Medicina (B Aires). 2010;70(6):518-523. Molecular characterization of severe and mild cases of influenza A (H1N1) 2009 strain from Argentina.
Baumeister E, Palacios G, Cisterna D, Solovyov A, Hui J, Savji N, Bussetti AV, Campos A, Pontoriero A, Jabado OJ, Street C, Hirschberg DL, Rabadan R, Alonio V, Molina V, Hutchison S, Egholm M, Lipkin WI.
Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas, ANLIS Dr. Carlos G. Malbrán, Buenos Aires, Argentina.
Suomennosta abstraktista
Kun maailmanlaajuinen pandeminen ensi aalto riehui 2009 oli yleinen mortaliteetti ( case fatality rate) 0.4%, mutta Argentiinassa vastaava indikaattori oli 4.5% . Tätä selviteltäessä analysoitiin 34 näytettä sekä lievää muotoa että vaikeaa muotoa influenssaa.
While worldwide pandemic influenza A(H1N1) pdm case fatality rate (CFR) was 0.4%, Argentina's was 4.5%. A total of 34 strains from mild and severe cases were analyzed.
Koko genomisekvenssi selvitettiin 26 viruksesta ja muista 8 viruksesta tehtiin osittaiset sekvenssit.
A full genome sequencing was carried out on 26 of these, and a partial sequencing on the remaining eight.
Tutkijat eivät löytäneet mitään tietellistä näyttöä siitä, että korkea CFR indeksi johtuisi suoranaisesta viruksen muuntumisesta.
We observed no evidence that the high CFR can be attributed to direct virus changes.
Ei havaittu tapahtuneen uudelleen järjestäytymisiä( antigeenin vaihtumisia, antigen shift) geneettisessä materiaalissa, ei mutaatioita, jotka olisivat yhteydessä antiviruslääkeresistenssiin, eikä pistemutaatioita ( genetic drift), jotka osaltaan vaikuttaisivat virulenssiin
No evidence of re-assortment, mutations associated with resistance to antiviral drugs, or genetic drift that might contribute to virulence was observed.
Viimeiset ukrainalaiset ja norjalaiset raportit vaikeista tapauksissa olivat liittyneet mutaatioon D225G ( aspartaatti 225 glysiiniksi) . Tätä ei havaittu argentiinalaisissa viruskannoissa. Niissä taas havaittiin S206T, eli HA reseptorin sitoutumiskohdan ympäristössä seriini 260 oli muuttunut threoniiniksi, mitä on myös maailmanlaajuisesti osoitettu.
Although the mutation D225G associated with severity in the latest reports from the Ukraine and Norway is not observed among the Argentine strains, an amino acid change in the area (S206T) surrounding the HA receptor binding domain was observed, the same previously established worldwide.
PMID: 21163739 [PubMed - as supplied by publisher]