Leta i den här bloggen
tisdag 21 september 2010
West Nile Viruksen ( WNV) rakenne, Länsi-Niilin Virus
West Nile virus (WNV) is a member of the Flaviviridae, a plus-stranded virus family that includes St. Louis encephalitis virus, Kunjin virus, yellow fever virus, Dengue virus, and Japanese encephalitis virus.
WNV on Flaviviruksia, (+) ssRNA perhettä, johon kuuluu St. Louisin enkefaliittivirus, Kunjin virus, keltakuumevirus, Dengue virus ja Japanin enkefaliittivirus (JEV)
WNV was initially isolated in 1937 in the West Nile region of Uganda and has become prevalent in Africa, Asia, and Europe.
WNV löydettiin 1937 Länsi-Niilin alueelta Ugandasta ja sitten sitä on tavattu Afrikassa, Aasiassa ja Euroopassa.
WNV has rapidly spread across the United States through its insect host and causes neurological symptoms and encephalitis, which can result in paralysis or death.
WNV on levinnyt nopeasti kautta USA:n vektori-hyönteisen avulla ja aiheuttaa neurologisia oireita ja enkefaliittia, joka voi johtaa halvaukseen tai kuolemaan.
Since 1999 about 3700 cases of West Nile virus (WNV) infection and 200 deaths have been recorded in United States.
Vuodesta 1999 on rekisteröity 3700 WNV infektiota ja 200 kuolemaa USA:ssa.
The viral capsid protein likely contributes to the WNV-associated deadly inflammation via apoptosis induced through the mitochondrial pathway.
Viruksen kapsidiproteiini todennäköisesti osaltaan vaikuttaa WNV:hen liittyneen tappavan tulehduksen mitokondriaalisen tien kautta indusoituvalla apoptoosilla.
WNV particles (50 nm in diameter) consist of a dense core (viral protein C encapsidated virus RNA genome) surrounded by a membrane envelope (viral E and M proteins embedded in a lipid bilayer).
+RNA
C proteiini, capsidiproteiini
E proteiini, kalvoproteiini
M proteiini, kalvoporteiini
WNV-partikkeleissa on 50 nm tiheä ydin ( virusproteiini C:n sisäänsä kapseloima viruksen RNA-genomi) , jota ympäröi kalvovaippa (viruksen E ja M proteiineja asettuneena lipidikaksoiskerrokseen)
The virus binds to a specific cell surface protein (not yet identified), an interaction thought to involve E protein with highly sulfated heparan sulfate (HSHS) residues that are present on the surfaces of many cells and enters the cell by a process similar to that of endocytosis.
Virus sitoutuu spesifiseen pintaproteiiniin, jota ei ole vielä tunnistettu. Tässä interaktiossa on todennäköisesti mukana viraali E-proteiini ja vahvasti rikkipitoiset heparaanisultaattitähteet , joita on monien solujen pinnalla (HSHS) ja sitten virus menee solun sisään samantapaisella prosessilla kuin endosytoosi.
Once inside the cell, the genome RNA is released into the cytoplasm via endosomal release, a fusion process involving acidic pH induced conformation change in the E protein.
Kun virus on päässyt solun sisään, sen RNA-genomi vapautuu solun sytoplasmaan endosomin vapauttamana ja tämä fuusioprosessi käsittää happaman pH miljöön indusoiman struktuurin muutoksen E-proteiinissa.
The RNA genome serves as mRNA and is translated by ribosomes into ten mature viral proteins are produced via proteolytic cleavage, which include three structural components and seven different nonstructural components of the virus.
RNA genomi toimittaa sitten lähetti-RNA:n virkaa ja se luetaan (translatoidaan) ribosomien avulla kymmeneksi kypsäksi virusproteiiniksi proteolyyttisellä pilkkoutumisella ja näin saadaan viruksen kolme rakennekomponenttia ja seitsemän nonstrukturaalista viruskomponenttia.
These proteins assemble and transcribe complimentary minus strand RNAs from the genomic RNA.
Nämä proteiinit kokoontuvat ja transkriboivat komplementaarisen (-)säikeisen RNA:n genomisesta RNA:sta.
The complimentary minus strand RNA in turn serves as template for the synthesis of positive-stranded genomic RNAs.
Tämä komplementaarinen miinussäikeinen (-) ssRNA vuorostaan toimii templaattina uusien positiivisten genomisten (+)ssRNA säikeitten syntetisoimisessa.
Once viral E, preM and C proteins have accumulated to sufficient level, they assemble with the genomic RNA to form progeny virions, which migrate to the cell surface where they are surrounded with lipid envelop and released.
Kun viruksen E, preM ja C-proteiineja on kertynyt riittävästi, ne kokoontuvat genomisen RNA:n keralla muodostaen uuden virussukupolven, joka sitten migroituu solun pintaan ja saa siinä uutta lipidivaippaa ympärilleen ja vapautuu solusta.
Description: Description: Joseph Chuang, PhD
KUVA viruksesta on aika raflaava, ikäänkuin pinta olisi täynnä punaisia matoja.
West Nile Virus Structure cutaway graphic (on a white or black background). Web images measures 450 pixels across, original images are 3876 pixels across EXPLANATION OF WEST NILE VIRUS PICTURE:
West Nile Virus is a small (approx. 50 nm diameter) enveloped + single stranded RNA virus.
WNV virus on pieni, noin 50 nm läpimitaten, vaipallinen, (plus sense) ssRNA
It belongs to the family Flaviviridae (L. Flavus: yellow) named after Yellow Fever.
Se kuuluu Flaviviridae-perheeseen, joka ryhmä on saanut nimensä keltakuumeviruksesta. Flavus tarkoittaa keltaista.
The red worm-like objects covering the surface are the E (Envelope) Proteins. Punaiset matomaiset kuviot, jotka peittävät viruksen pinnan, ovat sen E-proteiinia.
In the mature virion, these exist as dimers with the two molecules in a "Yin-Yang" or "69" position.
Kypsässä virionissa nämä esiintyvät dimeereinä, jonka muodostaa kaksi Yin-Yang- tyyppisesti asettunutta molekyyliä (69).
The dimers are arranged in an ordered fashion over the surface of the virus (2, 3).
Dimeerit ovat asettautuneet järjestelmällisesti kautta viruksen pinnan.
The E proteins vary from type to type, as does the state of their glycosylation (9, 10, 11).
E-proteiinit vaihtelevat tyypistä toiseen kuten myös niitten glykosyloitumisaste.
The illustration above shows the virus with some of the E-Proteins removed to reveal the underlying membrane (bluish green).
Eräs kuvista osoitta viruksen pintaa jos E-proteiineja on poistettu. Alla on sinivihreä kalvo.
The E proteins are anchored into this by membrane spanning regions.
E-proteiinit ovat ankkuroituneena tämän kalvon kautta kulkevin jaksoin.
Also present are M (Membrane) proteins.
Viruksella on myös M-proteiineja eli kalvoproteiineja.
In this image, the E anchoring regions and the M-Proteins (and their transmembrane regions) look like little nails hammered into the membrane.
Eräs kuva esittää E- proteiinia ankkuroivan alueen ja M-proteiinit ja niiden transmembraanit alueet kuin pieniä kynsiä olisi kiinnittynyt kalvoon.
Beneath the membrane lies the icosahedral nucleocapsid (yellowish glow in middle) that contains the genetic material combined with C (Capsid) Protein.
Kalvon alla on ikosahedraalinen nukleokapsidi heijastaen kellahtava väriä , ja sen sisällä on geneettinen materiaali kapsidiproteiiniin kombinoituneena. .
Although generally described as spherical, electron micrographs of West Nile Viruses seem to show a clearly faceted virion.
Vaikka tätä virusta kuvattan yleensä pyöreänä, niin se kuitenkin näyttää elektronimikroskooppisesti omaavan selvästi erilaisia tasapintoja.
http://www.rkm.com.au/VIRUS/WEST-NILE-VIRUS/West-Nile-Virus.html
West Nile Virus tappoi Euroopassa ihmisiä
WNV virusta on tänä kesänä ollut kautta Euroopan. Romaniassa on neljä henkilöä kuollut sen aiheuttamaan infektioon. Heillä oli muitakin tauteja. Moskiitto levittää tautia. Siihen ei ole rokotetta.
RUOTSIN TARTUNTATAUTIEN VIRASTO tiedottaa:
www.smi.se
A 60-year-old woman, from the southeastern Constanta county, who also had hypertension and had suffered a stroke, is the fourth person to die in Romania from infection with the West Nile virus.
All four people who died were aged over 60 and had chronic illnesses.
West Nile virus infections have affected the whole of Europe this summer. The virus is transmitted in humans through mosquito-bites and is not transmitted directly between humans. There is no vaccine against the virus.
While infections are often without any symptoms, people are advised to see a doctor immediately if they suffer from fever, intense headaches, nausea, or abdominal, muscular or joint pains. West Nile infections may develop into meningitis or encephalitis, which could ultimately lead to death.
torsdag 16 september 2010
West Nile fever virus
Kyse on aika pöpperöisen näköisestä viruksesta.Kt.s kuva tästä FLAVI-viruksesta.
http://www.rkm.com.au/VIRUS/WEST-NILE-VIRUS/West-Nile-W-450.jpg
Tuon näköiset ovat pahanmaineisia.
Kerään tähän siitä enemmän tietoa.
- SUOMEN INFORMAATIO: Kansanterveyslaitoksen tietueista Tartuntatautien lääkärin kommenteista. West Nile -virusta Euroopassa, Venäjällä ja Israelissa (16.09.10)
Kreikan lisäksi ihmisillä on todettu tartuntoja Unkarissa, Romaniassa, Israelissa ja Venäjällä. Tilannetta seurataan myös Italiassa, jossa WNV-infektioita raportoitiin vuosina 2008 ja 2009 Emilia Romagnan ja Veneton alueilla. Vuoden 2010 elokuussa Venetossa on todettu yksi tapaus.
Virus tarttuu linnuista hyttysten välityksellä hevosiin ja ihmisiin.
WNV-tartunta aiheuttaa tyypillisesti vain lievän taudin tai voi olla oireeton. Tavallisia oireita ovat kuume, päänsärky ja lihaskivut.
Varsinainen aivotulehdus on harvinainen, mutta voi olla vakava, varsinkin iäkkäillä henkilöillä. Tartunnan mahdollisuus on todennäköisintä kesäkuusta lokakuuhun.
Hyttysiltä suojautuminen on paras tapa välttää tartunta.
Lisätietoja
ECDC, Epidemiological updates
Fitfortravel, News
- TIETOJA RUOTSISTA www.smi.se
tisdag 14 september 2010
Olevaiset lasten rokotukset
Ruotsin SMI.se rokotusten antamasta suojasta:
Skydd mot tio sjukdomar
De barnvacciner som erbjuds till alla barn inom barnhälsovård och skola ger skydd mot nio sjukdomar:
polio,
difteri,
stelkramp,
kikhosta,
infektioner orsakade av Haemophilus influenzae typ b,
mässling,
påssjuka
och röda hund
och allvarliga sjukdomar orsakade av pneumokocker.
Sen den 1 januari 2010 ingår även vaccination av flickor mot humant papillomvirus (HPV) i programmet.
I Sverige har vi idag inte allmän vaccination mot tuberkulos
eller hepatit B.
Dessa sjukdomar hålls istället under kontroll med så kallad riktad vaccination. Detta innebär att barn med ökad risk att bli smittade erbjuds vaccinering.
Tidpunkt för de olika vaccinationerna följer ett nyligen reviderat schema som gäller barn födda från 2002. Barn födda till och med år 2001 följer det tidigare schemat.
( Englantilaista yhteenvetoa=
The worldwide variation in vaccination schedules often induces questions about complementary vaccinations to children in migrating families.
Also the European vaccination programmes seem to differ widely, but there are in fact many similarities.
A two or three-dose priming schedule, with 1, 1 ? or 2 months interval within the three-dose schedule, is used for immunisation against
- diphtheria, difteri, kurkkumätä
- tetanus,stelkramp, jäykkäkouristus
- pertussis, kikhosta, hinkuyskä
- polio,
- Haemophilus influenzae type b
- and in many countries also against hepatitis B.
- In some countries hepatitis B vaccination is started at birth. An early booster at 10-24 months is also generally implemented, with very few exceptions.
- At least one additional booster dose against diphtheria and tetanus is recommended within the age intervals 4-7 or 11-18 years of age.
- Most countries also have scheduled boosters against polio and pertussis within these intervals.
- Nowadays all countries offer two doses of MMR (= mpr)The first dose is usually given at 12-18 months of age, while there is a wide age range for the second dose. A majority of countries give the second MMR at 3-9 years of age, five countries at 13-24 months whereas nine countries vaccinate at 9-13 years of age.
- measles, mässling, tuhkarokko
- mumps, parotit, sikotauti
- rubella, röda hund vihurirokko
Rose-Marie Carlsson, Leif Gothefors, Marta Granström 2008, Läkartidningen
tisdag 7 september 2010
DENGUE rokote olisi tarpeen (2009)
Main Category: Immune System / Vaccines
Also Included In: Tropical Diseases; Clinical Trials / Drug Trials
Article Date: 19 Feb 2009 - 0:00 PDT
- Sanofi Pasteur , rokoteosasto ilmoitti tetravalentin denguerokotteen alkaneen pediatrisen kliinisen vaiheensa Taimaassa. Tukimuksessa katsotaan, voisiko rokote antaa lapsille suojaa denguetautia vastaan. DENGUE on malarian jälkeen toisena kärjessä laajalle levinneissä trooppisissa taudeissa. Sanofi Pasteurin tetravalentti rokotekandidaatti on ensimmäinen, joka on saavuttanut kliinisten kokeitten tämän vaiheen.
- Sanofi Oasteur tekee yhteistyötä Taimaan Mahidolin yliopiston, kansanterveyslaitoksen ja PDVI:n kanssa Ratchaburin maakunnassa.
- Turvallisen ja tehokkaan denguerokotteen kehittelyssä tällaiset tutkimukset ovat tarpeen, sillä dengue koettelee ensikädessä lapsia., kerrottiin siellä trooppisen lääketieteen laitokselta.
- WHO:n periaatteita rokotetutkimuksen aloittamisessa noudatetaan dengue rokotteen globaaleissa kehittelyponnisteluissa.
- WHO on sitoutunut saamaan aikaan sellaista dengue -rokotetta, joka todellakin olisi hyödyksi lapsille taudin endeemisillä alueilla.
Tästä Sanofi Pasteurin denguerokotteen kliinisen tutkimuksen ohjelmasta. About Sanofi Pasteur dengue vaccine global clinical study program
- Sanofi Pasteur alkoi denguerokotteen kehittelyn 90- luvulla. Kliiniset tutkimukset kehitetyllä tetravalentilla kandidaatilla alkoi 2000 vaiheessa. USA:ssa tehdyissä tutkimuksissa immunisaatio kolmella annoksella Sanofi- Pasteurin tetravalenttia denguerokotetta loi seroneutralisoivan vasteen dengueviruksen neljää denguekuumetta aiheuttavaa serotyyppiä kohtaan 100 prosentissa aikuisia, jotka osallistuivat kokeisiin. Sanofi -Pasteurin rokotetutkimuksiin kuuluu myös kliiniset tutkimukset Meksikossa, Perussa ja Filippiineillä sekä lapsilla että aikuisilla.
Denguekuumeesta About dengue fever
- Denguekuumetta aiheuttaa moskiiton kantama virus, jossa on neljä eri tyyppiä 1-4. Ylipäätänsä virus on uhkana noin puolelle maailman väestöä. Vuosittain arviolta 230 miljoonaa ihmistä infektoituu dengueviruksesta . Kaksi miljoonaa, joista suurin osa on lapsia, kehkeyttää hemorrhagisen kuumeen, verenvuotokuumeen (DHF). Se on kärkisyitä Lounais-Aasiassa sairaalaan ottamiseen, mikä on valtava rasite lääkkeellisissä resursseissa.
- Denguekuumetta esiintyy lähinnä trooppisissa ja subtrooppisissa ilmastoissa ja se on leviämässä uusiin maailmanosiin vuosittain. WHO on varoittanut, että läntinen Tyynenmeren alue voi olla menossa kohti suurempaa denguepurkausta. Paraguaissa ja Keski-Idässä on äskettäisiä purkauksia.
- Sen lisäksi dengue iskee sellaisissa maissa kuin Australia ( Queensland) ja USA ( Puerto Rico, Texas- Mexikon raja, Hawaiji ja USA:n Tyynenmeren saaret. Melkoinen joukko kansaa, joka matkustaa endeemisillä alueilla, infektoituu joka vuosi.
Sanofi-Aventis, a leading global pharmaceutical company, discovers, develops and distributes therapeutic solutions to improve the lives of everyone. Sanofi-Aventis is listed in Paris (EURONEXT: SAN) and in New York (NYSE: SNY).
- Sanofi-Pasteur on tämän lääkeyhtiön rokoteosasto, joka tuottaa 1.6 biljoonaa rokoteannosta vuodessa ( 2008), mistä 500 miljoonaa ihmistä saa immunisaation kautta maapallon. Rokoteteollisuudessa tämä on maailman johtavia firmoja ja tarjoaa laajimman valikoiman rokotteita 20 eri infektiotautia vastaan.
- Yhtiön perinteinen pyrkimys elämää suojaavien rokotteitten kehittelyyn omaa yli vuosisataiset juuret. Sanofi Pasteur on suurin yhtiö, joka on omistautunut pelkästään rokotteille. Joka päivä tämä yhtiö investoi yli miljoona euroa tutkimukseen ja kehittelyyn.
Asian viitelista: References:
. WHO alarmed about the spread of dengue, http://www.wpro.who.int/media_centre/press_releases/pr_23072007.htm
WIKIPEDIA Dengue viruksesta, (+) ssRNA, FLAVIVIRUS
lördag 4 september 2010
SARS rokotteen kehittely
Tästä lähteestä tutkimuksia hamsterilla tänä vuonna 2010:
Biotechnol Prog. 2010 Jul 26. Generating stable chinese hamster ovary cell clones to produce a truncated SARS-CoV spike protein for vaccine development.
Lin SC, Leng CH, Wu SC. Institute of Biotechnology, Dept. of Life Science, National Tsing Hua University, Hsinchu 30013, Taiwan.
Yhteenvetoa
S-proteiini SARS-CoV viruksessa on tärkeä rokotteen kehittämisessä. Ollaan vielä aivan olennaisessa perustason ongelmatiikassa kaupallisen rokotteen kehittelyssä: stabiliteettiseikoissa.The spike (S) protein of the severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) is important for vaccine development.
Yksityiskohtia tämän glykoproteiinin(gp) tärkeästä jaksosta ja stabiliteettiominaisuudesta, mikä rokotteen kehittelyssä on olennainen seikka:
S(TR2) (an 88 kDa truncated SARS-CoV TW1 S protein carrying the S fragments S-74-253, S-294-739, and S-1129-1255) is capable of expressing a major form of glycoprotein as endo H-sensitive ( approximately 115 kDa) in CHO cells.
To establish stable expressing cell clones, we transfected CHO/dhFr-cells with the amplifiable vectors ISID (IRES-driven dhfr) and ISIZ (SV40-driven dhfr) to select stepwise MTX, and observed enhanced approximately 115 kDa glycoform generation through gene amplification.
Following stepwise MTX selection, we compared gene amplification levels between two vectors in engineered CHO cell chromosomes. These results confirm that the IRES-driven dhfr promoter generates greater gene amplification, which in turn enhances S(TR2) expression. Our results indicate that the approximately 115 kDa glycoform of S(TR2) protein was capable of increasing after gene amplification. The S(TR2) glycoform did not change between suspension and serum-free cultures, suggesting that the stable and amplified cell clones analyzed in this study have potential for producing homologous S(TR2) on a large scale. (c) 2010 American Institute of Chemical Engineers Biotechnol. Prog., 2010.
Onko rhinovirusrokote mahdollinen?
Wikipedia mainitsee, että rokote sitä vastaan on miltei mahdoton tehdä.
Vuodelta 1976 taustaa:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/176887
Vuodelta 2009
Tiedemiehet ponnistellevat rhinovirusrokotteen luomiseksi
www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/176887
Heidän nettiin asettamastaan yhteenvedosta saa hieman käsitystä siitä, missä vaiheessa ollaan tämän vyyhdin selvittämisessä. Otan sitaatin ja suomennan:
- Am J Epidemiol. 1976 Apr;103(4):345-54. Is a rhinovirus vaccine possible?
- Renewal of support for efforts to develop a rhinovirus vaccine seems justified in the light of newer epidemiologic and immunologic studies.
- The major contribution of RV to acute upper respiratory disease in all age groups but especially in young children emphasizes the public health importance of an effective vaccine.
Ensinnäkin joka alueessa tietyt serotyypit esiintyivät tiheämmin ja pinttyneemmin. Serotyypit vaikuttivat tunnistettujen infektioitten esiintymisosuuksiin ja täten ovat erityinen immunisaation kohde.
Toiseksi ajan myötä sellaiset serotyypit, joilla oli korkeammat numerot ( 56- 89) näissä RV isolaateissa, alkoivat lisääntyä ja samoin tyyppaamattomat tai mahdollisesti uudet serotyypit lisääntyivät. Tästä päätellään, että koko ajan muodostuu uusia serotyyppejä progressiivisen antigeenin vaihtumisen ( antigen shift) myötä
- Epidemiologic surveillance of RV infections in widely separated areas has identified two relevant phenomena. First, in each area, certain serotypes were more frequently encountered and tended to persist. Such "common" serotypes accounted for a disproportionate share of the infections recognized and, hence, constitute special targets for immunization. Second, a clear increase over time in the proportion of RV isolates representing higher numbered (types 56-89) serotypes or untypable strains (potentially new serotypes) suggests that new serotypes continue to emerge as the result of progressive antigenic shift.
- The common origin of the multitudinous RV serotypes so suggested is consistent with the extensive antigenic cross-relations which are becoming evident.
- Systematic cross-testing with monospecific antisera, especially when high titer sera are employed, has revealed an appreciable number of one-way and reciprocal relations
- Largely fortuitous observations of naturally or experimentally infected humans have revealed many additional cross-relations manifested by concurrent response to heterologous RV and presumably attributable to sensitizations resulting from prior RV infections.
- A model for this has been provided by rabbits immunized sequentially with different potent RV immunogens. Available information as displayed in figure 2 indicates that extensive cross-relations do exist and that sizeable groups of closely related serotypes may be identified. More intensive search for heterotypic response to infection of man coupled with selective use of the rabbit model should define the full extent and strength of cross-relations and identify completely the more closely related groups of serotypes as the basis for formulation of a broadly effective RV vaccine containing a limited number of serotypes
- The cross-relations described are based entirely on development of serum neutralizing antibody, the presence of which in man is clearly correlated with relative protection against infection and disease.
- While this protection may well prove to be mediated largely by concomitant nasal secretory antibody, it is not unreasonable to expect that the antigenic cross-relations also would be manifested in secretory antibody response.
- These important questions concerning secretory antibody can be best explored in a limited series of volunteer trials with selected cross-related RV serotypes in which homotypic and heterotypic protection could be correlated with serum and nasal secretory antibody.
- The state of current knowledge, as I view it, is sufficient to justify initiation of such trials at any time.
- Asetan vielä yhden viitteen