Mitä tekee SUMO2 proteomi HISV-1 infektion aikana?

LÄHDE:  PLoS Pathog. 2015 Jul 22;11(7):e1005059. doi: 10.1371/journal.ppat.1005059. eCollection 2015.

Analysis of the SUMO2 Proteome during HSV-1 Infection.

Sloan E¹, Tatham MH², Groslambert M¹, Glass M¹, Orr A¹, Hay RT², Everett RD¹.

 Kovalenttinen liittyminen SUMO-perheen proteiineihin on tärkeä mekanismi, jolla monien soluproteiinien funktiot säätyvät. 

Sumolaatio vaikuttaa  SOLUproteiinien vakauden kontrollia, proteiinien aktiviteetin ja paikallistumisen kontrollia ja se osallistuu transkription, geeni-ilmenemän, kromaatiinirakenteen, tumakuljetuksen ja RNA-aineenvaihdunnan säätelyyn. 

• Covalent linkage to members of the small ubiquitin-like (SUMO) family of proteins is an important mechanism by which the functions of many cellular proteins are regulated. Sumoylation has roles in the control of protein stability, activity and localization, and is involved in the regulation of transcription, gene expression, chromatin structure, nuclear transport and RNA metabolism. 

 SUMOlaatio linkkiytyy  sekä positiivisesti että negatiivisesti monen erilaisen viruksen  replikaatioon modifioimalla virusproteiineja; SUMOloitujen soluproteiinien  modulaatiolla on vaikuttaa infektoimisehokkuuteen. Tästä jälkimmäistä selvänä  esimerkkinä on HSV-1 virusvaikutus, koska tämä virus vähentää laaja-alaisesti solun SUMOloituja proteiineja  HSV-1-ubikitiiniligaasilla ICP0.

•  Sumoylation is also linked, both positively and negatively, with the replication of many different viruses both in terms of modification of viral proteins and modulation of sumoylated cellular proteins that influence the efficiency of infection. One prominent example of the latter is the widespread reduction in the levels of cellular sumoylated species induced by herpes simplex virus type 1 (HSV-1) ubiquitin ligase ICP0. 

 Herpes simplex-1 viruksen vaikuttama ICP0 aktiivisuus korreloi  solussa tapahtuvasta   antiviruspuolustusvasteesta vapautumiseen.  Aiemmat  tutkimukset ovat osoittaneet, että ICP0 on substraattivalinnaltaan spesifinen. Erittäin sensitiivisiä sille ovat eräät SUMOloidut proteiinit kuten  PML, kun taas eräs RanGAP on  täysin vastustuskykyinen. 

• This activity correlates with relief from intrinsic immunity antiviral defence mechanisms. Previous work has shown that ICP0 is selective in substrate choice, with some sumoylated proteins such the promyelocytic leukemia protein PML being extremely sensitive, while RanGAP is completely resistant.

 Tässä työssä tutkijat esittävät  SUMO2-proteomianalyysin HSV-1 viruksen aikana.  Mahdollisesti SUMOloituvista  877 lajista tutkijat identifioivat  123, joiden runsaus aleni 3- faktorilla tai enemmänkin tästä viruksesta (Arviointi  Western blot  ja expressioanalyyseillä). Tutkijat havaitsivat useita aiemmin kuvaamattomia ICP0-substraatteja, joiden hajoitus tapahtui  sellaisella mekanismilla johon  joko vaikuttaa tai ei vaikuta SUMOlaatio-  ja/tai SUMO2-interaktiomotiivi, joka on   ICP0:ssa. Monet näistä proteiineista ovat tunnettuja tai oletettuja osallistujia transkription säädössä, kromatiinin koostamisessa tai modifikaatiossa.  Näistä tuloksista  saadaan uutta oivallusta HSV-1 infektion tehokkuuteen mahdollisesti vaikuttavista mekanismeista ja isäntäsoluproteiineista.

•  Here we present a comprehensive proteomic analysis of changes in the cellular SUMO2 proteome during HSV-1 infection. Amongst the 877 potentially sumoylated species detected, we identified 124 whose abundance was decreased by a factor of 3 or more by the virus, several of which were validated by western blot and expression analysis. We found many previously undescribed substrates of ICP0 whose degradation occurs by a range of mechanisms, influenced or not by sumoylation and/or the SUMO2 interaction motif within ICP0. Many of these proteins are known or are predicted to be involved in the regulation of transcription, chromatin assembly or modification. These results present novel insights into mechanisms and host cell proteins that might influence the efficiency of HSV-1 infection.

PMID:

26200910

[PubMed - in process]

PMCID:

PMC4511656

Free PMC Article

• 
  

Herpesvirus HSV-1 Tegument proteiineista ( virusvaipan ja viruskapselin välisestä proteiinimateriaalista)

LÄHDE: 

Virus Res. 2009 Nov;145(2):173-86. doi: 10.1016/j.virusres.2009.07.007. Epub 2009 Jul 15.

 HSV-1 viruksen  tegmenttiproteiinien ( kapsidin kateproteiinit)  funktionaalinen  rooli (2009)

Functional roles of the tegument proteins of herpes simplex virus type 1. (2009)

Kelly BJ¹, Fraefel C, Cunningham AL, Diefenbach RJ.

Tiivistelmä suomeksi

 Herpesviruksen virionit, infektoivat partikkelit muodostuvat neljästä rakenteesta, DNA-ytimestä (core) , kapselista (capsid) , manttelin alaisesta kapsidia kattavasta  aineesta (tegument, tegmentum, kate- ellei aivan viruksen välttämätön eväslaukku) ja manttelista, virusvaipasta ( envelope). Kun on tehty geneettisiä, biokemiallisia ja proteomianalyysejä alfaherpesviruksista, on saatu viitettä siitä, että  manttelinalainen aines, kateaines tegument, sisältää  20 proteiinia. ( vuonna  2009) ( Huom.  Vuonna  2016 mainitaan olevan  49 soluproteiinia  kypsissä virion partikkelissa spektromnetrisin analyysein havaittuna). 

Historiallisesti ottaen  tegument- kuvatiin ensin  amorfisena, mutta lisääntyvän tiedon mukaan on viitettä siitä, että siinä oleva aines on viruksen koostamisvaiheessa jossain  järjestyksessä lisättävää materiaalia. Tässä otsikon työssä   valaistaan  tegument- proteiinien erilaisia tehtäviä - rakennetehtävän ohella-  sinä aikana kun herpesvirus replikoituu isäntäsoloun tuman puolella. Näitä erilaisia rooleja ovat :  kapselin kuljetus  sisäänmeno- ja ulostulovaiheessa, kapselin kohdentaminen tumaan, transkription,  translaation ja apoptoosin säätely ; DNA:n replikaatio, immuunimodulaatio; sytoskeletaalinen koostaminen;  kapselin ulossaanti tumasta; virionin täydellinen koostaminen ja sen lopullinen ulosvienti solusta. 

Abstract (2009)

Herpes virions consist of four morphologically distinct structures, a DNA core, capsid, tegument, and envelope. Tegument occupies the space between the nucleocapsid (capsid containing DNA core) and the envelope. A combination of genetic, biochemical and proteomic analysis of alphaherpes virions suggest the tegument contains in the order of 20 viral proteins, kapselin kohdennus tumaan,, transkription säätely, translaatiotoiminta ja apoptoosi, DNA.n replikaatio; immuunimodulaatio, sytoskeletaalinen koostaminen, kapsidin ulosvienti isäntäsolun tumasta ja viruksen koostaminen virioniksi ja lopullinen ulosvienti isäntäsolusta. 
Historically the tegument has been described as amorphous but increasing evidence suggests there is an ordered addition of tegument during assembly. This review highlights the diverse roles, in addition to structural, that tegument plays during herpes viral replication using as an example herpes simplex virus type 1. Such diverse roles include: capsid transport during entry and egress; targeting of the capsid to the nucleus; regulation of transcription, translation and apoptosis; DNA replication; immune modulation; cytoskeletal assembly; nuclear egress of capsid; and viral assembly and final egress.

PMID:

19615419

[PubMed - indexed for MEDLINE]

Herpes 1 viruksen globaali merkitys, relevanssi. WHO tieto

WHO tietoa Herpesviruksesta  HSV-1 ja HSV-2 
LÄHDE:  (suomennosta)
 http://www.who.int/mediacentre/news/releases/2015/herpes/en/
 Lisää tästä asiasta:
 http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs400/en/

Arviolta  kaksi kolmasosaa maailman väestöstä (67%) ,, alle 50-vuotiaista, on Herpse simplex 1-viruksen infektoimia, jten herpes simplex-1 viruksen kantaminen on lähinnä "normaliteetti", tavanomaista.
Herpes simplex-virus luokitellaan kahteen tyyppiin HSV1 ja HSV2 ja molemmat ovat  mitä infektoivimpia ja pinttyneimpiä. ne eivät poistu tuoltuaan kehoon.  HSV1 on yläpään virus ja HSV2 alapään virus ja tartunnat ovat vastaavat, joten informaatio ruven hoidosta on  tartuttamisen välttämiseksi.  uusien tietojen mukaan  myös HSV1 voi aiheutaa alapään infektiota. Näitäkin on diagnosoitu 140 miljoonaa. Jos hygieninen taso on hyvåä, harvempi lapsi saa herpeksen HSV-1  tyypin. . uusimpien argvioiden mukaan 15- 49 vuotiaista  500 miljoonalla on genitaaliherpes  HSV-1 tai HSV2. Kehitellään paikallisia antimikrobisidisiä lääkkeitä ja on ajateltu myös rokotetta.

• Globally, an estimated two-thirds of the population under 50 are infected with herpes simplex virus type 1

• News release

• 28 October 2015 ¦ GENEVA - More than 3.7 billion people under the age of 50 – or 67% of the population – are infected with herpes simplex virus type 1 (HSV-1), according to WHO’s first global estimates of HSV-1 infection published today in the journal PLOS ONE. 
• Herpes simplex virus is categorized into 2 types: herpes simplex virus type 1 (HSV-1) and herpes simplex virus type 2 (HSV-2). Both HSV-1 and HSV-2 are highly infectious and incurable. HSV-1 is primarily transmitted by oral-oral contact and in most cases causes orolabial herpes or “cold sores” around the mouth. HSV-2 is almost entirely sexually transmitted through skin-to-skin contact, causing genital herpes. 
• “Access to education and information on both types of herpes and sexually transmitted infections is critical to protect young people’s health before they become sexually active,” Dr Marleen Temmerman, Director of WHO’s Department of Reproductive Health and Research 
• The new estimates highlight, however, that HSV-1 is also an important cause of genital herpes. Some 140 million people aged 15-49 years are infected with genital HSV-1 infection, primarily in the Americas, Europe and Western Pacific. Fewer people in high-income countries are becoming infected with HSV-1 as children, likely due to better hygiene and living conditions, and are instead at risk of contracting it genitally through oral sex after they become sexually active. 
• “Access to education and information on both types of herpes and sexually transmitted infections is critical to protect young people’s health before they become sexually active,” says Dr Marleen Temmerman, Director of WHO’s Department of Reproductive Health and Research. 
• Large number of genital infections . In January, WHO estimated that 417 million people aged 15-49 years have HSV-2 infection, which causes genital herpes. Taken together, the estimates reveal that over half a billion people between the ages of 15-49 years have genital infection caused by either HSV-1 or HSV-2. 
• “The new estimates highlight the crucial need for countries to improve data collection for both HSV types and sexually transmitted infections in general,” says Dr Temmerman. Given the lack of a permanent and curative treatment for both HSV-1 and HSV-2, WHO and partners are working to accelerate development of HSV vaccines and topical microbicides, which will have a crucial role in preventing these infections in the future. Several candidate vaccines and microbicides are currently being studied.

Alueelliset  infektioarviot (vuonna 2012) 0-49 vuotiaitten herpesinfektioista. prevalenssi ja uudet tapaukset.

• Regional infection estimates

Estimates for HSV-1 prevalence by region among people aged 0-49 in 2012:

• Americas: 178 million women (49%), 142 million men (39%)
• Africa: 350 million women (87%), 355 million men (87%)
• Eastern Mediterranean: 188 million women (75%), 202 million men (75%)
• Europe: 207 million women (69%), 187 million men (61%)
• South-East Asia: 432 million women (59%), 458 million men (58%)
• Western Pacific: 488 million women (74%), 521 million men (73%)

Estimates of new HSV-1 infections among people aged 0-49 in 2012:

• Americas: 6 million women, 5 million men
• Africa: 17 million women, 18 million men
• Eastern Mediterranean: 6 million women, 7 million men
• Europe: 5 million women, 5 million men
• South-East Asia: 13 million women, 14 million men
• Western Pacific: 11 million women, 12 million men

 Taudin oireet

Herpes on koko iän infektio, kun se on tarttunut. Usein  sen antamat oireet ovat lievät tai se voi olla oireeton, mutta se havaitaan HSV-1 tai HSV-2 vasta-aineiden olemassaolosta veressä. On vaikea arvioida  taudinoireisten osuutta, koska oireet voivat olla niin  lieviä tai  niitä  ei edes tunnisteta herpekseksi. USA:ssa  viidellätoista prosentilla HSV-2 infektiota potevista (15- 49 v)  on ollut aiemmin genitaaliherpes. Jos se antaa oireita, yhden tai  useamman kivuliaan rakon alapäässä, voidaan rohtumaa  hoitaa antiviruslääkkeellä, mutta  alkuepisodin jälkeen voi oireita toistuvasti esiintyä.  HSV-1 on  harvemmin esiintyvä syy  kuin HSV-2. Taudin välittyminen on usein oireeton. Viruksella voi olla  merkitsevä  negatiivinen vaikutus  infektoituneen  henkiseen hyvinvointiin ja henkilökohtaisiin suhteisiin.

 Harvoin HSV-1 johtaa vakavaan tautiin kuten aivotulehdukseen tai  silmätulehdukseen.  Orolabiaalinen ( suussa ja huulissa esiintyvä) rupi vaikuttaa sosiaalista stigmaa ja voi aiheuttaa sen takia psyykkistä stressiä. Niillä henkilöillä, joilla immuunipuolustus on alentunut (kuten HIV-1 potilailla), HSV-1 voi aiheuttaa  vakavampia infektioita ja toistua useammin.

• Disease symptoms

• Herpes is a lifelong infection, which often has mild or no symptoms but can be detected by the presence of antibodies for HSV-1 or HSV-2 in the blood. It is difficult to determine the proportion of HSV-infected people worldwide who have symptomatic disease, as symptoms may be mild or simply not recognized as herpes. In the United States of America, about 15% of people with HSV-2 infection report a prior diagnosis of genital herpes. 
• When genital herpes symptoms do occur, they take the form of one or more painful genital or anal blisters or ulcers. Herpes symptoms can be treated with antivirals, but after an initial episode, symptoms can recur. Recurrences of genital herpes due to HSV-1 are generally much less frequent than for HSV-2. 
• Transmission of HSV most often occurs without symptoms. The virus can have a significant negative impact upon an infected person’s mental wellness and personal relationships. 
• People with orolabial herpes symptoms may face social stigma, and can experience psychological distress as a result. In people with weak immune systems, such as those with advanced HIV infection, HSV-1 can have more severe symptoms and more frequent recurrences. Rarely, HSV-1 infection can also lead to more serious complications such as encephalitis or ocular disease.

WHO:n nykyinen toiminta herpesvirusongelman suhteen  

WHO on tällä hetkellä kehittelemässä globaalin terveydenhoidon sektoristrategiaa  STI-tautien suhteen  ja niihin sisällytetään HSV-1 ja HSV-2. Tämän selvittelyn odotetaan valmistuvatn  EHO:n 69.  kokoukseen World health Assembly 2016.

• WHO

• WHO is currently working on the development of a global health sector strategy for sexually transmitted infections (STIs), including for HSV-1 and HSV-2, to be finalized for consideration at the 69th World Health Assembly in 2016.

LÄHDETIETO WHO, Dr Margaret Harris

Dementian differentiaalidiganostiikkaan apua. CSF merkitsijät HIV-1-infektiosta. Uusi väitöskirja

KRUT Jan Jessen. On Cerebrospinal Fluid Biomarkers of HIV-1 Infection.
ISBN: 978-91-628-9664-5.
 http://hdl.handle.net/2077/40449
Tämä  teesi pitää asettaa kahteen blogiin: Muisti-blogiin ja Uutta viruksista -blogiin tänään 11.12. 2015

Ebola-sairaanhoitajan taistelu. ebolaviruksen reinfektio

http://www.bbc.com/news/uk-scotland-34483584

Uusi väitöskirja (Mellberg T. 28.5. 2015): HIV-1 latenssista ja pinttyneestä säiliöaitioitumisesta

Uusi väitöskirja HIV-1 viruksesta. Väitöstilaisuus Göteborgissa 28.5. 2015

Mellberg Thomas. On Hiv-1 latency and viral reservoirs.

ISBN 978-91-628-9376-7.

Abstraktin suomennosta .

HIV-1 virus pystyttää itselleen latentin infektion, joka on hoidon saavuttamattomissa soluperäisissä ja anatomisissa reservoaareissa, säiliöaitioissa. Tässä väitöstyössä käsitellään useita problemaattisia aiheita tästä HIV-1 viruksen pinttyneisyydestä ja tavoista, miten mitata ja monitoroida sekä matalapitoista virusta että säilövän aition tyhjenemistä. Koska keskushermostojärjestelmä (CNS) on mahdollinen tärkeä anatominen säiliöaitio, työssä tutkitaan HIV-1 taudissa ilmenevän neurologisen vaurion laajuutta.

Aiemmista tutkimuksista saadut tulokset viittaavat siihen, että lepäävien T CD4 (+) imusolujen säiliö ja jäännösviremian pitoisuudet alenivat hoidettaessa laskimonsisäisellä immunoglobuliinilla (IVIG) antiretroviraaliin terapiaan (cART) kombinoiden. Tutkijaryhmä analysoi T-soluaktivaation merkitsijät ja IVIG lääkityksen mahdolliset pitkäaikaisvaikutukset jäännösviremiaan. He totesivat, että jäännösviremiaan ei ollut mitään kestävää vaikutusta, mikä viittasi siihen, että IVIG tehosi vain ohimenevästi

Jäännösviremian ja säiliöaitioiden koon asianmukaiset oikeat mittaukset ovat kriittisen tärkeitä kokeissa, joissa pyritään juurtamaan pois HIV-1 ja saattaa niille olla muutakin kliinistä hyötykäyttöä. Metodien oli oltava sensitiivisiä ja alatyypeistä riippumattomia. Tutkijat arvioivat erään menetelmän (COBAS Taq Man HIV-1- test) modifikaation, version 2.0 sekä PCR- menetelmän, jolla mitataan HIV-1 kokonais-DNA. He saivat tehtyä plasmassa olevan HIV-1 viruksen RNA:n herkän kvantitatiivisen määrittämisen tavalla, jota voitaisiin käyttää jäännösviremian mittaamisessa. He demonstroivat myös perifeerisen veren mononukleaarisista soluista tehtävän herkän kvantitatiivisen HIV-1 viruksen kokonais-DNA:n mittauksen; molemmat menetelmät olivat alatyypeistä riippumattomia.

Matalapitoinen viremia (= jäännösvirustaakka 20 -1000 kopiota millilitrassa) potilailla, joilla on kombinoitu antiretrovirusterapi (cART), korreloi virologisen epäonnistumisen kohonneeseen riskiin. Tutkijaryhmä arvioi erään käytetyn sekvensointimenetelmän matalapitoisen viremian tapauksessa. Tämä metodi oli herkkä ja myös alatyypistä riippumaton, mistä johtuen se on hyödyllinen kliinisissä asetelmissa, joissa on alatyyppien erilaisuutta.

HIV-1 saa aikaan kroonisen infektion, joka myös infiltroituu keskushermostoon ja tuo mukanaan neurologisten oireiden kehittymisen riskin. Tutkijat halusivat määrittää HIV-1 taudissa ilmenevän neurologisen vaurion asteen ja neuropatogeneesin mittaamalla neurofilamenttien kevyen proteiinin (NFL) ja aivoselkäydinnesteen (CSF) tulehdusmerkitsijöitten pitoisuuksia. He havaitsivat, että aivoselkäydinnesteessä NFL pitoisuudet kohosivat niin oireellisissa potilaissa kuin neurologisesti oireettomissakin potilaissa. Hoidolla nämä pitoisuudet alenivat, mutta hoidetuilla potilailla oli edelleen korkeampia pitoisuuksia kuin kontrolleilla, mikä viittaa siihen, että on joko jatkuvaa virukseen korreloituvaa vaurioitumista tai HIV-1 infektion vanhettavan kaltaista vaikutusta.

Suom. 28.5. 2015

Uusi HPAI lintuvirus maailmassa entisten Human -Avian-. Interfaasissa olevien lisäksi.Yleinen ekonominen vaikutus.

http://www.dn.se/nyheter/sverige/agglos-scramble-kan-bli-verklighet-i-usa/
u
Uuden H5N8 viruksen lähtökohta on Kazakstan,  jonne FAO ottaa yhteyksiä.  Asia vaikuttaa siksi, koska joudutaan  kasseeraamaan paljon siipikarjaa, lähinnä kanoja, mutta myös kalkkunoita (USA noteeraa tällä tavalla).
H5N1 on pandemisessa alert- vaiheessa ihmiskunnassa ja asia nielee  rokotuskehittelyvaroja.