7 Virukset ilman Vif-tekijää tai mobiileja geneettisiä elementtejä_
Viruses that lack Vif and mobile genetic elements
Miten virus kiertää intrasellulaarisen immuniteetin, jos se ei koodaa Vif proteiinia?
How can viruses that do not encode Vif escape from this intracellular immunity?
7.1. Virus tuottaa dUTPaasia ja välttää dUTP-inkorporaation
Koska eräät APOBEC proteiinit voivat inhiboida EIAV, HBV ja MLV replikaatioita, täytyy olla jokin lisä mekanismi, millä voi järjestelmää kiertääkin.
Mitä tulee EIAV-virukseen se koodaa lisäentsyymiä, jonka nimi on dUTPaasi. Tätä entsyymiä tuottaa myös herpesvirus, poxvirukset ja eräät muut retrovirukset. Äskettäin on osoitettu caprine arthritis encephalitis virukselta (CAEV) dUTPaasia, joka pystyi blokeeraamaan dUTP:n virheellisen inkorporoitumisen HIV-1 viruksen käänteiskopiointivaiheeseen. Joten sen dUTPaasi pystyi suojaamaan myös EIAV-virusta APOBEC-proteiinien hyökkäykseltä.
Mitä tulee HBV-virukseen, se lisääntyy kudoksissa, jotka eivät ilmennä hA3G proteiinia.
MLV-viruksen suhteen tilanne on komplisoidumpi. Ihmisen solut ilmentävät seitsemää A3-proteiinia ja hiirellä on taas vain yksi A3-geeni. Vaikka mA3 blokeeraa HIV-1 ja SIV replikaation, se on heikompi teholtaan pakkautumaan eikä pysty estämään MLV-virusta. Joten MLV on adaptoitunut luonnolliseen isäntäänsä mekanismilla, joka jää heikommin ymmärretyksi.
7.1. As some APOBEC proteins also inhibit the replication of EIAV, HBV, and MLV, there must be additional mechanisms of escape.
In the case of EIAV, it encodes an additional enzyme, which is named dUTPase. This enzyme is also produced by herpesviruses, poxviruses, and some other retroviruses. Recently, it was demonstrated that dUTPase from caprine arthritis encephalitis virus (CAEV) could block the misincorporation of dUTP during HIV-1 reverse transcription. Thus, its dUTPase could also protect EIAV from attack by APOBEC proteins.
In the case of HBV, it replicates in tissues that do not express hA3G.
The situation for MLV is more complicated. Unlike human cells that express seven A3 proteins, the mouse genome contains only one A3 gene. Although mA3 blocks the replication of HIV-1 and SIV, it is less efficiently packaged into and does not inhibit MLV. In contrast, hA3G blocks the replication of MLV. Thus, MLV has adapted to its natural host by a mechanism that remains poorly understood.
7.2. Retrotransposonit, retrovirusten kaltaiset liikkuvat geneettiset elementit
Mikä on tilanne retrovirusta muistuttavien mobiilien geneettisten elementtien suhteen?
Ihmisessä ja hiiressä on useita eri tyyppejä retrotransposoneja. Kaikkein runsain on LINE-1 tai L1 elementit, jotka eivät sisällä LTR (Long Terminal Repeats). Noin sata ihmisen L1-elementtiä ja useita tuhansia hiiren L1 elementtejä on funktionaalisia. Vaikka ne vaativat käänteiskopiointia, ne eivät muodosta VLP eikä APOBEC proteiinit blokeeraa niiden replikaatiota.
Sitävastoin LTR-pitoiset retrotransposonit, jotka edustavat noin 10% ihmisen genomista, muodostavat VLP, silmukoituvat intrasellulaarisista organelleista ja käyttäytyvät samankaltaisesti kuin soluun tulevat exogeeniset retrovirukset.
Vaikkakaan ei ole löydetty yhtään aktiivia ihmisen endogeenia retrovirusta (HERVs), niin hiirellä on useita satoja aktiiveja intrakisternaalisia A-partikkeleita (IAPs) ja ainakin kymmenen kopiota MusD. Ja IAP sekä MusD sisältävät useita G-A muuttumisia genomissaan. Transient expression- menetelmällä on soluista havaittu, että hA3G ja mA3 inhiboivat IAP ja MusD retrotranspositiota.
Täten APOBEC proteiinit voivat myös blokeerata joidenkin mobiilien geneettisten elementtien liikkumista todennäköisimmin itusoluissa ja embryogeneesin aikana nisäkkäillä.
7.2. What is the situation with mobile genetic elements that resemble retroviruses (VLPs)?
In humans and mice, there are several types of retrotransposons. The most abundant are LINE-1 or L1 elements that do not contain long terminal repeats (LTRs). Up to one hundred human and several thousand mouse L1 elements are functional. Although they require reverse transcription, they do not form VLPs and APOBEC proteins do not block their replication.
In contrast, LTR-containing retrotransposons, which represent up to 10% of the human genome, form VLPs, bud from intracellular organelles and behave similarly to incoming exogenous retroviruses.
Although no active human endogenous retroviruses (HERVs) have been found, in the mouse, there are several hundred active intracisternal A-particles (IAPs) and at least ten copies of MusD. Indeed, sequences of IAPs and MusDs contain frequent G to A transversions in their genomes. In addition, using transient expression assays in cells, hA3G and mA3 inhibit the retrotransposition of IAP and MusD.
Thus, APOBEC proteins also block the movement of some mobile genetic elements, most likely in germ cells and during embryogenesis, in mammals.
Inga kommentarer:
Skicka en kommentar