Näitten lyhyitten kombinaatioitten avulla varianttien seuranta niiden saadessa alalinjoja on sitten mukavaa. Pitää vain pitää käsillä se koodilista.
Esimerkkinä on neljä päivää sitten ilmestynyt alalinja FP.1 variantille. Koska kyse on XBB* ryhmästä, tämä on monitoroitavia variantteja.
"FP" alias XBB.1.11.1 .
Se on siis saanut alalinjan.
Sublineage of: FP.1
Earliest sequence: 2023/04/05 (Singapore)
Most recent sequence: 2023/05/03 (Singapore)
Countries circulating: Singapore, 16 local cases and 2 cases with recent travel history from Malaysia (could be local as well)
Mutations on top of FP.1: T27134C > A28858C (N:R195S) > C9487T, A27917T (ORF8:8C)
A27917T changes the ORF8:8 stop codon (TGA) to a Cysteine (TGT), thus functionally restores the truncated ORF8. It'll be interesting to monitor if this restoration of ORF8 will confer any growth (dis)advantage over stock FP.1.
GISAID query: del21767, A27917T, A28858C
Inga kommentarer:
Skicka en kommentar