Komparoin delta ja omikronvarianttilaumaa: Delta varioi työvälineitään eri kirjolla kuin Omikron

 Omikronin muutamat  variantit eivät niin konservoidusti modifioi  Orf3a, Orf7a,7b tekijöitä kuin delta,  vaan  se muteeraa varsinaiset  E ja M proteiinit ( ehkä stabiilimmiksi)Tällöin  saattaa  virulenssiin tulla nopeustekijää  lisää joistain edullisista  muutoksista. Polyproteiini on myös  luonut toisen motiivin, jota kai on konservoimassa.  Joitain samoja  suuntauksia o deltalla L ja V aminohappojen kanssa. Deltan variantit ( yli sata)  toimivat kuin koneet konservoiduin nsp-motiivein ja valikoiduin S-mutaatioin. Omikronin suuri rönsyilevyys varmaan ajan mittaan karsiutuu, mutta tovottavasti kilpajuoksussa ehditään mukaan sen heikkoon kohtaan, organisatoriseen kaotisuuteen.

E (ORF4), struktuuriproteiini

Jokaisella on E mutaatio  T9I. Tämä on myös BA.3 variantilla. 

M (ORF5), struktuuriproteiini

M-proteiinissa on seuraavat mutaatiot:D3G, A63T, Q19E     Omikronvarianteilla   BA.1, BA.1.1  ja  BA.2.

Omikron BA.3 omaa  M-proteiinissa  vain kaksi mutatiota; Q19E ja A67T. 

 N (ORF9) , struktuuriprotiini , primary splicing

N-proteiinin  muutokssissa on eroja BA:3 variantilla verrattuna  BA.1, BA.1.1 ja BA.2 variantteihin, joilla on taas  samanlaiset  N-kapseliproteiinien mutaatiokirjot: P13L, deletio 31/33, R203K ja Q204R.

  Tähän  joukkoon BA.3 lisää vielä S213R substituution. 

ORF8

Ei-rakenteellisista (NS)  orfeista ORF8 näyttää  joissain omikroneissa   omaavan  mutaation S84L  ( varianteissa  BA.1 ja BA.1.1 sekä BA.3).

Eräässä artikkelissa  selvitettiin, minkälaisia  polypeptidigeenistä muodostuvia  aminohappomutaatioita tulee  ei-rakenteellisiin nsp-proteiineihin omikroneissa.  Niitäkin muutoksia oli kymmenkunta. Niistä onkin maininta jo edellä  varianttien  kohdalla. Kohdat onmyös  tarkennettavissa  yksityiskohtaisesti ( aminohapposubstituutioina)  eikä vain  järjestyksensä mukaisesti. 

Esimerkkeinä  eräistä  selville saaduista, omikron- polyproteiinin  pilkkoutuneissa  nsp-tekijöissä esiintyvistä mutaatioista  :

Orf1a alueelta: 

nsp3: K38R, ( -S1265 deletio ), L1266I, A1892T.

nsp4: T492I;

nsp5: F132H;

nsp6: (deletio105-107), I189V

Orf1b alueelta:

nsp12:P323L;

nsp14: I42V.