Erikoinen BA.2.3 saltaatiolinja havaittu (nimetty: DD.1). Kolme nukleotidien tuplamuutosta spikeproteiinissa

 Alalinjojen koodauksessa ollaan jo  DD.1  linjassa alias BA.1.1.529.2.3.21.1 

https://github.com/cov-lineages/pango-designation/issues/1287

BA.2.3 Saltation lineage with several mutations (inc Spike R346T, Y449N, N460K, N481K and Q493L) from Philippines and Australia #1287

Näitä sekvenssejä havaittiin 7 kappaletta Flippiineiltä ja  kaksi Australiasta.  Vain yhdestä linjasta on todettu piikkiproteiinista  kolmet   tuplamutaatiot aiemmin (XBB.1.3). 

Tällä tuplamutaatiolla tarkoitetaan     aminohapponuutoksina  kahta peräkkäistä mutaatiota   jostain alkuperäisen  Wuhan variantin  aminohapposekvenssistä (wt , wild type referenssi).

 Nämä  kolme  muutosta kolme päivää sitten  designaationsa saaneessa   DD.1  linjassa  ovat  

V213 G ja jatkomuutos  E aminohapoksi. ( Siis  V213E havaitaan)

G339D jatkomuutos  komuutos N aminohapoksi. (G339N havaitaan)

Q493 R ja jatkomuutos L-aminohapoksi.    (Q493L havaitaan).

cvejris commented Nov 3, 2022

This lovely lineage has double nucleotide changes at three Spike AAs. The order of mutations (wt→BA.2→this):
213: V→G→E
339: G→D→N
493: Q→R→L
Among all designed BA.2 lineages, 3 DNCs are present only in XBB.1.3