| BA.4 | South_Africa 40.0%, United States of America 20.0%, United Kingdom 11.0%, Denmark 4.0%, Germany 4.0% | 2022-01-10 | 588design | 4902 assign. | Alias of B.1.1.529.4, from pango-designation issue #517 | Omicron |
| BA.4.1 | 570 design. |
0 assign. |
Alias of B.1.1.529.4.1, mainly found in South Africa, from pango-designation issue #548 | |||
| BA.4.1.1 | 49 design. |
0 assign. |
Alias of B.1.1.529.4.1.1, mainly found in South Africa and Germany, from pango-designation issue #667 |
Taiwanilta saaduissa sekvensseissä on yli80%:sti tunnusmerkkejä uudesta BA.2 alalinjasta. Viisi päiää siten se on saanut merkkipaalunsa ja märitelmänsä. Se opn BA.2.3.7. Siinä on yksi oma s-proteiinimutaationsa K97E , jonka taustana on nukleotidimuutos A21851G. Tätä varianttia löytyy myös turisteista, jotka ovat tulleet Taiwanilta, kuten Japanista ja Singaporesta. Myös samanrakenteista HongKong-varianttia on ja samoin on jokunen muualtakin kuten Canadasta, Australiasta, Espanjasta ja Saksasta.
Tästä on ollut keskustelua Github sivulla: Asiankäsittelynumero on #643.
https://github.com/cov-lineages/pango-designation/issues/643
Taiwanilla on tällä hetkellä paljon ilmatilaloukkauksia Kiinan ilmavoimien koneitten tunkeutuessa Taiwanin puolelle vähän väliä. Tilanne ehkä haittaa tavallista laboratoriotoiminnan joustavuutta.
Cov.lineage
| BA.2.3.7 | 20 design. | 0 assign. | Alias of B.1.1.529.2.3.7, mainly found in Japan, Hong Kong and Taiwan, from pango-designation issue #643 |
Koska BA.5.2 alalinja muodosti pitkää puuta, sen latvaa ensin merkattiin BA5.4, mutta nyt tehtiin siten että nimettiin se haara kuitenkin varsinaiseen BA.5.2 linjaan kuten tiedettiinkin jo alusta. Koska nimi tulisi taas hyvin pitkäksi ( B.1.1.529.5.2.1.1 eli BA.5.2.1.1), niin se on lyhennetty siten. että tuon BA.5.2.1 alalinjan koodiksi asetetaan F-kirjain, joten saadaan kätevä BF.1 nimi sen alalinjan alalinjalle.
Omikron on PANGOkoodilta B.1.1.529. Tämä voidaan merkata myös BA.
BA. 5 linja on omikronin viides päälinja. Se on siis alkunimeltä B.1.1. 529.5.
Tällä linjalla taas on alalinjoja, joita nykyään tutkitaan. Alalinjojakin sillä on ainakin viisi isohkoa ryhmää ja niillä alkaa olla omia alalinjoja.
Alalinja BA.5.2 (sama kuin B.1.1.529.5.2) tekee pitkää fylogeneettista puuta ja paljon haaroja. Sen ensimmäinen alalinja on BA.5.2.1 = B.1.1.529.5.2.1. Jos tämä sitten tarvitsee vielä omalle alalinjalle merkin, on kätevää lyhentää sen ylälinjan symboliksi vaikka F-kirjain kuten näyttää tehdyn:
Omikronin viidennen variantin BA.5 alalinjan (BA.5.2.) alalinjan (BA.5.2.1.) alalinja (BA.5.2.1.1.) näyttää nyt sievästi tällaiselta:
BF.1
Tämä BF.1 muodostaa oman kladin, sillä siinä on mutaatioita nsp16 peptidissä (V288F) ja nsp6 peptidissä (V289L). Tätä VOC-LUM varioanttia on löytynyt 154 ja niiden sekvenssien perusteella linja on määritelty ja se esiintyy PANGO-listoissa ja sitä monitoroidaan. Siitä kertoo asia #618.
| Lineage | Most common countries | Earliest date | # designated | # assigned | Description | WHO Name |
|---|---|---|---|---|---|---|
| BF.1 | 154 | 0 | Alias of B.1.1.529.5.2.1.1, mainly found in England, Denmark, Spain and Scotland, from pango-designation issue #618 |
| BA.2.44 | 149 designated |
0Assignated | Alias of B.1.1.529.2.44, mainly found in Belgium and Luxembourg, from pango-designation issue #613 | |||
| BA.2.45 | 438 | 0 | Alias of B.1.1.529.2.45, mainly found in Sweden and Denmark, from pango-designation issue #616 | |||
| BA.2.46 | 117 | 0 | Alias of B.1.1.529.2.46, mainly found in Scotland, from pango-designation issue #626 | |||
| BA.2.47 | 848 | 0 | Alias of B.1.1.529.2.47, mainly found in Denmark, England, and USA, from pango-designation issue #631 | |||
| BA.2.48 | 692 | 0 | Alias of B.1.1.529.2.48, mainly found in USA, Scotland and England, from pango-designation issue #634 | |||
| BA.2.49 | 670 | 0 | Alias of B.1.1.529.2.49, mainly found in France, England and USA, from pango-designation issue #640 | |||
| BA.2.50 | 548 | 0 | Alias of B.1.1.529.2.50, mainly found in Scotland and England, from pango-designation issue #641 | |||
| BA.2.51 | 310 | 0 | Alias of B.1.1.529.2.51, mainly found in Denmark, from pango-designation issue #644 | |||
| BA.2.52 | 240 | 0 | Alias of B.1.1.529.2.52, mainly found in Italy, Germany, Denmark and USA, from pango-designation issue #648 | |||
| BA.2.53 | 145 | 0 | Alias of B.1.1.529.2.53, mainly found in Denmark, from pango-designation issue #651 | |||
| BA.2.54 | 136 | 0 | Alias of B.1.1.529.2.54, mainly found in Germany, Spain and Denmark, from pango-designation issue #658 | |||
| BA.2.55 | 115 | 0 | Alias of B.1.1.529.2.55, mainly found in England, USA and Scotland, from pango-designation issue #660 |
