https://swissmodel.expasy.org/repository/uniprot/P0DTD1?id=PRO_0000449620
Arvelen että kautta nsp2 ja hieman myös nsp1 proteiinirakenteen havaitt avat ETGE-motiivin aminohapot pitävät interaktiota KELCH-proteiiniin joka sen tunnistaa kuin omsaa substraattia(NRF perheenjäsentä NRF2). Siitä voisi selvitä, miksi virus osoitaa paradoksaalista suojelevuutta jotakin soluorganellia kohtaan kuten tässä mitokondriaa kohtaan, vaikka se on aivan häikäilemätön solun tuman DNA:n tuholainen. NRF2:lle se antaa hetken vapauden koetaa autaa tilannetta, muta koska DNA tuhoutuu NRF2 ei kovin pitkään ehdi kohottaa antioksidanttistatusta- ehkä vain hetkeksi viruksen replikaation eduksi. Virus tarvitsee vain hetkisen sellaista suojaa.
Tämä tarkoittaa sitä, että ne proteiinit , joita KEAP1 (KLHL19) Kelch domaanin omaava proteiini) ehkä jokin muukin sen perheen proteiini kukaties, menettää otteensa omiin substraateihinsa, joita se on polyubikitinoiden säädellyt CUL3 kompleksin kautta, kun sars-2 virustekijät ottavat KEAP1:stä yliotteen sitoutuen KEAP1-NRF2 välisestä sofistisestä interaktiosta . Viruksen jotkin tai jokin tekijöistä omaa niitö tarvitavai tunusmerkkejä, motiivia ETGE (DxxTGE tai DEETGE) ja motiivia DLG , joita KEAP1 tarvitse sekä NRF2 molekyylin kiinnipitämis että irrottamissunuksina.
Näiden aminohappojen runsas esiintymä nsp1 ja nsp2 proteiinisekvensseissä viittaisi siihen että kelchdomaaniryhmästä havaitaan niitä niin paljon että virusproteiini voi häiritä KEAP1/NRF2 tunnistamista ja funktiota.
Tätä voi epäillä eri nsp tai ORF-proteiineista niiten rakenteesta etsimälläkaikki D-L-G ja E-T-G-E aminohapot. Esim niitä on nsp1 ja nsp2 sekvensseissä silmiinpistvän runsaasti ja jos lukee siten kaikki löytämäsnä perakanaa huomaa jotain experimentelliä avaimenetsintää viruksen taholta ja strategeinen pienikin mutaatio tai insertio voi rikastaa tätä laatua avaimen sopivuutta, tiirikkaa. Kun summatuloksen katsoo,niin siinäon kuin amplifioitua, sekoitettua koodia hajoitettuna sekvenssin mitalle paljonkin .
Samoja koodiaminohappoja on myös Marburgviruksen tekijässä mVP24, jolla on alue, tällä vastaavanlaisella aminohappopitoisuudella. Sitä ei ole Ebolalla siiä tekijässä Moni virus kiinnostuu KEAP1:stä. samoin ongogeenisistä molekyyleistä löytyy samaa ilmiötä . Esim FAM1291 proteiinissa näyttää olevan runsas valikoima noita vaadittuja aminohappoja.
Inga kommentarer:
Skicka en kommentar