Katsausta kumulatiivisen prevalenssin prosenttilukuihin sars-2 virusvarianttien ilmenemisessä

 Olen summittain ja harpoten  käymässä läpi WHO lähteestä käyriä, joista havainnoituu sars-2  viruksen relevanssi  maailmassa. Ajallisesti käyrät kattavat  pandemian ajan kulloinkin   kyseessä olevan  virusvariantin osalta  Käytär ovat suhteellisia , koska  toisia viruksia esiintyy vain muutama sata ja toisia kymmenin tuhansin, joten täytyy tarkistaa  y-akselisa  missä prosenttilukemassa ( yksikön osalta)  milloinkin ollaan: 0,01 , 0,1%, 1 % vai 100% suuruusluokka y-akselilla .

En ole vielä päässyt kaikkien  deltavarianttien (AY linjojen)  käyriä kirjoittamaan vihkooni. Niitä on paljon , toista sataa. Katsoin välillä Alfan , Beetan, Gamman, Lambdan ja alalinjojen  käyrät ja lopuksi Mu variantin.

Mu -variantti yllätti, koska siinä on  merkitsevästi  poikkeavuutta muihin S-piikissä. Esim  yksi deleetiokohta (yy del145/144) on saanut subtituutionsa ja  siinä on nytY145N ja Y144S aminohappomuutokset . En kai ole tätä nähnyt muissa katsomissani  varianteissa.

Huomaan että Somessakin on  havaittu kolme Mu varianttia. Kolumbiassa niitä on havaittu 3720. Kaikenkaikkiaan niitä on havaittu 11 352 maailmassa. Sen esiintymisn korkein piikki (1%) on ollut keskikesällä.

 Siitä on  huomautuksia: https://outbreak.info/resources/2021.09.06.459005

https://outbreak.info/resources/2021.09.06.459005

Publication Preprint

Ineffective neutralization of the SARS-CoV-2 Mu variant by convalescent and vaccine sera

Keiya Uriu, 

Izumi Kimura, 

Kotaro Shirakawa, 

Akifumi Takaori-Kondo, 

Taka-aki Nakada, 

Atsushi Kaneda, 

- The Genotype to Phenotype Japan (G2P-Japan) Consortium, 

So Nakagawa, and 

Kei Sato

 

published 07 September 2021 • accessed 20 October 2021

Record provided by bioRxivLearn more

On August 30, 2021, the WHO classified the SARS-CoV-2 Mu variant (B.1.621 lineage) as a new variant of interest. The WHO defines "comparative assessment of virus characteristics and public health risks" as primary action in response to the emergence of new SARS-CoV-2 variants. Here, we demonstrate that the Mu variant is highly resistant to sera from COVID-19 convalescents and BNT162b2-vaccinated individuals. Direct comparison of different SARS-CoV-2 spike proteins revealed that Mu spike is more resistant to serum-mediated neutralization than all other currently recognized variants of interest (VOI) and concern (VOC). This includes the Beta variant (B.1.351) that has been suggested to represent the most resistant variant to convalescent and vaccinated sera to date (e.g., Collier et al, Nature, 2021; Wang et al, Nature, 2021). Since breakthrough infection by newly emerging variants is a major concern during the current COVID-19 pandemic (Bergwerk et al., NEJM, 2021), we believe that our findings are of significant public health interest. Our results will help to better assess the risk posed by the Mu variant for vaccinated, previously infected and naive populations.