SARS-CoV lisäproteiineja on pystytty visualisoimaan 2015

Search results

Items: 16

Select item 265794801.

•  Kaksimolekulaarisesti fluoresoivalla komplementaatiomenetelmällä saatu näkyviin  SARS-koronaviruksen lisäproteiineja. (2015)

Interactions among SARS-CoV accessory proteins revealed by bimolecular fluorescence complementation assay.
Acta Pharm Sin B. 2015 Sep;5(5):487-92. doi: 10.1016/j.apsb.2015.05.002. Epub 2015 Jun 6
Kong J¹, Shi Y¹, Wang Z¹, Pan Y². Abstract

• Suomennosta tiivistelmästä: 

• SARS- koronaviruksen lisäproteiinit ( 3a, 3b, 6, 7a, 7b, 8a, 8b, 9b ja ORF14) ovat ennakoituja tuntemattomia proteiineja (PUP, predicted unknown proteins), joita geenit koodaavat ja joiden katsotaan olevan ainutlaatuisia jokaiselle  SARS-CoV- virusgenomille, josta vaikeaa hengitystieoireyhtymää aiheutuu. Näillä proteiineilla on tärkeä osa erilaisissa biologisissa prosesseissa, joita välittää interaktiot näiden proteiinien ja niiden partnereitten kesken. Kuitenkin tiedetään hyvin vähän näistä lisäproteiinien keskuudessa vallitsevista interaktioista (vuorovaikutuksista).

•  Tässä tutkimuksessa käytettiin bimolekulaarisesti  keltaista fluoresoivaa proteiinien mittausmenetelmää (BiFC) (EYFP )   selviteltäessä näiden lisäproteiinien keskinäisiä vuorovaikutuksia.  Voitiin tunnistaa 33 interaktiota 81:sta  interaktiosta tällä kaksimolekulaarisella fluoresenssikomplementaatiomenetelmällä , mikä oli paljon enemmän kuin kaksihybridiseen hiivaan perustuvalla järjestelmällä (Y2H) saadut tulokset. 

•  Tämä on ensimmäinen raportti SARS-CoV- lisäproteiinien interaktioitten (vuorovaikutusten) visualisoimisesta, näkyviin saamisesta. Tämä viittaisi BiFC-systeemin yleiseen sovelluskelpoisuuteen proteiini-proteiini-interaktioitten todentamisessa. 

The accessory proteins (3a, 3b, 6, 7a, 7b, 8a, 8b, 9b and ORF14), predicted unknown proteins (PUPs) encoded by the genes, are considered to be unique to the severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) genome. These proteins play important roles in various biological processes mediated by interactions with their partners. However, very little is known about the interactions among these accessory proteins. Here, a EYFP (enhanced yellow fluorescent protein) bimolecular fluorescence complementation (BiFC) assay was used to detect the interactions among accessory proteins. 33 out of 81 interactions were identified by BiFC, much more than that identified by the yeast two-hybrid (Y2H) system. This is the first report describing direct visualization of interactions among accessory proteins of SARS-CoV. These findings attest to the general applicability of the BiFC system for the verification of protein-protein interactions.

Avainsanoja, KEYWORDS:

Aktivaatiodomeeni, AD, activation domain;
Lisäproteiineja, (Apuproteiineja), Accessory proteins;
Sitova domeeni, BD, binding domain;
kaksimolekulaarinen fluoresenssikomplementaatiomenetelmä , BiFC, bimolecular fluorescence complementaatio, Bimolecular fluorescence complementation assay;https://de.wikipedia.org/wiki/Bimolekulare_Fluoreszenzkomplementation https://www.fpbase.org/protein/eyfp/
proteiinikompleksin immunosaostus , Co-IP, Co-immunoprecipitation; Protein complex immunoprecipitation (Co-IP)
vaippa, E, envelope; (Vaippaproteiinin merkki)
Vaippa Joillain viruksilla nukleokapsidia ympäröi lipideistä koostuva kaksoiskerroksinen kalvorakenne, vaippa, joka on peräisin isäntäsolusta. Vaippaan on uponneena viruksen koodaamia proteiineja, yleensä glykoproteiineja, joilla on tehtävä isäntäsolun tunnistamisessa ja infektion aloitamisessa.(Ruotsiksi Lipidhölje)
vahvistetusti  keltaista fluoresoiva proteiini, EYFP, enhanced yellow fluorescent protein;
kalvo, M, membrane;kalvoproteiinin (M) merkki
nukleokapsidi, N, nucleocapsid;nukleokapsidiproteiinin merkki (N)
tumaan paikallistava signaali, NLS, nuclear localization signal;
aukinaisia luettavissa olevia lukuraameja,  avoimia lukukehiöitä,  ORFs, open reading frames;
polymeraasiketjureaktio, PCR, polymerase chain reaction;
proteiinien keskinäisiä  vuorovaikutuksia,  PPIs, protein-protein interactions;
ennustettavissa olevia tuntemattomia proteiineja,  PUPs, predicted unknown proteins;
piikki, S, spike;
vaikeaa hengitystieoireyhtymää aiheuttava koronavirus SARS-CoV; SARS-CoV, severe acute respiratory syndrome coronavirus;
kaksihybridinen hiivamenetelmä Y2H; Y2H, yeast two-hybrid;
aminohappo, aa, amino acids

PMID:

26579480

PMCID:

PMC4629423

DOI:

10.1016/j.apsb.2015.05.002

Free PMC Article

Back to top