Matrixproteiini M2 muuntelee.

MATRIX PROTEIINI M1, M2.
Geeni 7 tuote.
Norjalaisen viruksen M1 proteiini: Sen C-terminaalinen jakso( samanlainen kuin esim katalonialaisen)
/collection_date="08-Sep-2009"
Protein 1..252
/product="matrix protein 1"
Region 2..157
/region_name="Flu_M1"
/note="Influenza Matrix protein (M1); pfam00598"
/db_xref="CDD:109646"
Region 158..252
/region_name="Flu_M1_C"
/note="Influenza Matrix protein (M1) C-terminal domain;
smart00759"
/db_xref="CDD:128998"
CDS 1..252
/gene="M1"
/coded_by="CY052001.1:11..769"
ORIGIN
1 mslltevety vlsiipsgpl kaeiaqrles vfagkntdle almewlktrp ilspltkgil
61 gfvftltvps erglqrrrfv qnalngngdp nnmdravkly kklkreitfh gakevslsys
121 tgalascmgl iynrmgtvtt eaafglvcat ceqiadsqhr shrq//matttn plirhenrmv
181 lasttakame qmagsseqaa eamevanqtr qmvhamrtig thpsssaglk ddllenlqay
241 qkrmgvqmqr fk


Norjalaisen viruksen M2 proteiinista annetaan kaksi hieman poikkeavaa versiota.

//
10 20 30 40 50 60 70 80
....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|
gi 81936884 1 MSLLTEVETPIKSGWECRCNDSSDLLVAIASITGILHLILWIFDRLFFKCAYRRFRHGLKRGPSTGGIPESMREEYRQEQ 80
gi 82053560 1 MSLLTEVETPTRNEWECRCSDSSDPLVVAASIIGILHLILWILDRLFFKCIYRRLKYGLKRGPATAGVPESMREEYRQEQ 80
90
....*....|....*..
gi 81936884 81 QSDVNVDNGHFVNIELE 97
gi 82053560 81 QSAVDVDDGHFVNIELE 97

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=109647

Vertaan Tukholmalaiseen virukseen , sen M2 proteiiniin.
1 mslltevetp triewecrcs dssdplviaa niigilhlil witdrlffkc iyrrfkyglk
61 rgpstegvpe smreeyqqeq qsavdvddgh fvniele
Tämä on kuin kolmas versio ja sekamuoto kaikista kolmesta.

1..97
/organism="Influenza A virus (A/Stockholm/36/2009(H1N1))"
/strain="A/Stockholm/36/2009"
/serotype="H1N1"
/host="Homo sapiens; gender: F; age: 50"
/db_xref="taxon:657983"
/segment="7"
/country="Sweden: Stockholms Lan"
/collection_date="29-May-2009"
/note="in country transmission via family member returning
from USA"
Protein 1..97
/product="matrix protein 2"
Region 1..97
/region_name="Flu_M2"
/note="Influenza Matrix protein (M2); pfam00599"
/db_xref="CDD:109647"
CDS 1..97
/gene="M2"
/coded_by="join(GQ365365.1:33..58,GQ365365.1:747..1014)"
ORIGIN
1 mslltevetp triewecrcs dssdplviaa niigilhlil witdrlffkc iyrrfkyglk
61 rgpstegvpe smreeyqqeq qsavdvddgh fvniele

JOHTOPÄÄTÖKSENI.
M2 muuntelee suhteellisen runsaasti.