Sars-2 viruksen envelope(E) proteiinin mutaatioista Omicronvarianteissa BA. 1, BA.1.1 ,BA.2 ja BA.3 on thr9ile mutaatio E-proteiinissa.

eräässä  sars-2 E-proteiinissa  on   seuraavat 75 aminohappoa:

1  MYSFVSEETC  TCIVNSVLLF LAFVVFLLVT   30

31 LAILTALKLC AYCCNIVNVS  LVKPSFYVYS  60

61  KVKNLNSSRV PDLLV 75.

 

 E- proteiinin mutaatioita  ei ole paljon havaittavissa Sars-2 virusetn  peptidirakenteen luetteloissa (GISAID). Muutamia kuitenkin silloin tällöin näkyy, joten niiden merkitystä pitää katsoa. E on virulenssissa merkittävä  struktuuriprotiini.  Ylläolevassa  löytämässäni i  sekvenssissä näyttää olevan F73L  vaihtunut verrattuna  allaolevan artikkelin  antamaan motiiviin. .

Tässä  liitteenä olevassa artikkelissa mainitaan  "Sars-2 E-proteiinin  DFLV (72-75)  motiivikohdan "olevan useimmin mutatoituut ja   E- mutaatioita havaitun  259;  niistä 16 on tuossa motiivissa.  Mainitaan myös   mutaatioista S68F,  P71S ja L73F. Näiden tiedetään  vaikuttavan E- proteiinin rakenteeseen stabiilisuutta, mutta merkitystä patogeenisyyteen ei  tässä  näihin mainita. 

 Kirjoittaja katsoo näiden E-mutaatioiden tutkimisen  ja tuntemisen olevan hyödyksi rokotteiden suunnittelussa.

. 2021;25:100675.

doi: 10.1016/j.imu.2021.100675. Epub 2021 Jul 27.

Emerging mutations in envelope protein of SARS-CoV-2 and their effect on thermodynamic properties

Kejie Mou  ¹ , Mohnad Abdalla  ² , Dong Qing Wei  ^{3   4} , Muhammad Tahir Khan  ⁵ , Madeeha Shahzad Lodhi  ⁵ , Doaa B Darwish  ⁶ , Mohamed Sharaf  ^{7   8} , Xudong Tu  ⁹

Affiliations

• PMID: 34337139
• PMCID: PMC8314890
• DOI: 10.1016/j.imu.2021.100675

Free PMC article