Cell Mol Life Sci. 2016 Oct;73(19):3733-44. doi: 10.1007/s00018-016-2215-0. Epub 2016 Apr 19.
Ebola virus encodes a miR-155 analog to regulate importin-α5 expression.Suomennosta abstraktista: Abstract
Vuonna 2014 alkanut Ebolapurkaus niitti yli 10 000 ihmistä. Nykytieto sopivista lääkkeisä, kliinisistä diagnostisista biomarkkereista ja molekulaarisista mekanisemista joko puuttuu tai on riittämätöntä.
Tutkijat seuloivat neljästä virulentista lajista genomisten säikeiden runkosilmukoitten rakenteet ja löysivät uuden, oletetun virus-miR-prekursorin, jota Ebolavirus spesifisesti ilmentää. miRNA-prekursorisekvenssi varmistettiin jatkotutkimuksissa käymällä läpi olemassaolevaa RNA-seq-tietuetta. Prediktiivisiä oli kaksi kypsää miR proteiinia ja ne arvioitiin ihmissolulinjoissa. Tämä prediktiivisen mikroRNA.n oli komboituna kohteeseen, joka tunnistettiin importiini-alfa5:ksi, sen kohdeproteiiniksi. Tutkijat arvelevat, että tämä miR voisi nopeuttaa viruksen tekemää isäntäkehon immuunijärjestelmän evaasiota. Lisäksi tämä mikroRNA saattaisi olla kliininen terapeuttinen kohde tai diagnostinen Ebolaviruksen merkitsijä.
Tutkijat seuloivat neljästä virulentista lajista genomisten säikeiden runkosilmukoitten rakenteet ja löysivät uuden, oletetun virus-miR-prekursorin, jota Ebolavirus spesifisesti ilmentää. miRNA-prekursorisekvenssi varmistettiin jatkotutkimuksissa käymällä läpi olemassaolevaa RNA-seq-tietuetta. Prediktiivisiä oli kaksi kypsää miR proteiinia ja ne arvioitiin ihmissolulinjoissa. Tämä prediktiivisen mikroRNA.n oli komboituna kohteeseen, joka tunnistettiin importiini-alfa5:ksi, sen kohdeproteiiniksi. Tutkijat arvelevat, että tämä miR voisi nopeuttaa viruksen tekemää isäntäkehon immuunijärjestelmän evaasiota. Lisäksi tämä mikroRNA saattaisi olla kliininen terapeuttinen kohde tai diagnostinen Ebolaviruksen merkitsijä.
- The 2014 outbreak of Ebola virus caused more than 10,000 human deaths. Current knowledge of suitable drugs, clinical diagnostic biomarkers and molecular mechanisms of Ebola virus infection is either absent or insufficient. By screening stem-loop structures from the viral genomes of four virulence species, we identified a novel, putative viral microRNA precursor that is specifically expressed by the Ebola virus. The sequence of the microRNA precursor was further confirmed by mining the existing RNA-Seq database. Two putative mature microRNAs were predicted and subsequently validated in human cell lines. Combined with this prediction of the microRNA target, we identified importin-α5, which is a key regulator of interferon signaling following Ebola virus infection, as one putative target. We speculate that this microRNA could facilitate the evasion of the host immune system by the virus. Moreover, this microRNA might be a potential clinical therapeutic target or a diagnostic biomarker for Ebola virus.
Inga kommentarer:
Skicka en kommentar