SVT.se kertoo omikronin varianteista nyt :
Omikron esiintyy nyt vasta seuraavissa muodoissa
’Omikron nolla’ (omikronin alkuluomismuoto, jo sta seuraavat hahmottuivat esiin)
BA.1 omikron,
BA.2 omikron,
BA.3 omikron.
Varianttien epitooppikokoomuksessa on hieman eroa. Olen katsonut tänään aminohappolaatuja epitoopeissa, en niinkään sitä mistä aminohaposta uusi epitooppi on tehty vaan mikä pinnalla näkyy. Vertailen edeltäneisiin VOC ja VOI varianteeihin myös:
Alfa variantin spike-substituutiot: D I HH Y G
Beta-variantin substituutiot: D V K Y G N
Gamma-variantin substituutiot: SS T I K FF YYY G N
"Delta parent" substituutiot: K GG N RRR
Delta-alalinjan AY.4.2.
substituutiot: D V I H K
GG N RRR
Lambda-variantin substituutiot: V I Q G NN
Mu-variantin substituutiot: S I H KK Y G NN
"Omikron parent": A D SS L EE HHH KKKKKKK FF YYY PP G NN RR
Omikron alalinjan BA.1 substituutiot: A DD S VLII EE HHH KKKKKKK FF YY PP G N RR
Omikron alalinjan BA.2. substituutiot: AA DDD SS I EE HHH KKKK FF YYY PP G NNN RR
Omikron alalinjan BA.3 substituutiot: A DD S VII EE HHH KKKK YYY PP G NN RR
(epitooppeja uusissa substituutioissa laadullisesti ryhmiteltynä
Lisäksi omikroneissa on 215 EPEmerkkaan mukaan, ja olen asettanut nuo aminohapot myös esiin.
Tässä luettelossa en ole otanut mukaan deleetioitten sisältämien aminohappojen nimiä ja laatuja. Pitä tuntea aminohappojen ominaisuuksia, että näkee mikä on se laadullinen muutos, mitä omikroneissa on tapahtunut aiempiin verrattuna. Niistäkin asiosita löytyy jo vertailevia artikkeleita.
Uutinen Tanskasta:
Ny omikronvariant tar över i Danmark
En ny variant av omikronviruset håller på bli dominerande i Danmark. I Sverige har 481 fall upptäckts, enligt Folkhälsomyndigheten. Den nya varianten, som går under namnet BA.2, stod för 45 procent av de danska smittofallen under vecka 2, en dryg fördubbling jämfört med hur det såg ut runt nyår. Liknande tendenser syns även i Norge och Storbritannien, rapporterar Svenska Dagbladet. I Sverige har hittills 481 fall bekräftats och andelen ökar, skriver Dagens Nyheter med hänvisning till Folkhälsomyndigheten.
Tässä artikkelissa punnitaan Spike ja RBD- syunstituutioiden merkitystä ACE2 reseptoriaffiniteetille.
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1477893921002751?via%3Dihub
Inga kommentarer:
Skicka en kommentar