Huolestuttavat virusmuunnokset
Tällä hetkellä WHO:n nimeämiä VOC- eli variants of concern -linjoja on neljä:
- Alfa-muunnos (Britannian muunnos B.1.1.7)
- Beeta-muunnos (Etelä-Afrikan muunnos B.1.351)
- Gamma-muunnos (Brasilian muunnos P1)
- Delta-muunnos (Intian muunnos B.1.617.2.
THL seuraa näitä linjoja ja alueellisesti ilmeneviä uusia virusmuunnoksia ja raportoi niistä säännöllisesti tilannekatsaussivulla.
Laboratorion sekvensoinneissa virusmuunnoslinjat voidaan erottaa niin sanotusta villityypin viruksesta eli pandemian alkuvaiheen viruksista piikkiproteiinin mutaatioiden avulla, jotka ovat taulukossa mainitut tunnusomaiset mutaatiot S-geenissä.
| Muunnos | Vaihtoehtoiset nimet | Ensimmäiset havainnot | Tunnusomaiset mutaatiot S-geenissä |
|---|---|---|---|
| Alfa | ’Britannian muunnos’, B.1.1.7 ja B.1.1.7 + E484K, 20I/501Y.V1 | UK 09/2020 | H69/V70, 144, (E484K), N501Y, A570D, D614G, P681H, T716I, S982A, D1118H |
| Beeta | ’Etelä-Afrikan muunnos’, B.1.351, 20H/501Y.V2 | Etelä-Afrikka 08/2020 | D80A, D215G, L241/A242/L243, K417N, E484K, N501Y, D614G, A701V |
| Gamma | ’Brasilian P1 muunnos’, B.1.1.28.1, P1, 20J/501Y.V3 | Japani ja Brasilia 12/2020 | L18F, T20N, P26S, D138Y, R190S, K417T, E484K, N501Y, D614G H655Y, T1027I, V1176F |
| Delta
| ’Intian virusmuunnos’, B.1.617.2, 21A/S:478K | Intia 10/2020 | T19R, G142D, del157/158, L452R, T478K, D614G, P681R, D950N |
Alfa-muunnos (Britannian virusmuunnos)
Britanniasta löydettiin joulukuussa 2020 linjan B.1.1.7 virusmuunnos, joka on todennäköisesti kehittynyt syksyllä 2020. Alfa-muunnokseksi nimetyn viruksen mutaatiot ovat geenissä, joka sisältää viruksen pinnalla sijaitsevan piikkiproteiinin valmistusohjeen. Piikkiproteiinin avulla koronavirus tunkeutuu ihmisen soluihin.
On arvioitu, että tämä virusmuunnos tarttuu helpommin kuin aiemmin kiertäneet viruslinjat.
Alfa-muunnoksen arvioidaan aiheuttaneen valtaosan Britannian uusista todetuista koronavirustapauksista ja sitä on havaittu monessa maassa ympäri maailmaa. Virusmuunnosta on todettu Suomessa joulukuusta 2020 alkaen ja kuten useimmissa Euroopan maista, siitä on tullut myös Suomessa vallitseva koronaviruslinja.
Alfa-muunnoksesta käytetään eri yhteyksissä tieteellisiä nimiä B.1.1.7, 202012/01 ja 20B/501Y.V1.
Beeta-muunnos (Etelä-Afrikan virusmuunnos)
Etelä-Afrikassa havaittu viruslinja B.1.351 kehittyi todennäköisesti syksyllä 2020. Myös Beeta-muunnos sisältää mutaatioita geenissä, jossa on viruksen pinnalla sijaitsevan piikkiproteiinin valmistusohje. Beeta-muunnoksen S-geenin mutaatiot eroavat kuitenkin Alfa-muunnoksen mutaatioista.
On viitteitä siitä, että myös tämä virusmuunnos tarttuu aiempaa helpommin. Viruslinja on levinnyt useaan maahan ja sitä esiintyy myös Suomessa.
Beeta-muunnoksen tieteellisiä nimiä ovat B.1.351 ja 20C/501Y.V2.
Gamma-muunnos (Brasilian P1-virusmuunnos)
P1-linjan virusmuunnos havaittiin ensimmäisen kerran Japanissa Brasiliasta palaavilla matkailijoilla maahantulotestauksen yhteydessä joulukuussa 2020. Brasiliassa Amazonien alueella Gamma-muunnoksen ensimmäiset havainnot ovat marraskuulta. Sen osuus kaikista viruslinjoista alueella nousi nopeasti ja jo tammikuussa valtaosa sekvensoiduista näytteistä osoittautui Gamma-muunnoskeksi.
Vaikka tämä virusmuunnos ei ole läheistä sukua edellä mainituille virusmuunnoksille, on siihen syntynyt osittain samoja piikkiproteiinin mutaatioita kuin muihin VOC-linjoihin.
On viitteitä siitä, että Gamma-muunnos saattaa olla muita kantoja tartuttavampi. Ensimmäisen kerran sitä on todettu Suomessa helmikuussa 2021.
Gamma-muunnoksen tieteellisiä nimiä ovat P.1, B.1.1.28.1 ja 20J/501Y.V3.
Delta-muunnos (Intian virusmuunnos)
Linjan B.1.617.2 koronavirusmuunnos on syksyllä 2020 Intiassa ensimmäisen kerran havaittu ja siellä yleistynyt muunnos. Kolme alalinjaa B.1.617.1 (Kappa), B.1.617.2 (Delta) ja B.1.617.3 eroavat toisistaan sekä mutaatioprofiilin että maantieteellisen esiintyvyyden suhteen. Ainoastaan Delta-muunnosta pidetään nykyisen tiedon valossa huolestuttavana muunnoksena.
Delta-muunnoksen piikkiproteiinissa esiintyy useita mutaatioita, jotka ovat osittain samoja kuin muissa VOC- ja VOI-linjoissa havaitut mutaatiot. Näiden mutaatioiden yhteisvaikutusta koronavirusinfektioon tai vaikutusta koronavirusepidemiaan ei kuitenkaan tunneta, eikä voida luotettavasti ennustaa.
Delta-muunnosta on tavattu Suomessa ensimmäisen kerran maaliskuussa matkustamiseen liittyvissä tapauksissa.
WHO on nostanut Delta-muunnoksen (B.1.617.2) huolestuttavien virusmuunnosten joukkoon sen nykyisten tietojen mukaan suuremman tartuttavuuden ja leviämistehon takia. Tutkimus- ja seurantatietoa muunnoksen taudinaiheuttamiskyvystä, leviämistehosta ja torjuntakeinojen toimivuudesta on edelleen hyvin niukasti.
Tehostetun seurannan alaiset koronavirusmuunnokset
Tällä hetkellä WHO on nostanut kuusi koronavirusmuunnosta VOI-linjoiksi:
Zeta, Z, (P2); B.1.1.28.2.
Theta (P3); B.1.1.28.3.
Epsilon, E (B.1.427/B.1.429);
Eta, H (B.1.525);
Iota , I, (B.1.526) ja
Kappa, K (B.1.617).
Näiden lisäksi ECDC on listannut VOI-linjoiksi
B.1.620- ja
B.1.621-linjat.
THL seuraa tehostetusti näitä virusmuunnoksia ja Suomessa alueellisesti ilmeneviä uusia linjoja, mutta ei raportoi niistä säännöllisesti.
Inga kommentarer:
Skicka en kommentar