Leta i den här bloggen

torsdag 23 oktober 2014

Isäntäsolun Karyopherin alfa 1, johon EBOV VP24 kiinnittyy

Kuva esittääkysymyksen: meneekö VP24 itse  tuolla karyopherin-alfa-osoitelapulla  tuman puoellle.Violetti  dimeeri kuvaa isäntäsolun PY-STAT1 tekijää, joka koetaa  saada osoitelappua tuman suuntaan, muta Ebov tekijä( kolmio) nappaa signaalin ja  ehkä menee itse tumaan. tuman puolelle,arvelee kuvan tekijä.  Toisaalta on osoitettu että  VP24 tekijää  myös hyäkkää suoraan STAT1 kimppuun.
Mitä se VP24  siellä tumassa tekisi ??
  • Minkälainen on Karyopherin alpha 1, isäntäsolun molekyyli, tumaan johdattava signaali.

From Wikipedia, the free encyclopedia
Karyopherin alpha 1 (importin alpha 5)
Protein KPNA1 PDB 2jdq.png
PDB rendering based on 2jdq.
Available structures
PDB Ortholog search: PDBe, RCSB
Identifiers
Symbols KPNA1 ; IPOA5; NPI-1; RCH2; SRP1
External IDs OMIM600686 MGI103560 HomoloGene55642 GeneCards: KPNA1 Gene
RNA expression pattern



More reference expression data
Orthologs
Species Human Mouse
Entrez 3836 16646
Ensembl ENSG00000114030 ENSMUSG00000022905
UniProt P52294 Q60960
RefSeq (mRNA) NM_002264 NM_008465
RefSeq (protein) NP_002255 NP_032491
Location (UCSC) Chr 3:
122.14 – 122.23 Mb
Chr 16:
35.98 – 36.04 Mb

PubMed search [1] [2]
Importin subunit alpha-1 is a protein that in humans is encoded by the KPNA1 gene.[1]
Recombination activating proteins RAG1 and RAG2 regulate and mediate V(D)J recombination, the process by which genes for immunoglobulins and T-cell receptors are generated. Several other ubiquitously expressed proteins are thought to be recruited in the recombination process. Among these are the genes affected in severe combined immune deficiency and genes involved in ds-DNA break repair. The protein encoded by this gene interacts with RAG1 and may play a role in V(D)J recombination[2]

Interactions

Karyopherin alpha 1 has been shown to interact with KPNB1[3][4] and UBR
Tähän voi siis lisätä: EBOV VP24  ja  PY-STAT1
 

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar