Väitöstyön nimi: Molecular aspects on herpes simplex virus type 1 DNA replication and gene expression. Väitöstilaisuus on vielä edessä päin 26.1. Carl Kylberg salissa ja opponentti on Uumajan yliopistosta professori E Johansson.
Väitöstyön abstraktin ja osatöiden sisältöä saa tietää lähteestä
http://hdl.handle.net/2077/53912
Tässä työssä tutkijat ovat selvitelleet HSV-1 virusproteiinien keskinäistä vuorovaikutusta viruksen molekulaarisessa koneistossa.
Lisäksi he ovat tutkineet niitä molekulaarisia tarpeita, mitä viruksen DNA-replikaatiosta riippuvaisten myöhäisten geenien ilmenemiseen vaaditaan. Tarkka tieto näistä molekyylitason tapahtumista on avuksi kehiteltäessä antivirusterapioita ja ehkä edistyy samalla tietämys omien solujemmekin vastaavista tapahtumista.
Tutkijaryhmä on osoittanut lajispesifiseksi ne HSV-1 viruksesta löydetyt seitsemän proteiinia, jotka ovat sen DNA-replikaatiossa välttämättömiä. Niitä proteiineja ei voi korvata lähisukuisen viruksen homologisella proteiinilla. Siis ne seitsemän replikaatioproteiinia muodostavat eräänlaisen molekulaarisen koneiston, replisomin ja sille on ominaista lukuisat proteiini_proteiini-interaktiot.
Lisäksi tutkijaryhmä tunnisti HSV-1-helikaasi-primaasi-kompleksista entsymaattisesti inaktiivin UL8-proteiinin tärkeät aminohapot. Tämä UL8 tarvitaan interaktioon primaasikompleksin UL52- komponentin kanssa. Jos näissä UL8- aminohapoissa oli mutaatio, interaktio vaikeutui ja replisomin DNA-replikaatiokapasiteetti väheni tai jäi pois ei-permissiivisessä lämpötilassa.
Sitten tutkijat selvittivät HSV-1- viruksen helikaasi-primaasikompleksin UL52- komponentin ja muiden replikaatioproteiinien väliset interaktiot. He havaitsivat UL52-proteiinista erilaisia domaaneja ja joka domaanilla oli eri interaktiopartneri. UL52-N-terminaali teki stabiilin interaktion UL5:n kanssa. Keskimmäinen domaani teki stabiilin interaktion UL8:n kanssa. UL52-C-terminaali teki vain ohimenevän heikon interaktion UL5:n kanssa.
Uudet anti-HSV-1-lääkkeet kohdentavat vaikutuksensa juuri helikaasi-primaasikompleksiin, mutta ei ole tiedetty, millä tavalla ne ovat inhibitorisia eli replikaatiota estäviä. Nyt tutkijaryhmä on osoittanut, että nämä uudet lääkkeet estävät HSV-1 DNA:n replikaation vaikuttamalla UL5- ja UL52- proteiinien väliseen interaktioon. He ovat sitä mieltä, että lääkkeet lukitsevat nämä proteiinit tiettyyn konformaatioon estäen niitä olemasta avuksi viruksen DNA:n replikoitumisessa.
Tämän helikaasi-primaasi-kompleksi-interaktion lisäksi UL52-proteiinin keskimmäinen domaani ilmentää stabiilia vuorovaikutusta UL29/ICP8- nimiseen proteiiniin, joka on HSV-1 -viruksen ssDNA:ta sitova proteiini.
Näiden kahden proteiinin välinen interaktio voisi antaa viitettä, miten helikaasi-primaasikompleksi on HSV-1 genomissa pakattuna aktivoituun replikaation alkukohtaan ja syntetisoi primeereitä ICP8:lla verhotuilla ssDNA säikeillä.
Viraali DNA-replikaatio on edellytys HSV-1 viruksen todellisten myöhäisgeenien ilmenemiselle. Tutkijaryhmä osoitti myös, että näiden todellsiten myöhäisten geenien ilmenemä riippuu spesifisesti CDK9-kinaasista, joka on isäntäsolun proteiinikinaasi ja osallistuu solun transkription säätelyyn. Jos CDK9 estettiin, vaikuttui viruksen myöhän mRNA:n transkriptio ja sen kertymä sytosoliin. Toinenkin soluproteiini oli tarpeellinen viruksen myöhäisten geenien ilmenemiselle. Se on transkriptiotekijä SPT5, joka on CDK9-kinaasin susbtraatti. CDK9-aktiivisuutta virus tarvitsi välttämättä SPT5:n ja virusproteiini C27:n väliseen interaktioon; arvellaan sellaista vuorovaikutusta tarvittavan viraalin myöhäisen mRNA:n kypsymiseen ja kuljettamiseen pois tumasta
Tulokset viittaavat siihen, että HSV-1 -viruksen varsinaiset myöhäiset geenit ainakin osittain säätyvät viraalin myöhäisen mRNA:n kypsymisestä ja tumasta poiskuljetuksesta
I.
Muylaert, I, Zhao, Z, Andersson, T, Elias P. Identification of
Conserved Amino Acids in the Herpes Simplex Virus Type 1 UL8 Protein
Required for DNA Synthesis and UL52 Primase Interaction in the Virus
Replisome J Biol Chem. 2009 July; 287(40): 33142-52. VIEW ARTICLE II. Muylaert I, Zhao, Z, Elias P. UL52 Primase Interactions in the Herpes Simplex Virus 1 Helicase-Primase Are Affected by Antiviral Compounds and Mutations Causing Drug Resistance J Biol Chem. 2014 October; 289(47): 32583-92. VIEW ARTICLE III. Zhao, Z , Tang KW , Muylaert I, Samuelsson T, Elias P. CDK9 and SPT5 proteins are specifically required for expression of herpes simplex virus 1 replication-dependent late genes J Biol Chem. 2017 July; 292(37): 15489-00. VIEW ARTICLE | |
Date of Defence: | 2018-01-26 |
Inga kommentarer:
Skicka en kommentar