SARS-CoV lisäproteiini 3a omaa myös viaporiini kanavan kuten E ja voi aktivoida NOD-kaltaisia reseptoreita ja tätä tietä inflammasomin ja herättää interleukiinieritystä, sytokiineja. Arvellaan että tämä myöhäisfunktio toimii viruksen E- proteiinifunktion vaimentajana siinä vaiheessa kun virionit jo valmistuvat ja ovat lähdössä pois solusta, jolloin on eduksi saada funktion vaimennuksia. E-proteiini taas on saanut aikansa stabiiliutta itselleen ubikitinaastiosta, jonka virus itse tekee nsp3- tietä ja samalla deubikitinoi isäntäsolun järjstelmiä ja suppressoi täysin IFN- järjestelmän ja ISG15 välitteiset vaikutukset.
Nsp3:n DUB- ubikitiiniligaasi- duaalifunktiossa on jotain samanlaista kuten OTU ryhmässäkin, jossa löytyy duaaleja DUBeja ( siis saman proteiinin toisessa päässä on deubikitinointikykyä ja toisessa ubikitinointikykyä. Lisäksi Nsp3 deisgyloi. ISG15 on rakenteeltaan kuin di-ubikitiini: kaksi ubikitiiniketjua peräkkäin.
Tietysti E vaimenee, jos virus itse deubikitinoisi myöhäisvaiheens, mutta kapea-alainen vaimentaminen jollain spesiaalityöntekijä, lisäproteiinilla, on loogista. ja E-proteiini saa hoitaa virionit perille asti. Loppuvaiheessa (histopatol) keuhkokudoksessa nähdään näitä neutrofiileja, makrofageja, ja mitä nyt inflammasomiaktivaatiosta voi tulla.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Coronavirus+Inflammasome%2C+NOD
Front Microbiol. 2019 Jan 29;10:50. doi: 10.3389/fmicb.2019.00050. eCollection  2019.
Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus Viroporin 3a Activates the NLRP3 Inflammasome.
Suomennosta tiivistelmästä: 
NODin kaltaiset reseptoriperhe, pyriinidomeenin3 sisältävä NLRP3   
säätelee interleukiinien IL1beta ja IL-18 erityistä.
 Nämä interleukiinit ovat proinflammatorisia sytokiineja.  
Tutkijaryhmä on aiemmin osoittanut, että influenssaviruksen  membeaaniproteiini M2 tai enkefalomyokardiittiviruksen (EMCV) 2b-proteiini stimuloivat interleukiinin IL-1beta eritystä, kun inflammasomi NLRP3 aktivoitui Mutta SARS-koronaviruksen mekanismia, jolla se saa aikaan NLRP3:n aktivoitumisen  , ei ole   aiemmin tunnettu. 
Tässä työssään tutkijat pystyvät antamaan suoraa näyttöä siitä, että SARS-CoV  3a proteiini  aktivoi inflammasomin NLRP3 sellaisissa  makrofageissa,  joissa oli  LPS primeeraus. SARS-CoV 3a oli riittävä tekijä aiheuttamaan inflamamsomin NLRP3 aktivaation.  Tässä  3a-pvälitteisessä-  interleukiinin  IL-1beta erityksessä oli  3a-proteiinin jonikanavan aktiivisuus essentielli, välttämätön seikka. Infektoitumattomissa soluissa tai lentiviruksella infektoituneissa soluissa, joissa oli jonikanava-aktiivisuudelta  vajeinen  3a-proteiini,  nämä inflammasomit  NLRP3 sijaitsivat  tasaisesti jakaantuneena sytoplasmaan . Mutta  jos infektoituneissa lentiviruksissa oli kunnolla toimivan jonikanavan omaava  3a-proteiini,  NLRP3-inflammasomit  järjestäytyivät  uudelleen asettuen  solujen perinukleaariseen tilaan, siis  tuman lähistöön. NLRP3- Inflammasomien  SARS-CoV 3a- aktivaatiossa oli tärkeänä tekijänä Kaliumjonien (K+) ulosvirtaus ja ROS ( reaktiiviset happilajit). Nämä tulokset valaisevat viroporiinien tärkeyttä  transmembraanisina (kalvon läpi johtavina) aukkoa muodostavina virusproteiineina viruksen alkuunsaamissa NLRP3-inflammasomien aktivoimisessa.  
- Nod-like receptor family, pyrin domain-containing 3 (NLRP3) regulates the secretion of proinflammatory cytokines interleukin 1 beta (IL-1β) and IL-18. We previously showed that influenza virus M2 or encephalomyocarditis virus (EMCV) 2B proteins stimulate IL-1β secretion following activation of the NLRP3 inflammasome. However, the mechanism by which severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) activates the NLRP3 inflammasome remains unknown. Here, we provide direct evidence that SARS-CoV 3a protein activates the NLRP3 inflammasome in lipopolysaccharide-primed macrophages.
 - SARS-CoV 3a was sufficient to cause the NLRP3 inflammasome activation. The ion channel activity of the 3a protein was essential for 3a-mediated IL-1β secretion. While cells uninfected or infected with a lentivirus expressing a 3a protein defective in ion channel activity expressed NLRP3 uniformly throughout the cytoplasm, NLRP3 was redistributed to the perinuclear space in cells infected with a lentivirus expressing the 3a protein.
 - K+ efflux and mitochondrial reactive oxygen species were important for SARS-CoV 3a-induced NLRP3 inflammasome activation. These results highlight the importance of viroporins, transmembrane pore-forming viral proteins, in virus-induced NLRP3 inflammasome activation.
 
KEYWORDS:
IL-1β; SARS-CoV; inflammasome; inflammation; viroporin- PMID:
 - 30761102
 - PMCID:
 - PMC6361828
 - DOI:
 - 10.3389/fmicb.2019.00050
 
Inga kommentarer:
Skicka en kommentar