Sars-Cov-2 varianttien monitorointi jatkuu. Kasvava VOI varianttilinja XBB.1.16 saa alalinjoja edelleen.

 Eräs  alalinja on merkattu kodilla "FU" Alias XBB.1.16.1 .

Tämä  alalinja  FU.1 omaa  aminohapposubstituution Spike T547I. 

Sitten on havaittu  tälläkin FU.1 linjajlla runsasta alalinjaa, mutta   ei näytä olevan aminohapposubstituutiota, joten niitä on vaikea  hahmotella, kun ei vielä tiedetä, onko  kliinisiä merkityksiä, jotka poikkeaisivat  emolinjasta niin selvästi, että pitäisi merkata erikseen.

FU.1.1 linja on merkattu eri linjakseen pelkän nukelotidsimutaation perusteella. FU.1.1 ( nuc T3802C mutaatio).

Sitten  on lytynyt lisää alalinjaa FU.1 emolle (parent lineage) ja niitä tulee pitkin maapalloa GISAID tietueeseen , Nyt on koossa jo 1061 sekvenssiä linjaa,  jossa on nuc  A460G  mutaatio,  eikä vieläkään ole tunnistuksmerkiksi  aminohappomutaatiota. Tästä ollaan keskustelemasa.  Osa tutkijoista haluasi jo merkata tämän omaksi linjakseen ja joku tutkija vielä jarruttaisi, koska sitten alkaisi olla  usea linja pelkän synonyymisen mutaation perusteella   tunnistettu omana linjanaan Tietysti se on tutkijoille  kai yksinkertainen peruste sekin. 

Asista keskustellaan täss GITHUB kohdassa: Issue #2037.

 https://github.com/cov-lineages/pango-designation/issues/2037

Siteeraan vain  paikkakuntien nimet  ja maat  missä  tätä  linjaehdotusta  on popahtanut esiin:

China 642+3:
Shanghai 526, 88 imported: 6 HK, 7 Macao, 2 TW; 30 Thailand, 7 S. Korea, 4 UAE, 4 Singapore, 4 Japan, 4 Vietnam, 4 Malaysia, 3 Egypt, 2 US, 2 UK, 1 Deutschland, 1 Algeria, 1 Sweden, 1 Switzerland, 1 India, 1 NZ, 3 travelling info unavailable.
Hubei 24: 5 Jingzhou, 4 Huanggang, 3 Huangshi, 3 Ezhou, 2 Jingzhou, 2 Xiangyang, 1 Wuhan, 1 Xiaogan, 1 Enshi, 1 Shiyan and 1 Xianning.
Fujian 24: 12 Fuzhou, 3 Longyan, 3 Sanming, 2 Amoy, 2 Nanping, 1 Zhangzhou and 1 Quanzhou.
Anhui 21: 8 Hefei, 6 Bozhou, 5 Lu'an and 2 Fuyang.
Guangdong 12: 7 Shenzhen, 2 Guangzhou, 1 Meizhou, 1 Zhanjiang and 1 Dongguan.
Yunnan 9, city not assigned.
Sichuan 8: 2 Yibin, 2 Luzhou, 1 Neijiang, 1 Ya'an, 1 Guangyuan, 1 Liangshan.
Xinjiang 5: 3 Aksu, 1 Urumqi, 1 Kizilsu.
Jiangsu 4: 2 Zhenjiang, 1 Wuxi, 1 Changzhou.
Taiwan 3, all from Mainland.
Henan 2: 1 Hebi and 1 Xinyang.
Qinghai 2, all in Xining.
Beijing 1, Zhejiang 1(Hangzhou?), Heilongjiang 1, Shanxi 1(Jincheng), Liaoning 1(Chaoyang).

US 14: 1 from Deutschland, 1 from China Mainland, 2 from Taiwan, 1 from South Korea, 1 from Greece, 6 Airport Screening, 2 local cases in Washington State
South Korea 9: 4 from China, 2 from Switzerland, 1 from Turkey.
Japan 6, 5 Imported, at least 3 from China.
Australia 3(NSW 2, SA 1)
NZ 2(Auckland & Waitemata)
Singapore 2, all Local.
Austria 1(Vienna)
France 1(Occitanie)
Canada 1(Ontario)

Muistiin  19.6. 2023