Leta i den här bloggen

tisdag 21 juni 2022

Aivan uusi BA.2* alalinjavarianttiehdotus on tullut GITHUB lIStaan muutama tunti sitten(#773)

 Item 773#:  BA.2* alalinja, Intiasta   eri osavaltioista koostunut  pieni näytemäärä. Tässä  variantissa esiintyy 9  uutta  spike-muttaatiota  sekä  kolme Orf1a ja yksi Orf1b mutaatio ja  yksi  E-proteiinimutaatio. 

Varmistettuja kvalitatiivisesti hyviä sekvenssejä on 5. Mutaatiot ovat seuraavia. katson , jos niistä on aiempia tietoja vihkoissani:

S:K147E, (Uusi mutaatio)

S:W152R,   (Epsilon substituoi tämän kohdan cysteiinillä C). 

F157L, (Tämä mutaatio oli jo A.23.1 Uganda/Finland  variantissa. kohta sijaitsee  deltan tyypillisessä deletiojaksossa EFR).

I210V, (Tätä kohtaa  substituoi Congovariantti B.1.640  toisella tavalla I210T).

G257S, (Uusi mutaatio, sijaitsee deltalle tyypillisten mutaatioitten välissä).

D339H (Tämä on omikronien   jatkomutaatio G339D mutaatiosta  käsin).

G446S, (Tässä kohtaa esiintyi deltoissa esim AY.4.1,  mutaatio muodossa G446V)

N460K, uusi mutaatiokohta.

R493Q on reversio 

 (Sitten ORF1a mutaatioissa  on  trendi  muodostaa samoja  ulokkeita kuin  deltan Orf1a aminohapoissa).

Orf1a: P1640S

S1221L,

N4060S,

Orf1b:G662S

Envelope E: T11A. 

Mielestäni  muaatioitten trendi ei vaikuta viruksen struktuurin  deteriooroitumsita vaan  ilmeistä trendiä replikation tai infektiviteetin tehostumiseen.  Ei mielesäni  mitenkään vaaraton variantti.  Tästä sanotan että  sitä löytyy nmä harvat ilmenemät eri osavaltiosita ja sitä  liikkuu  monitoroimattomia määriä Intiassa.  Saa odotella lisätietoa tästä  tämän päivän  aiheesta #773. 


Inga kommentarer:

Skicka en kommentar