Omicronvariantti BA.3 ( alias B.1.1.529.3)

 

 BA.3, (BA.1.1.529.3)

BA.3 havaittiin  18.11.2021 ensi kerran ja viimeinen näyte on sekvensoitu 20. tammikuuta 2022. Sekvenssejä on  254  ja niitten maailmanlaajuinen esiintymä on alle puoli prosenttia.

Tässä  variantissa  polyproteiinin   Orf1a ja Orf1b alueella  ovat  vain  nämä  substituutit: H ja L. Ne vastaavat substituutioita P3395H ja  vastaavasti P314L.

Spike-substaatioitten jälkeen tulee struktuuriproteiinien  substituutiot ja deleetio: I, L, del, L,K,R. (motiivi) 

Ne vastaavat seuraavia kohtia:

 E-proteiini: T9I; 

Orf8: S84L. 

N-proteiini: P13L,  Deletio 31/33, R203K, G204R.

Spike alueella  ilmenee seuraavat  mutaatiot:V, del, I, I, del, G,Y, K, H,Y,H,K. Siis lie vain 10 substituutiota   BA3-variantin S-proteiinissa. 

Kohta G,Y,H,K oli kaikissa neljässä variantissa ja muutama muukin  kohta  on  samanlainen.

Tarkennettuna nämä  Spike mutaatiot (10)  ja deleetioalueet  (2)  ovat: 

 A67V, T95I, del69/780, 

N211I, del212/212,

 D614G, H655Y, N679K, P681H, 

D796Y, 

Q954H, N969K.

Tälle variantille on tyypillistä  muutama samankaltaisuus BA.1 variantin alku ja loppupään kanssa ja  keskikohta, jossa on  aminohapposubstituutioita  300- ja 400 alkuisilla numeroilla  ei  esiinny , vaan tilalla on ne wuhan  referenssiaminohapot.  

Tietoja olen keränyt WHO VOC-varianttien linkin kautta.. Tämän BA3:n käyrä alkoi näkyä marraskuulta ja sitten on hieman madellen  esiintynyt pientä lainetta  ja nyt näyttää laskevan kohti nollaa.  Esiintymä ei ole päässyt 0,0 prosenttia korkeampiin näyttämiin, mutta  variantissa on  tarkkailtavia  substituutioita ja kyllä se Sars-2  omikron virus on, vaikka minimalistisella  motiivilla. .