Mutatoituuko nykyinen pandeminen virus koko ajan?

Kiertävät A H1n1 virukset, Circulating A H1N1 types
Marraskuu 30, 2009,November 30, 2009

LÄHDE: Fereidouni S, Beer M, Vahlenkamp T, Starick E. Differentiation of two distinct clusters mong currently circulating influenza A(H1n1)v viruses, March-September 2009. Euro Surveill. 2009 Nov 19;14(46). pii: 19409. Friedrich-Loeffler-Institut, Greifswald-Insel Riems, Germany.

Saksalaiset ovat tehneet analyysiä pandemisista A H1N1 viruksista maaliskuusta syyskuuhun 2009 kuluneelta ajalta ja siitä jaksosta on havaittu kaksi hyvin lähityyppistä, mutta selvästi kuitenkin toisistaan erottuvaa virusryvästä kiertämässä useimpia influenssan kynsissä olevia maita samaan aikaan.

Luonteenomaisimmat erot sijoittuvat niihin geeneihin, jotka koodaavat viruksen kahta pintaproteiinia (HA, geeni 4 ja NA, geeni 6) hemagglutiniinia ja neuraminidaasia ja neljää viruksen sisäproteiinia: PB2 polymeraasialayksikköä( geeni 1) , nukleoproteiinia NP (geeni 5) , matrixproteiinia M (geeni 7) ja nonstrukturellia NS1 proteiinia ( geeni 8). Fylogeneettista johtopäätöstä osoitettiin a.o. geenien analyysein ja sekvenssiketjukonstruktioin.

VRT. kuvaa:Kertausta influenssaviruksen kahdeksasta geenistä :
http://www.aaas.org/news/releases/2009/images/0522us_swine_flu_chart1.jpg

Geeni 1. Proteiini PB2 ja geeni 3 ja sen koodaama proteiini PA: (alkujaan linnusta sikakantaan siirtynyt influenssavirus ja 1998 viruksen kaltaista) (Kts.” Punainen sika”)

Geeni 2. proteiini PB1 , linnuista alunperin ihmiseen 1968 ja sitten sikakantaan 1998 , tyypiltään. (”Sininen sika”)

Geeni: 4. HA; Geeni 5. NP; Geeni 8. NS

Näitten tie on kulkenut linnuista 1918 kohti sikakantaa ja kyse on klassillisesta sikainfluenssavirustyypistöä (”Keltainen sika”)

Geeni 6. NA; Geeni 7. MA

Näitten tie on kulkenut lintuviruksesta 1979 sikakantaan ja esiintyy euraasialaisessa sikainfluenssaviruksessa. (”Kts. Vihreä sika)

Punaisen , sinisen ja keltaisen sikainfluenssaviruksen kesken on tapahtunut kolminkertainen uudelleenjärjestymä näisllä väriellä merkatuissa geeneissä.

Tästä kuvasta näkee, että A H1N1 designissa on vanhan ihmis-influenssan ominaisuuksia geenissä PB1.

Muissa geeneissä taas ei ole tunnusmerkkejä siitä, että niitä olisi esiintynyt ihmiskunnassa. Joten hyvin painotetusti virus on ihmiskunnassa pandeminen( novel).

http://www.fao.org/AG/AGAInfo/programmes/en/empres/AH1N1/Background.html