Kansanterveyslaitoksen antama tieto SARS2 viruksesta joka lmentyy Ruotsissa

Ruotsi Kansanterveyslaitos tutkii  tänne tulleiden viruksen kokogenomeistä  tänne  tulleet variantit ja niiden leviämiset:

 Ruotsissa on sekvensoitu täällä kertävä SARS2 virus ja siitä on päätelty, mistä virus on alkanut tänne levitä.  Kolme geneettistä ryhmää oli  viruksessa erotettavissa purkauksen alussa ja edelleen kaksi niistä jatkaa  leviämistään. Näissä geneettisissä ryhmissä on tiettyjä eroja niihin variantteihin, joita maahan tuli Italiasta ja Itävallasta, mikä vahvistaa oletuksen siitä, että virusta johtui  useasta sisäänntulosta    tänne Ruotsiin. Nyt vielä  voidaan  nähdä  kahden geneettisen ryhmän leviämistä  kausi-influenssaseurannan  yhteydessä tehdyistä sekvensoinneista. Kolmas ryhmä  tuli New - Yorkista päin.  Varhaisimman Aasiasta Eurooppaan tulleen  viruksen  varianttia  on löytynyt ruotsalaisesta materiaalista   vain  jokin yksittäinen  ja mahdollisesti  kaukoidän   variantti  on   katkaissut  täällä   leviämisensä.
   Raportti antaa  alustavaa tietoa Kansanterveyslaitoksen  jatkuvasti käynnissä olevasta ponnistelusta   karakterisoida  yhteiskunnassa kiertelevien SARS-2 koronavirusten  geneettisten   ryhmien kokogenomit.


Helgenomsekvensering av svenska SARS-CoV-2 som orsakar covid-19, del 2

Lyssna

Slutsatserna från rapport 1 stärks ytterligare. Tre genetiska grupper etablerade sig i Sverige vid utbrottets start, varav två fortsätter att spridas. Dessa genetiska grupper har vissa skillnader med de varianter av dem som importerades från Italien och Österrike, vilket stärker hypotesen vilket stärker hypotesen att ett flertal separata introduktioner skedde in i landet. Slutligen kan man fortsatt se spridning av två av de genetiska grupperna givet resultat från sekvensering av prover från sentinelövervakningen.
Rapporten är ett kunskapsunderlag som redovisar Folkhälsomyndighetens fortlöpande arbete att helgenomkarakterisera de olika genetiska grupperna av SARS-CoV-2 som cirkulerar i samhället. Detta för att stärka kunskapsläget kring viruset och dess möjliga utveckling samt för att bidra med en förmåga att upptäcka nyintroduktioner av viruset.

Detta är den första genetiska karakteriseringen av SARS-CoV-2 i Sverige. Den fokuserar på de genetiska grupper som identifierats i diagnostiken under den tidiga fasen av pandemins utbredning i Sverige och omfattar isolat från fall diagnosticerade under perioden 31 januari 2020 när landets första fall av covid-19 diagnosticerades, till och med den 15 mars 2020 då samhällssmitta av covid-19 hade konstaterats i Sverige.
Utifrån analysen av virus arvsmassa kan den smitta vi ser i landet så här långt, i huvudsak grupperas två eller tre genetiska grupper beroende på system. De genetiska grupper som identifieras i Sverige är samma som förekommer i den omfattande smittspridning som utvecklades under februari i Europa. En av de genetiska grupperna är även förekommande i den smittspridning som konstaterats i New York i slutet av februari och början av mars. Majoriteten av de genetiska grupper som finns rapporterade från de tidiga smittkedjorna, främst från Asien till Europa, kan endast påvisas med enstaka fall i det analyserade svenska materialet vilket indikerar att smitta från dessa genetiska grupper hittills inte fått någon omfattande spridning i Sverige och potentiellt brutits helt.