Olisiko ORF10 jollain tavalla TNF-alfan virassa Fas- ligandina esimerkiksi? Vertailen sekvenssejä.

 Protein         1..38
                     /product="ORF10 protein"
                     /calculated_mol_wt=4318
     CDS             1..38
                     /gene="ORF10"
                     /locus_tag="GU280_gp11"
                     /coded_by="NC_045512.2:29558..29674"
                     /db_xref="GeneID:43740576"
ORIGIN      
        1 mgyinv  fa fp f ti  ysl llcr mn sr nyi  aqv dvvnfnlt

 GYI motif 

 GYI -IY -YI (ORF10) 

- GYINV-IY-N-NYI-QV-VVN-N

 g-y-i motif_ 

i-gg-g-i-g-g-ig-i-g-g-g-y-i- g-g-i-i-y-i-g-y-i-gg-g-i-y-g-y-ii (TNFa) 

n-y-i-q-v motif 

NYI-QV  (ORF10) 

V-V-DVV (ORF10)

dv-v -v-d- v -vv- v- d -vv- v - v- v -v- v- d -d -v (TNFa) 

 i-gg-qg-iv-g- gvig-q- i-q-v-v-vv-n--q-gq-q-n-n-ngv-nq -vv-g-y-i-qv-gqg-v-i--

--i-v-yq -vn-i-q-g-y--i-ggv- q-g- in- y-gqvy-ii

  (TNFa) 

TNF alpha 

ORIGIN 1 mstesmirdv elaeealpkk tggpqg sr rc lflslfsfli vagattlfcl lhfgvigpqr 61 ee fp rdlsli splaqavrss sr tpsdkpva hvvanpqaeg qlqw lnrran a ll angvelr 121 dnqlvvpseg lyliysqvlf kgqgcpsthv llth ti sr ia vsyqtkvnll saikspcqre 181 tpegaeakpw yepiylggvf qlekgdrlsa einrpdyld fa esgqvyfgi ial

Katson  "prsypry"  viittaavat motiivit ORF10:stä:  Näillä motiiveilla   ne voinevat tehdä  interaktioita satoihin tai tuhansiin  luonnollisen immuniteetin proteiineihin.  PRYSPRY motiivit matkivat   TRIM-proteiinien  interaktiopintaa. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30973643/

ORIGIN      
        1 mgyinvfafpftiyslllcrmnsrnyiaqvdvvnfnlt

y-p-ys-r-sry-motiivi

Katson myös TNFalfasta_  ottaen mukaan kaikki s, r, p ja y aminohapot: 

  s-s-r-p-p-s-r-r-s-s-p-r-pr-s-sp-rsssr-ps-s-s-rr-r-ps-y-

ys-ps- sr-sy-s-sp-r-p-p-y-p-y-r-s-rp-y-s-y-