HIV -1 Vif ja sitä vastustava APOBEC

LÄHDE:

Nucleic Acids Res. 2010 Nov 13. Importance of the proline-rich multimerization domain on the oligomerization and nucleic acid binding properties of HIV-1 Vif.

Bernacchi S, Mercenne G, Tournaire C, Marquet R, Paillart JC.

Abstrac t(Suomennosta)

• HIV-1 virus tarvitsee tehokkaaseen infektiivisyyteen viruksen infektiivisystekijän Vif.
• Vif tekijää vastustava solun puolustus on eräs proeiiniperhe APOBEC: APOBEC-3G, solun sytosiinideaminaasi, lyhennys niistä on A3G ja A3F.
  

The HIV-1 viral infectivity factor (Vif) is required for productive infection of non-permissive cells, including most natural HIV-1 targets, where it counteracts the antiviral activities of the cellular cytosine deaminases APOBEC-3G (A3G) and A3F.

• HIV viruksen Vif on multimeerinen valkuaisaine ja siinä on eräs kriitinen rakenneosa viruksen infektoimiskyvyn taustana . Tämä kohta, domaani, on proliiniaminohappopitoinen ja se kuvataan nimellä (161)PPLP(164). Tämä kohta vastaa Vif-tekijän oligomerisaatiosta, mikä on sen funktiolle ja infektiivisyydelle välttämätön muutos multimeeritilasta.
  

Vif is a multimeric protein and the conserved proline-rich domain (161)PPLP(164) regulating Vif oligomerization is crucial for its function and viral infectivity.

• Tutkijat tekivät tutkimusta oligomerisaatiosta mutaation avulla, missä proliinin kohdalle asetettiin alaniini A. Koeputkessa he havaitsivat että normaali proliinipitoinen Vif muodosti 5- 9 proteiinin oligomeerejä ja alaniinipitoinen vain dimeerejä(2 kpl) tai trimeerejä (3 kpl proteiineja).
  

Here, we expressed and purified wild-type Vif and a mutant protein in which alanines were substituted for the proline residues of the (161)PPLP(164) domain. Using dynamic light scattering, circular dichroism and fluorescence spectroscopy, we established the impact of these mutations on Vif oligomerization, secondary structure content and nucleic acids binding properties. In vitro, wild-type Vif formed oligomers of five to nine proteins, while Vif AALA formed dimers and/or trimers.

• Sitoutumattomasta proliinipitoisesta Vif- proteiinista voi 40 % olla laskostumatonta, mutta sitoutua HIV-1 TAR kärkisilmukkaan edistäen beeta-tuppien muodostusta.
  

Up to 40% of the unbound wild-type Vif protein appeared to be unfolded, but binding to the HIV-1 TAR apical loop promoted formation of β-sheets.

• Alaniinisubstituutio ei merkitsevästi vaikuttanut Vif-proteiinin sekundäärirakenteeseen, mutta vähensi sen nukleiinihappospesifisyyttä ja sitoutumiskykyä.
  

Interestingly, alanine substitutions did not significantly affect the secondary structure of Vif, but they diminished its binding affinity and specificity for nucleic acids.

• Tutkimuksessa (dynamic light scattering) Vif oligomerisaatio ja laskostumista edistävien nukleiinihappojen kanssa kansas tapahtuva vuorovaikutus suosivat suurimolekulaaristen kompleksien muodostumista.
  

Dynamic light scattering showed that Vif oligomerization, and interaction with folding-promoting nucleic acids, favor formation of high molecular mass complexes.

• Näillä ominaisuuksilla voi olla merkitystä niille Vif funktioille , jotka koskevat RNA:ta.
  

These properties could be important for Vif functions involving RNAs.

PMID: 21076154 [PubMed - as supplied by publisher]Free Article