.1 listat miten paljon niihin  kertyy uusia  kumumääriä. Aika paljon sellaista pikkuista  lisää  on yhdessä ja toisessa. eivät ne  näyttäneetkään mitään täyttä loppumistaan vielä vaikka   suuren aallon tekovoimat ovat  tällä hetkellä   ehtyneet.  ehkä on se notkelma, kuten suomalainen tiedemies kevättalven aikaan  sanoi.

BA.1.1 linjaan ei näytä tulleen lisää erityistä, vaikka muutamia sekvenssejä  lisääntyykiin niitten  joukkoihin.

BA.1- BA.22  ryhmään on ilmestynyt  lisälinjoja  listan loppuun:

BA.1.23 ja BA.1.24 .  Niistä mainitaan että ne ovat kehittyneet kroonista infektiota potevilla eikä infektion alkusekvenssejä ole sekvenssoitu. Näissä kehittyneissä sekvensseissä on ussia  mutaatioita. 

Otan tässä kopion listan  edellisestä viimeisestä  linjasta BA.1.22 ja  siten on nuo aivan viime päivinä liiteyt  kaksi linjaa.  Kuten huomata voi, niissä on epätavallisen vähän  jäseniä otetun  designaatio-listaan toisessa vain 9 ja toisessa  kuusi, mutta  sekvenssit ovat  erikoisia. Niiden kliininen merkitys tietysti tässä vaiheesa on tuntematon. Tiedetään vain se että ne ovat kehittyneet kroonisesti infektoituneissa.Kirjoitan tähän esiin vain  S-piikkimutaatiot molemmista. Sitä paitsi yhteisiä mutaatioita näillä kahdella on  nähdäkseni vain  1 kpl.

BA.1. 23 Piikkiproteiinin mutaatiot:

E96D, ( Tämä mutaatio on XG rekombinantillakin)

 L167T  ( tässä  pitää tarkistaa, koska olen merkinnyt vihkooni 167 aminohapon jo alkuaan  threoniiniksi Wuhan sekvenssissä (T167), ja nyt sanotaan että  siinä kohtaa on  mutaatio L167T, muta omikronit eivät omaa siinkohtaa L, ainakaan pääölinjat.

R346T (tämä on molemmissa linjoissa BA.1.23 ja BA.1.24. R346 näyttää miessa variantissa muuttuvan, esim. rekombinanteissa XS ja XP se on  K. Kongovariantissa B.1.640 se on S).

L455W. Tässä kohtaa en huomaa aiempia muaatiota vihkossanimerkittynä omikroneista. 

K458M. Tässäkään en näe  mutaatioita ennen  omikroneissa. Kaikkia omikron alalinjamutaatioita ei ole edes merkattuna vihkooni vielä.

E484V. Tämä on erikoinen, koska kaikilla omikropneilla on määrittelevä perusmuttaatio E484A. En kyllä ole tuota valiiniakaan (V) missään ennen nähnyt tässä kohtaa. 

H681R. Tämä on se  furiinikohdan mutaatio joka on tsäsä samassa muodossa kuin deltoilla. Deltat muuttivat  proliinin P arginiiniksi R:  (P681R) ja  omikronit muuttivat:  (P681H histidiiniksi H . Nyt tmä alalinja muuttaa histidiinin H  arginiiniksi R: (H618R). 

S2 -spikeproteiinialueen mutaatio : A688V. Tällaista ei ole aiemmin ollut omikroneissa. Delta kyllä muutti sen vieressä olevaa  (AY.122: V687I) 

Ba.2.24 linjassa havaittavia S-proteiinimutaatioita 6 eri sekvenssissä 

L371F ( tämä mutatoituu partiaalisen reversion tietä)

 (P371S ja F375S  reversio)

R346T

L452M    (Tämä on ollut myös BA.2.13 alalinjasa)

I670 L tai  I670M .  ( Tätä samaa asemaa muutaa BA.4.1.1 ja asettaa  valiinia (I670V)

D936Y ( Tämä mutaatioon ollut BA.2.13 alalinjassa)

G885S.  (Tässä kohdassa en havaitse aiemmin mutaatiota muistiinpanoissani) .

BA.1.22	Peru 90.0%, Chile 5.0%, South_Korea 3.0%, United Kingdom 1.0%, United States of America 1.0%	2022-01-03	32,	77	Alias of B.1.1.529.1.22, Peru lineage from pango-designation issue #529
BA.1.23			9,	0	Alias of B.1.1.529.1.23, mainly found in USA, from pango-designation issue #663
BA.1.24			6,	0	Alias of B.1.1.529.1.24, found in Spain, from pango-designation issue #666