Leta i den här bloggen

onsdag 19 juli 2023

Riboviria, Nidovirales,Cornidovirinae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Alphacoronavirus: TEGACOVIRUS, Alphacoronavirus 1: (CCV, FCEV, FCIP, SECV, TGEV)

 Tegacoviruksiin kuuluva alfakoronavirus 1-ryhmä käsittää koirien (Canine CoV) ja  kissojen (Feline CoV) koronaviruksia, sikojen  suolistoalueen koronaviruksia (Swine enteric Cov) ja  tarttuvaa gastroenteriittivirusta (Transmissible gastroenteritic virus).


Koiraeläinten  (CCV) koronaviruksen alalajeja esiintyy myös ferretissä,  täplikkääsä hyeenassa ym.

 Niitä tunnetaan  muun muassa  seuraavilla koodeilla: 1-71, BGF10, MJ17,  Enteric insavc-1, enteric K378, Chinese ferret badger CoV DM95/2003, Raccoondog CoV GZA3/2003, Spotted hyena CoV) 

Kissaeläinten koronaviruksia (Feline CoV) on enteristä ( suolistoaluetta koskevaa)  laatua kahta eri tyyppiä Tyyppi I: FECV, Feline enteric CoV strain (79-1683)  ja Tyyppi II: FIPV (Feline  infectious peritonitis virus (79-1149). FECV mutatoituu muotoon FIPV ja siihen voi kuulua  koronavirustulehdukseen liittynyt  orchitis, joka on vakava progressiivinen  ja nekrotisoiva.  Letaaliin systeemiseen infektiosta johtuvaan peritoniittiin  liittyy aivomuutoksia.

Sitten  on runsaasti  muita FeCoV  kissan koronaviruksia (kuten Acinonyx jubatus CoV, Feline CoV RM,  sekä  viruksia joissa on  nimessä  "uu(numero)"). 


Koiria ja kissoja syövät kulttuurit maailmassa :Koiria syödään 2,5 miljoonnaa vuosittain.

Näitä kulttuureita löytyy  USAsta, Siberiasta, Alaskasta, Kanadasta, Grönlannista, P-Koreasta, Eteläkoreasta,  Kiinasta,  Ranskan Polynesiasta, Sveitsistä, Vietnamista. 


ALFAKORONAVIRUSTEN  kaikki ryhmät lueteltuna ovat seuraavat:

COLACOVIRUS
DECACOVIRUS
DUVINAVIRUS (Tästä ryhmästä on ihmisvirus  HCoV229E)
LUCHACOVIRUS
MINACOVIRUS
MYOFACOVIRUS
PEDACOVIRUS
NYCTACOVIRUS
RHINACOVIRUS
SETRACOVIRUS (Tästä ryhmästä on ihmisvirus HCoV NL63, HCoV1196/2001/NL, Human group1CoV associated with pneumonia sekä  HCoV 3363/2000/NL)
TEGACOVIRUS
sekä  UNCLASSIFIED alfaCoV 
 Luokittelemattomat alfa covirukset ovat runsas ryhmä)

https://www.genome.jp/virushostdb/view/


Feline coronavirus UU16

Scientific Name

Feline coronavirus UU16 [TAX:627434]

Lineage

Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; Tegacovirus; Alphacoronavirus 1; Feline coronavirus

Baltimore Group

IV: ssRNA(+)

Genome Type

Non-segmented

Genbank

FJ938058  

Feline coronavirus UU16, complete genome.

DBLINKS

ViralZone:  

genus, family



Known hosts (1)

Scientific Name

Felis catus [TAX:9685]

Lineage

Eukaryota; Opisthokonta; Metazoa; Eumetazoa; Bilateria; Deuterostomia; Chordata; Craniata; Vertebrata; Gnathostomata; Teleostomi; Euteleostomi; Sarcopterygii; Dipnotetrapodomorpha; Tetrapoda; Amniota; Mammalia; Theria; Eutheria; Boreoeutheria; Laurasiatheria; Carnivora; Feliformia; Felidae; Felinae; Felis

Evidence

GenBank

Evidence

Literature

   Reference

PMID: 22709821

      Authors

Chang HW, Egberink HF, Halpin R, Spiro DJ, Rottier PJ

      Title

Spike protein fusion peptide and feline coronavirus virulence.

      Journal

Emerg Infect Dis. 2012 Jul;18(7):1089-95.

DBLINKS

KEGG GENOME:  

T02385


Laboratory of Chemical Life Science | Kyoto University Bioinfomatics Center | Institute for Chemical Research


(Huom ihmiskunnassa  oleva nykyinen post-pandeminen koronavirus Sars-2  on  betakoronaviruksia ja  SARBECOVIRUS-ryhmää . MERS on MERBECOVIRUS ryhmää betakoronaviruksia)  

BETAkoronavirusten alaryhmien nimet ovat: EMBECOVIRUS, HIBECOVIRUS, MERBECOVIRUS, NOBECOVIRUS, SARBECOVIRUS sekä Unclassified beta-CoV).

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar