Leta i den här bloggen

söndag 29 december 2013

DENGUE rokotekehittelyn nykyvaihe 2013

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23758699
  J Biomed Sci. 2013 Jun 13;20:37. doi: 10.1186/1423-0127-20-37. Current progress in dengue vaccines.

TIIVISTELMÄ (Abstract)

  • Dengue on  tärkeimpiä leviäviä vektorivälitteisiä virustauteja. Dengue -virusta (DENV) on neljä eri serotyyppiä ja jokainen niistä pystyy aiheuttamaan itsestään rajoittuvan denguekuumeen ( dengue fever, DF) tai jopa henkeäuhkaavan hemorrhagisen denguekuumeen (DHF) tai dengueshokkioireyhtymän ( DSS).

Dengue is one of the most important emerging vector-borne viral diseases. There are four serotypes of dengue viruses (DENV), each of which is capable of causing self-limited dengue fever (DF) or even life-threatening dengue hemorrhagic fever (DHF) and dengue shock syndrome (DSS).
  • Pääasiallisin vaikean  denguevirusinfektion kliininen esiintymismuoto on  verisuonten  läpivuoto, verihiutaleitten vähäisyys ja verenvuoto, eikä taudin  mekenismia ole vieläkään ratkaistu.  Viruksen suorien vaikutusten lisäksi dengueoireitten kehittymiseen osallistuu myös immunopatologiset  aspektit. 

The major clinical manifestations of severe DENV disease are vascular leakage, thrombocytopenia, and hemorrhage, yet the detailed mechanisms are not fully resolved. Besides the direct effects of the virus, immunopathological aspects are also involved in the development of dengue symptoms. 
  • Vaikka vieläkään ei ole pätevää  denguerokotetta,  on kuitenkin kehitteillä useita rokote-ehdokkaita. Niissä on  elävää heikennettyä virusta sisältäviä rokotteita, elävää kimeeristä virusrokotetta, inaktivoitua virusta sisältävää rokotetta ja elävää rekombinanttirokotetta, DNA:ta ja alayksikköjä sisältäviä rokotteita
 Although no licensed dengue vaccine is yet available, several vaccine candidates are under development, including live attenuated virus vaccines, live chimeric virus vaccines, inactivated virus vaccines, and live recombinant, DNA and subunit vaccines. 
  •  Kliinisessä  arvioinnissa on parhaillaan elävää heikennettyä virusta sisältävä rokote ja elävää kimeeristä virusta sisältävä rokote . Toiset rokoteet on arvioitu  prekliinisissä eläinmalleissa tai niitä on   valmiina  kliinisten kokeitten aloitamiseksi.
The live attenuated virus vaccines and live chimeric virus vaccines are undergoing clinical evaluation. The other vaccine candidates have been evaluated in preclinical animal models or are being prepared for clinical trials.
  •  Dengue-rokotteitten turvallisuuden ja tehokkuuden suhten  on otettava huomioon myös  mahdolliset immunopatologiset komplikaatiot kuten denguetaudin vasta-ainevälitteinen pahenema  ja  autoimmuniteetti. 

 For the safety and efficacy of dengue vaccines, the immunopathogenic complications such as antibody-mediated enhancement and autoimmunity of dengue disease need to be considered.

Päivitys 29.12. 2013 

söndag 22 december 2013

CIRCOVIRIDAE, Genus Circovirus. uusi Cyclovirus 2010

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3810929/

ANELLOVIRUS , Torque teno-virusta löytyy kontaminoidusta juomavedestä

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23412718

Selvittelynalainen virus ANELLOVIRUS

otin  tämän kirjan sen takia lainaan joululoman ajaksi, koska  en tiedä tästä aiheesta yhtään mitään.
TT Viruses-The Still Elusive Human Pathogens  on kirjan nimi. Tämä kuuluu Springerin sarjaan Current Topics in Microbiologys and Immunology. ISBN 978-3-540-70971-8.

 Katsauksen toimittajat ovat Ethel-Michele de Villiers, Harald zur Hausen Editors.  Kirja on julkaistu 2009.

 Fylogeneettistä ja taksonomista  pohdintaa: Aiemmin ja nykyään. Miten ANELLOVIRUS suku luotiin?

TT-viruksia luonnehdittiin ensimmäisen kerran  1997. Tämän ryhmän virusten määrä alkoi sitten paisua tutkimusten myötä kymmenessä vuodessa, niin että Geenipankissa oli  huhtikuuhun 2008 mennessä jo  yli 200 täydellistä sekvenssiä identifioituna ihmisistä ja useista Nämä kaikki olivat  viruksia joilla oli rengasmuotoinen DNA-genomi.  eläinlajeista.

Sellaisia syklisen ssDNA:n omaavia viruksia  on luonnehdittu monista ( ei- ihmis-)  isännistä, eläimistä, kasveista, bakteereista jo kauan ennenkuin löytyi inäitä anelloviruksia.ESIM:

  •  Virukset jotka infektoivat bakteereita  ryhmitetään kahteen virusperheeseen: 
INOVIRIDAE ( Suku Inovirus ja suku Plectrovirus)
ja MICROVIRIDAE ( suvut Bdellomicrovirus, Chlamydiamicrovirus, Microvirus ja Spiromicrovirus) (2005)
Inovirukiksilla ja microviruksilla on monopartiitti genomi.
  • Virukset jotka infektoivat kasveja 
GEMINIVIRIDAE (neljä sukua: Genera  Begomovirus, Curtovirus, Mastrevirus, Topocuvirus
Näillä  on monopartiitti tai bipartiitti genomi ja ambisense organisaatio).
NANOVIRIDAE (kaksi sukua:  Genera Babuvirus, Nanovirus)
(Näillä on genomissa 6- 10 osaa ja se esiintyy unisense organisaatiossa).
  • CIRCOVIRIDAE perheen jäsenet infektoivat  eläimiä kuten lintuja tai sikalajeja ja ne jaetaan taksonomisesti kahteen sukuun.
Genus Circovirus:  Tähän kuuluu esim sian circovirus , porcine circovirus 1, PCV-1.
Genus  Gyrovirus , kuten  kananpojan anemiavirus, Chicken anaemia virus CAV (2005).


  • Genus  ANELLOVIRUS

Jo varhain kun oli löydetty näitä anelloviruksia, havaittiin niiden  biofysikaalinen ja molekulaarinen  eroavuus muista yllämainituista ryhmistä  ja näin  alettiin  luoda niille omaa perhettä. Mutta koska niitä vielä oli suhteellisen rajoitetusti, luotiin  yksinäinen Genus, suku Anellovirus, joka oli  tarkemmin luokittelematon edelleen. Tämä tapahtui  vuonna 2001.
Anello sana otettiin latinasta ja se tarkoitaa rengasta. Täten se erottui musita  syklisen DNA:n omaavista  viruksista ( circoviridae) . Siihen aikaan tiedettiin olevan seuravat anelloviirukset: TTV ja TTMV.
TT virus, joka sai  nimensä potilastapauksesta  (ja sanoista transfusion transmitted) sai  nimen Torque teno virus (TTV) .  Torque  tulee myös latinasta ja tarkoitaa kaulaketjua ja teno tarkoittaa ohutta.  Tällä  kuvataan  sen DNA- genomin ohutta syklistä yksisäikeistä  hahmoa. 
 Vastaavasti  TT-viruksen kaltainen minivirus  sai nimen Torque teno mini virus (TTMV). 
Anellovirusisolaatteja  alettiin tästedes merkata  TTV:n kaltaisiksi tai TTMV:n kaltaisiksi isolaateiksi. 
Näin  saatiin  alkuun virusperheen  ANELLOVIRUSES  luokittelu. (2005)  Vaikkakin  pidettiin asianmukaisempana luoda  ensin  GENUS  ANELLOVIRUS, koska  muista TTV:n kaltaisista viruksista ei ollut vielä  koossa  tietoa  paljoakaan. Saatiin kuitenkin identifioitua   laaja-alaista  geneettistä diversiteettiä myös TTV:n TTMV:n ja eläimistä eristettyjen viruskantojen kesken. 
  • Mikä on  tilanne  2009?

  Anellovirusten diversiteetti on jatkuvassa evoluutiossa. 
Löydetään uusit TTV:n kaltaisia  muotoja. 
Looginen nimitys olisi nyt ANELLOVIRIDAE
ja siinä seuraavat 9- 10 sukua niemttynä tilapäisesti vaikka näin:
Alfatorquevirus
Beetatorquevirus
Gammatorquevirus
jne 
Tyyppilajeja tunnetaan yli 40.  Tarkempaa nimitystä luonnollisesti  koetetaan ajan myötä saada tehtyä. Näitä löytyy kyllä internetistä. Tärkeää on havaita, mikä merkitys kullakin  anelloviruksella on ihmiselle. Ja ylipäätänä onko tämä Anelloviridae- järjestelmä  jotakin ihmiskunnalle essentielliä, koska sitä on 90%.ssa aikuisista. Lapsi syntyessään ei tuo mukanaan  mitään äidiltä perittyä  anellovirusta, vaan niitä sitten alkaa ilmetä.
http://jid.oxfordjournals.org/content/early/2013/09/11/infdis.jit423.abstract




Eräs Anellovirus, SEN- virus

 SEN- VIRUS.  "VERENSIIRTOVÄLITTEISEN VIRUKSEN"  EPIDEMIOLOGIAA JA LUONNEHDINTAA. Otan tämän erikseen, jota saa jonkinlaista käsitystä tällaisestakin  viraalista geneettisestä materiaalista.

Transfusion. 2005 Jul;45(7):1084-8. SEN virus: epidemiology and characteristics of a transfusion-transmitted virus.Akiba J, Umemura T, Alter HJ, Kojiro M, Tabor E. Author information
  • SEN- virus tarttuu verestä. . Se on vaipaton ja sillä on   yksisäikeinen DNA. Vaikka sen prevalenssi vaihtelee alueittain, niin sitä on havaittu  jopa 30%.lla leikkauksen jälkeisen  verensiirron  saaneista potilaista verrattaessa niihin potilaihin (3%)  jotka eivät  tarvinneet postoperatiivista verensiirtoa.

SEN virus (SEN-V) is a blood-borne, single-stranded, nonenveloped DNA virus. Although its prevalence varies by geographic region, it has been detected in as many as 30 percent of postoperative transfusion recipients, compared to 3 percent of postoperative patients who did not receive transfusions.
  •  Merkitsevää assosiaatiota on myös havaittu verensiirtovolyymin ja SEN-virusinfektion kesken. Tarttuminen verensiirron välityksellä on vahvistunut myös siitä havainnosta, että  verenluovuttajan ja veren siirron saajan  seerumien  SEN-virusten  keskeinen homologian aste  on 99%.
A significant association has been observed between transfusion volume and the occurrence of SEN-V infection. Transmission by transfusion also has been confirmed by the detection of greater than 99 percent homology between SEN-V in donor and recipient sera.
  •  On dokumentoitu myös kilpailevia infektioita    kuten SEN- viruksen, hepatiitti B-viruksen, hepatiitti C- viruksen ja  HIV- 1-virusten aiheuttamia infektioita.  Tällaiset havainnot viittaavat  näitten virusten kuten SEN- viruksenkin välittyvän  verensiirron kautta. 
 Concurrent infections with SEN-V and hepatitis B virus, hepatitis C virus, or human immunodeficiency virus type 1 have been documented, and these observations probably reflect the blood-borne transmission of these viruses as well as SEN-V. 
  • Vaikka SEN-virus alunperin löydettiinkin etsittäessä  syitä verensiirron jälkeiseen  hepatiittiin , ei ole kuitenkaan mitään näyttöä siitä, että SEN-virus aiheuttaisi hepatiittia tai pahentaisi samanaikaisen maksasairauden kulkua. Siitä huolimatta SEN- virus näyttää välittyvän verensiirrossa ja  sen tulevaisesta roolista tarvitaan  tutkimuksilla saatavaa lisävalaistusta.
Although SEN-V was discovered as part of a search for causes of posttransfusion hepatitis, there is no firm evidence so far that SEN-V infection either causes hepatitis or worsens the course of coexistent liver disease. Nevertheless, SEN-V appears to be transmitted by transfusion, and further studies may reveal more about its role in the future.

KOMMENTTI: Katsokaapa Anellovirusten tarkkaa systeemiä, jonne tämä SEN- virus sijoittuu. :http://eol.org/pages/11605601/names



NCBI Taxonomy
view in classification
Species