Leta i den här bloggen

torsdag 2 februari 2023

Nicknames, lempinimiä dominoiville varianteille

 Tästä linkistä saa lisätietoja joka koodista: koodi alkaa  Wuhan variantin A-linjasta, joten täytyy  selata siihen asti, kun alkaa omicron, B.1.1.529  ja siten kaikki  BA-linnjt ja niiden alakoodit. Aivan listan alapäässä siten löytyy X koodeja,XA-XZ, XAA-XAZ, XBA- jne . tärkeä monitoroitu alue on XBB . tämä allaoleva linkki on päivitetty muutamia viikkoja siten.  Niihin tehtävät muutokset ovat GITHUB Commits-listoissa kertymässä.  Käsiteltävänä olevat ovat  GITHUB Issues# asioissa.   Varianttien rakenteesta:  monomeerisestä peptidistä (ORF1a, ib, Spike, Orf3a, E, M, Orf6, Of7a, Orf7b, Orf8, Orf9, Orf10)  saa käsitystä PANGO luettelosta lisätietolinkeistä. Myös esiintymiskäyrät ovat  siinä CovLineages-linkissä. 
Näihin  pääsee WHO Omicron ikonista, siinä  oikealla listassa olevasta " sars-Cov-2 variants" linkistä ja  siitä avautuvasta VOC-taulukosta. VOC- taulukon alla on linkki PANGO-luetteloon.  Cov Lineages. Kun menee sille sivulle, mistä voi hakea eri linjoja, huomaa otsikkosivun yläreunassa linkin GITHUB-tietueeseen ( aktuelleihin  asiankäsitteyihin ja pohdintoihin).  ( Toinen tietue GISAID ottaa maailmalta vastaan sekvenssejä ja tiedottaa niistä).

 https://github.com/cov-lineages/pango-designation/blob/master/lineage_notes.txt

B.1.1.529 = Omicron. Saa lyhennyksen BA

BA.1 (BA.1.1)

BA.1 linjan alakoodeja:BC,BD.


BA.1.1.1= BC

BA.1.17.2 =BD.

BA.2

BA.2:n alakoodeja: BG, BW, BJ, BL, BM, BN, BP, BR, BS, BY, CA, CB, CH, CJ, CV, DD,DS.

BA.2.3.20, lempinimi “Basilisk”


BA.2.10 , lempinimi “Pisces”

BA.2.10, lempinimi “Argus”


BA.2.38.3.1, (BH.1). Lempinimi “Almops”


BA.2.75, lempinimi “Centaur”

BA.2.75.1 (BL)


BA.2.75.2 . (CA), lempinimi “Alcyon”


BA.2.75.3 (BM)

BA.2.75.3.1.1.1

BM.1.1.1 (CJ), lempinimi “Mimas”


BA.2.75.3.4.1.1, (CH)

CH.1.1.1 = DV


BA.2.75.4 (BR)


BA.2.75.5 (BN)

BN.1, lempinimi “Hydra”

(acbasiliqued S494P in BN.1.1)


BA.2.75.6 (BY)

BA.2.75.9 (CB)


XBB on rekombinaatio BA.2 alalinjojen kesken.


Argus” x “Mimas” = Gryphon tai “Griffon”



(BA.3 on hyvin vähän haaroittunut päälinja)


BA.4 pääryhmä.

Tällä ryhmällä on suhteellisen vähän alaryhmiä ja lisäkoodeja on tarvittu vain muutama.

BA.4.1.10 (CS)

BA.4.6 , “Aeterna

BA.4.6.5 (DC)



(BA.5.4 on poistettu nimi, koska kyse ei ollut omasta erillisestä linjasta , vaan BA.2 linjasta, josta kehkeytyi linja BA.4/5. Kun asia havaittiin , poistgettiintettiin turha merkintä BA.5.4)

BA.5.= omicron 5 eli B.1.1.529.5 = BA.5.


BA.5 pääryhmä

Sillä on alaryhmät .1, .2, .3, .5. jne. Jouduttiin jälkeenpäin poistamaan BA.5 .4, koska huomattiin, että kyse oli BA.2 linjasta, joka alkoi aiheuttaa näitä jatkohaaroja eli se tyvi olikin se BA.2)


BA.5.1 -ryhmästä alakoodeja: BK, CL, CU, DE, DH, DJ, DL.


BA.5.2 -ryhmästä alakoodeja: , BT, BU, BZ, CD, CE, CF, CG, CK, CN, CP, CR,CT, CY, DA, DB.

BA.5.2.1=BF

BF.7 (BA.5.2.1.7) , “Minotaur”


BA.5.3-ryhmästä alakoodeja: BE, BQ, CC, CQ, CW, CZ, DK, DM, DN, DP, DQ, DR, DT, DU.

BA.5.3.1=BE.

BE.1.1.1 = BQ.

BE.1.2.1=DW.

BA.5.3.1.1.1.1=BQ= B.1.1.529.5.3.1.1.1.1

BQ.1, “Typhon”

BQ.1.1, “Cerberus”

BA.5.6-linjasta alakoodi: BW.

BA.5.10-linjasta alakoodi:DF.

 

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar